Added poly information to tape& parsing function. Also, poly_list is freed ...

Samo Penic

2013-12-07 a2db521649cdcdfef3bdf6b306e05228a01498c0

 src/io.c

@@ -9,6 +9,7 @@
#include <sys/types.h>
#include <dirent.h>
#include "initial_distribution.h"
#include "poly.h"

ts_bool print_vertex_list(ts_vertex_list *vlist){
   ts_uint i;
@@ -295,7 +296,7 @@


ts_vesicle *parsetape(ts_uint *mcsweeps, ts_uint *inititer, ts_uint *iterations){
    long int nshell=17,ncxmax=60, ncymax=60, nczmax=60;  // THIS IS DUE TO CONFUSE BUG!
    long int nshell=17,ncxmax=60, ncymax=60, nczmax=60, npoly=10, nmono=20;  // THIS IS DUE TO CONFUSE BUG!
    char *buf=malloc(255*sizeof(char));
    long int brezveze0=1;
    long int brezveze1=1;
@@ -304,6 +305,8 @@
   long int iter=1000, init=1000, mcsw=1000;
    cfg_opt_t opts[] = {
        CFG_SIMPLE_INT("nshell", &nshell),
        CFG_SIMPLE_INT("npoly", &npoly),
        CFG_SIMPLE_INT("nmono", &nmono),
        CFG_SIMPLE_FLOAT("dmax", &dmax),
        CFG_SIMPLE_FLOAT("xk0",&xk0),
        CFG_SIMPLE_FLOAT("stepsize",&stepsize),
@@ -335,6 +338,8 @@
   *inititer=init;
   *mcsweeps=mcsw;
   vesicle=initial_distribution_dipyramid(nshell,ncxmax,ncymax,nczmax,stepsize);
   vesicle->poly_list=init_poly_list(npoly,nmono, vesicle->vlist);

    vesicle->nshell=nshell;
    vesicle->dmax=dmax*dmax;
    vesicle->bending_rigidity=xk0;