Added vertices position restoration

Samo Penic

2016-02-24 8fa1c00fb99a94d41606d8e870c563194160154d

Added vertices position restoration

 src/restore.c

@@ -13,8 +13,8 @@

ts_bool parseDump(char *dumpfname) {
    xmlDocPtr doc;
    xmlNodePtr cur;
    ts_vesicle *vesicle;
    xmlNodePtr cur, cur1,cur2;
    ts_vesicle *vesicle=NULL;

    doc = xmlParseFile(dumpfname);
    
@@ -37,7 +37,28 @@
        if ((!xmlStrcmp(cur->name, (const xmlChar *)"trisurf"))){
            vesicle=parseTrisurfTag(doc, cur);
        }
		 
        // START Point Position data &  Bonds
        if ((!xmlStrcmp(cur->name, (const xmlChar *)"UnstructuredGrid"))){
            cur1 = cur->xmlChildrenNode;
            while(cur1!=NULL){
                if ((!xmlStrcmp(cur1->name, (const xmlChar *)"Piece"))){
                    cur2=cur1->xmlChildrenNode;
                    while(cur2!=NULL){
                        if ((!xmlStrcmp(cur2->name, (const xmlChar *)"Points"))){
                            fprintf(stderr,"Found point data\n");
                            if(vesicle!=NULL)
                                parseXMLVertexPosition(vesicle, doc, cur);
                        }
                        if ((!xmlStrcmp(cur2->name, (const xmlChar *)"Cells"))){
                        fprintf(stderr,"Found cell(Bonds) data\n");
                        }
                        cur2=cur2->next;
                    }	
                }
                cur1 = cur1->next;
            }
        }
        // END Point Position data & Bonds
    cur = cur->next;
    }
    
@@ -48,6 +69,9 @@
    return TS_SUCCESS;
}



/* this is a parser of additional data in xml */
ts_vesicle *parseTrisurfTag(xmlDocPtr doc, xmlNodePtr cur){
    fprintf(stderr,"Parsing trisurf tag\n");
    xmlNodePtr child;
@@ -194,3 +218,32 @@
    return TS_SUCCESS;
}


/* this is a parser of vertex positions and bonds from main xml data */
ts_bool parseXMLVertexPosition(ts_vesicle *vesicle,xmlDocPtr doc, xmlNodePtr cur){
    xmlNodePtr child = cur->xmlChildrenNode;
    xmlChar *points;
    char *pts;
    int i, idx;
    char *token[3];
    while (child != NULL) {
        if ((!xmlStrcmp(child->name, (const xmlChar *)"DataArray"))){
            points = xmlNodeListGetString(doc, child->xmlChildrenNode, 1);
            pts=(char *)points;
            for(i=0;i<3;i++)    token[i]=strtok(pts," ");
            idx=0;
            while(token[0]!=NULL){
                vesicle->vlist->vtx[idx]->x=atof(token[0]);
                vesicle->vlist->vtx[idx]->y=atof(token[1]);
                vesicle->vlist->vtx[idx]->z=atof(token[2]);
                for(i=0;i<3;i++)    token[i]=strtok(NULL," ");	
                idx++;
            }
            xmlFree(points);
        }
        child=child->next;
    }
    return TS_SUCCESS;
}



 src/restore.h

@@ -6,4 +6,5 @@
ts_bool parseTrisurfVtxn(ts_vertex_list *vlist, xmlDocPtr doc, xmlNodePtr cur);
ts_bool parseTrisurfTria(ts_vesicle *vesicle, xmlDocPtr doc, xmlNodePtr cur);
ts_bool parseTrisurfTristar(ts_vesicle *vesicle, xmlDocPtr doc, xmlNodePtr cur);
ts_bool parseXMLVertexPosition(ts_vesicle *vesicle,xmlDocPtr doc, xmlNodePtr cur);
#endif