Prepared skeleton for cluster counting routines

Samo Penic

2016-07-03 69a174c6050ac0b88b8add7ffc19cce38f2170f9

 src/general.h

@@ -1,3 +1,4 @@
/* vim: set ts=4 sts=4 sw=4 noet : */
#ifndef _GENERAL_H
#define _GENERAL_H

@@ -259,6 +260,9 @@
   long int nfil;
   long int nfono;
   long int R_nucleus;
   ts_double R_nucleusX;
   ts_double R_nucleusY;
   ts_double R_nucleusZ;
   long int pswitch;
    long int constvolswitch;
    long int constareaswitch;
@@ -306,9 +310,25 @@
   ts_int pswitch;
    ts_tape *tape;
   ts_double R_nucleus;
   ts_double R_nucleusX;
   ts_double R_nucleusY;
   ts_double R_nucleusZ;
   ts_double nucleus_center[3];
    ts_double area;
} ts_vesicle;



typedef struct{
   ts_uint nvtx;
   ts_uint idx;
   ts_vertex **vtx;
} ts_cluster;

typedef struct{
   ts_uint n;
   ts_cluster **cluster;
} ts_cluster_list;


/* GLOBAL VARIABLES */
@@ -338,4 +358,11 @@
#define VTX(n) &(vlist->vtx[n])
#define VTX_DATA(n) vlist->vtx[n].data


/* FOR PID GENERATION ROUTINE */
#define CPF_CLOEXEC 1

int createPidFile(const char *progName, const char *pidFile, int flags);

int lockRegion(int fd, int type, int whence, int start, int len);
#endif