Added triangle reconstruction and tristar assignment

Samo Penic

2016-02-24 a011d2d078cf65c97d70b31435b90c294ce6aec4

Added triangle reconstruction and tristar assignment

 src/restore.c

@@ -9,6 +9,8 @@
#include <zlib.h>
#include "vesicle.h"
#include "vertex.h"
#include "triangle.h"

ts_bool parseDump(char *dumpfname) {
    xmlDocPtr doc;
    xmlNodePtr cur;
@@ -100,7 +102,13 @@
        if ((!xmlStrcmp(child->name, (const xmlChar *)"vtxn"))){
            parseTrisurfVtxn(vesicle->vlist, doc, child);
        }
		 
        if ((!xmlStrcmp(child->name, (const xmlChar *)"tria"))){
            parseTrisurfTria(vesicle, doc, child);
        }
         if ((!xmlStrcmp(child->name, (const xmlChar *)"tristar"))){
            parseTrisurfTristar(vesicle, doc, child);
        }

    child = child->next;
    }

@@ -109,7 +117,11 @@
    return vesicle;
}

ts_bool *parseTrisurfVtxn(ts_vertex_list *vlist, xmlDocPtr doc, xmlNodePtr cur){


/* Low level tags parsers */

ts_bool parseTrisurfVtxn(ts_vertex_list *vlist, xmlDocPtr doc, xmlNodePtr cur){

    xmlChar *chari;
    xmlChar *neighs;
@@ -136,3 +148,49 @@
    return TS_SUCCESS;
}

ts_bool parseTrisurfTria(ts_vesicle *vesicle, xmlDocPtr doc, xmlNodePtr cur){
    xmlChar *triangles;
    char *tria;
    char *vtx[3];
	
    ts_uint i;
    triangles = xmlNodeListGetString(doc, cur->xmlChildrenNode, 1);
    tria=(char *)triangles;
    for(i=0;i<3;i++)    vtx[i]=strtok(tria," ");
    while(vtx[2]!=NULL){
        triangle_add(vesicle->tlist, vesicle->vlist->vtx[atoi(vtx[0])],vesicle->vlist->vtx[atoi(vtx[1])],vesicle->vlist->vtx[atoi(vtx[2])]);
        for(i=0;i<3;i++)    vtx[i]=strtok(NULL," ");
    }	

    xmlFree(triangles);
    return TS_SUCCESS;
}


ts_bool parseTrisurfTristar(ts_vesicle *vesicle, xmlDocPtr doc, xmlNodePtr cur){

    xmlChar *chari;
    xmlChar *tristar;
    char *t;
    char *token;
    ts_uint neighi;
    ts_uint i;
    chari = xmlGetProp(cur, (xmlChar *)"idx");
    i=atoi((char *)chari);
    xmlFree(chari);
    ts_vertex *vtx=vesicle->vlist->vtx[i];
    tristar = xmlNodeListGetString(doc, cur->xmlChildrenNode, 1);
//    fprintf(stderr,"Found tristar for vtx %u that seems to have index %u with tristar=%s\n",i,vtx->idx,tristar);

    t=(char *)tristar;
    token=strtok(t," ");
    while(token!=NULL){
        neighi=atoi(token);
        //fprintf(stderr,"%u", neighi);
        vertex_add_tristar(vtx,vesicle->tlist->tria[neighi]);
        token=strtok(NULL," ");
    }	
    xmlFree(tristar);
    return TS_SUCCESS;
}


 src/restore.h

@@ -3,5 +3,7 @@

ts_bool parseDump(char *dumpfname);
ts_vesicle *parseTrisurfTag(xmlDocPtr doc, xmlNodePtr cur);
ts_bool *parseTrisurfVtxn(ts_vertex_list *vlist, xmlDocPtr doc, xmlNodePtr cur);
ts_bool parseTrisurfVtxn(ts_vertex_list *vlist, xmlDocPtr doc, xmlNodePtr cur);
ts_bool parseTrisurfTria(ts_vesicle *vesicle, xmlDocPtr doc, xmlNodePtr cur);
ts_bool parseTrisurfTristar(ts_vesicle *vesicle, xmlDocPtr doc, xmlNodePtr cur);
#endif