Trisurf Monte Carlo simulator
mihaf
2014-03-21 402e8f59c31856000c303e2527f80917422760df
src/tape
@@ -4,23 +4,35 @@
# dmax is the max. bond length (in units l_min)
dmax=1.7
# bending rigidity of the membrane (in units kT)
xk0=1.0
xk0=10.0
# max step size (in units l_min)
stepsize=0.15
# Pressure calculations
# (pswitch=1: calc. p*dV energy contribution)
pswitch = 0
# pressure difference: p_inside - p_outside (in units l_min^3/kT):
pressure=0.0
# pressure difference: p_inside - p_outside (in units kT/l_min^3):
pressure = -10.0
####### Polymer definitions ###########
####### Polymer (brush) definitions ###########
# npoly is a number of polymers attached to npoly distinct vertices on vesicle
npoly=0
# nmono is a number of monomers in each polymer
nmono=10
# Spring constant between monomers of the polymer
k_spring=800
####### Filament (inside the vesicle) definitions ###########
# nfil is a number of filaments inside the vesicle
nfil=1
# nfono is a number of monomers in each filament
nfono=300
# Persistence lenght of the filaments (in units l_min)
xi=100
####### Nucleus (inside the vesicle) ###########
# Radius of an impenetrable hard sphere inside the vesicle
R_nucleus=5
#######  Cell definitions ############
nxmax=60
@@ -30,11 +42,11 @@
####### Program Control ############
#how many MC sweeps between subsequent records of states to disk
mcsweeps=50
mcsweeps=10000
#how many initial mcsweeps*inititer MC sweeps before recording to disk?
inititer=1
inititer=0
#how many records do you want on the disk iteration are there in a run?
iterations=10
iterations=5000
#shut up if we are using cluster!!!