Changes in main loop. It allows setting inner, outer loop and initial mc sw...

Samo Penic

2013-11-04 d7a113d890064e18aa9f4267c33ac71348c6ba98

 src/timestep.c

@@ -6,6 +6,26 @@
#include "timestep.h"
#include "vertexmove.h"
#include "bondflip.h"
#include "frame.h"
#include "io.h"
ts_bool run_simulation(ts_vesicle *vesicle, ts_uint mcsweeps, ts_uint inititer, ts_uint iterations){
   ts_uint i, j;

   centermass(vesicle);
   cell_occupation(vesicle);
   ts_fprintf(stdout, "Starting simulation (first %d x %d MC sweeps will not be recorded on disk)\n", inititer, mcsweeps);
   for(i=0;i<inititer+iterations;i++){
      for(j=0;j<mcsweeps;j++){
         single_timestep(vesicle);
      }
      centermass(vesicle);
      cell_occupation(vesicle);
      if(i>inititer){
         write_vertex_xml_file(vesicle,i-inititer);
      }
   }
   return TS_SUCCESS;
}

ts_bool single_timestep(ts_vesicle *vesicle){
    ts_bool retval;