Trisurf Monte Carlo simulator
mihaf
2014-03-21 402e8f59c31856000c303e2527f80917422760df
Little add.
2 files modified
14 ■■■■ changed files
src/poly.c 4 ●●●● patch | view | raw | blame | history
src/tape 10 ●●●● patch | view | raw | blame | history
src/poly.c
@@ -108,8 +108,8 @@
    else
    {
    /* Make filaments inside the vesicle. Helix with radius... Dist. between poly vertices put to 1*/
        dphi = 2.0*asin(1.0/2.0/vesicle->R_nucleus)*1.01;
        dh = dphi/2.0/M_PI*1.01;
        dphi = 2.0*asin(1.0/2.0/vesicle->R_nucleus)*1.001;
        dh = dphi/2.0/M_PI*1.001;
        for(i=0;i<poly_list->n;i++){
            for (j=0;j<poly_list->poly[i]->vlist->n;j++){
                ji = j + i*poly_list->poly[i]->vlist->n;
src/tape
@@ -12,7 +12,7 @@
# (pswitch=1: calc. p*dV energy contribution)
pswitch = 0
# pressure difference: p_inside - p_outside (in units kT/l_min^3):
pressure=0.0
pressure = -10.0
####### Polymer (brush) definitions ###########
# npoly is a number of polymers attached to npoly distinct vertices on vesicle
@@ -26,9 +26,9 @@
# nfil is a number of filaments inside the vesicle
nfil=1
# nfono is a number of monomers in each filament
nfono=30
nfono=300
# Persistence lenght of the filaments (in units l_min)
xi=0
xi=100
####### Nucleus (inside the vesicle) ###########
# Radius of an impenetrable hard sphere inside the vesicle
@@ -42,11 +42,11 @@
####### Program Control ############
#how many MC sweeps between subsequent records of states to disk
mcsweeps=300
mcsweeps=10000
#how many initial mcsweeps*inititer MC sweeps before recording to disk?
inititer=0
#how many records do you want on the disk iteration are there in a run?
iterations=30
iterations=5000
#shut up if we are using cluster!!!