Restoration of vertex neighbors completed.

Samo Penic

2016-02-24 487968538b6902a8c102531f5ee60db1c757c219

Restoration of vertex neighbors completed.

 python/.parse_vtu.py.swp

Binary files differ

 src/restore.c

@@ -8,6 +8,7 @@
#include <snapshot.h>
#include <zlib.h>
#include "vesicle.h"
#include "vertex.h"
ts_bool parseDump(char *dumpfname) {
    xmlDocPtr doc;
    xmlNodePtr cur;
@@ -47,6 +48,9 @@

ts_vesicle *parseTrisurfTag(xmlDocPtr doc, xmlNodePtr cur){
    fprintf(stderr,"Parsing trisurf tag\n");
    xmlNodePtr child;

#ifdef COMPRESS
    /* base64decode */
    size_t cLen;
    /*size_t tLen;
@@ -78,6 +82,7 @@
    fprintf(stderr,"%s\n",subtree);
    
    free(subtree);
#endif
    /*parse xml subtree */
    xmlChar *nvtx, *npoly, *nfono;
    nvtx = xmlGetProp(cur, (xmlChar *)"nvtx");
@@ -89,5 +94,45 @@
    xmlFree(nvtx);
    xmlFree(npoly);
    xmlFree(nfono);

    child = cur->xmlChildrenNode;
    while (child != NULL) {
        if ((!xmlStrcmp(child->name, (const xmlChar *)"vtxn"))){
            parseTrisurfVtxn(vesicle->vlist, doc, child);
        }
		 
    child = child->next;
    }



    return vesicle;
}

ts_bool *parseTrisurfVtxn(ts_vertex_list *vlist, xmlDocPtr doc, xmlNodePtr cur){

    xmlChar *chari;
    xmlChar *neighs;
    char *n;
    char *token;
    ts_uint neighi;
    ts_uint i;
    chari = xmlGetProp(cur, (xmlChar *)"idx");
    i=atoi((char *)chari);
    xmlFree(chari);
    ts_vertex *vtx=vlist->vtx[i];
    neighs = xmlNodeListGetString(doc, cur->xmlChildrenNode, 1);
    //fprintf(stderr,"Found neigh for vtx %u that seems to have index %u with neighs=%s\n",i,vtx->idx,neighs);

    n=(char *)neighs;
    token=strtok(n," ");
    while(token!=NULL){
        neighi=atoi(token);
        //fprintf(stderr,"%u", neighi);
        vtx_add_neighbour(vtx,vlist->vtx[neighi]);
        token=strtok(NULL," ");
    }	
    xmlFree(neighs);
    return TS_SUCCESS;
}


 src/restore.h

@@ -3,5 +3,5 @@

ts_bool parseDump(char *dumpfname);
ts_vesicle *parseTrisurfTag(xmlDocPtr doc, xmlNodePtr cur);

ts_bool *parseTrisurfVtxn(ts_vertex_list *vlist, xmlDocPtr doc, xmlNodePtr cur);
#endif

 src/snapshot.h

@@ -8,7 +8,7 @@
    ts_uint beg;
} ts_string;

#define COMPRESSION
//#define COMPRESSION

ts_bool xml_trisurf_data(FILE *fh, ts_vesicle *vesicle);
ts_bool xml_trisurf_header(FILE *fh, ts_vesicle *vesicle);