Trisurf Monte Carlo simulator
Samo Penic
2016-03-02 7f607660a91b969daa19dbdb62628691bfee8f7e
commit | author | age
7f6076 1 /* vim: set ts=4 sts=4 sw=4 noet : */
d7639a 2 #include<stdlib.h>
SP 3 #include "general.h"
4 #include "cell.h"
f74313 5 #include "frame.h"
ea1cce 6
3de289 7
SP 8 #include "triangle.h"
d7639a 9 ts_bool centermass(ts_vesicle *vesicle){
3a018d 10     ts_uint i,j, n=vesicle->vlist->n;
f74313 11     ts_vertex **vtx=vesicle->vlist->vtx;
d7639a 12     vesicle->cm[0]=0;
SP 13     vesicle->cm[1]=0;
14     vesicle->cm[2]=0;
f74313 15     for(i=0;i<n;i++){
8f6a69 16         vesicle->cm[0]+=vtx[i]->x;
SP 17         vesicle->cm[1]+=vtx[i]->y;
18         vesicle->cm[2]+=vtx[i]->z; 
d7639a 19     } 
dac2e5 20     vesicle->cm[0]/=(ts_float)n;
SP 21     vesicle->cm[1]/=(ts_float)n;
22     vesicle->cm[2]/=(ts_float)n;
919555 23
SP 24     for(i=0;i<n;i++){
25         vtx[i]->x-=vesicle->cm[0];
26         vtx[i]->y-=vesicle->cm[1];
27         vtx[i]->z-=vesicle->cm[2]; 
28     } 
58230a 29 //move polymers for the same vector as we moved vesicle
3a018d 30     for(i=0;i<vesicle->poly_list->n;i++){
M 31         for(j=0;j<vesicle->poly_list->poly[i]->vlist->n;j++){
32             vesicle->poly_list->poly[i]->vlist->vtx[j]->x-=vesicle->cm[0];
33             vesicle->poly_list->poly[i]->vlist->vtx[j]->y-=vesicle->cm[1];
34             vesicle->poly_list->poly[i]->vlist->vtx[j]->z-=vesicle->cm[2];
35         }
36     }
58230a 37 //move filaments for the same vector as we moved vesicle
M 38     for(i=0;i<vesicle->filament_list->n;i++){
39         for(j=0;j<vesicle->filament_list->poly[i]->vlist->n;j++){
40             vesicle->filament_list->poly[i]->vlist->vtx[j]->x-=vesicle->cm[0];
41             vesicle->filament_list->poly[i]->vlist->vtx[j]->y-=vesicle->cm[1];
42             vesicle->filament_list->poly[i]->vlist->vtx[j]->z-=vesicle->cm[2];
43         }
44     }
3a018d 45
58230a 46     vesicle->cm[0]=0.0;
M 47     vesicle->cm[1]=0.0;
48     vesicle->cm[2]=0.0;
a63f17 49
3de289 50     for(i=0;i<vesicle->tlist->n;i++){
SP 51         triangle_normal_vector(vesicle->tlist->tria[i]);
52     }
53
54
d7639a 55     return TS_SUCCESS;
SP 56 }
57
f74313 58 ts_bool cell_occupation(ts_vesicle *vesicle){
48bb92 59     ts_uint i,j,cellidx, n=vesicle->vlist->n;
d7639a 60
f74313 61     cell_list_cell_occupation_clear(vesicle->clist);
SP 62     for(i=0;i<n;i++){
63     cellidx=vertex_self_avoidance(vesicle, vesicle->vlist->vtx[i]);
a63f17 64 //    already done in cell_add_vertex
SP 65 //    vesicle->vlist->vtx[i]->cell=vesicle->clist->cell[cellidx];
d7639a 66
f74313 67     cell_add_vertex(vesicle->clist->cell[cellidx],vesicle->vlist->vtx[i]);
d7639a 68     }
48bb92 69
58230a 70 //Add all polymers to cells
48bb92 71     for(i=0;i<vesicle->poly_list->n;i++){
M 72     for(j=0;j<vesicle->poly_list->poly[i]->vlist->n;j++){
73         cellidx=vertex_self_avoidance(vesicle, vesicle->poly_list->poly[i]->vlist->vtx[j]);
74         cell_add_vertex(vesicle->clist->cell[cellidx],vesicle->poly_list->poly[i]->vlist->vtx[j]);
75     }
76     }
58230a 77 //Add all filaments to cells
M 78      for(i=0;i<vesicle->filament_list->n;i++){
79     for(j=0;j<vesicle->filament_list->poly[i]->vlist->n;j++){
80         cellidx=vertex_self_avoidance(vesicle, vesicle->filament_list->poly[i]->vlist->vtx[j]);
81         cell_add_vertex(vesicle->clist->cell[cellidx],vesicle->filament_list->poly[i]->vlist->vtx[j]);
82     }
83     }
84    
48bb92 85
d7639a 86     return TS_SUCCESS;
SP 87 }