Added vertices position restoration

Samo Penic

2016-02-24 8fa1c00fb99a94d41606d8e870c563194160154d

 src/restore.c

@@ -13,8 +13,8 @@

ts_bool parseDump(char *dumpfname) {
   xmlDocPtr doc;
   xmlNodePtr cur;
   ts_vesicle *vesicle;
   xmlNodePtr cur, cur1,cur2;
   ts_vesicle *vesicle=NULL;

   doc = xmlParseFile(dumpfname);
   
@@ -37,7 +37,28 @@
      if ((!xmlStrcmp(cur->name, (const xmlChar *)"trisurf"))){
         vesicle=parseTrisurfTag(doc, cur);
      }
		 
      // START Point Position data &  Bonds
      if ((!xmlStrcmp(cur->name, (const xmlChar *)"UnstructuredGrid"))){
         cur1 = cur->xmlChildrenNode;
         while(cur1!=NULL){
            if ((!xmlStrcmp(cur1->name, (const xmlChar *)"Piece"))){
               cur2=cur1->xmlChildrenNode;
               while(cur2!=NULL){
                  if ((!xmlStrcmp(cur2->name, (const xmlChar *)"Points"))){
                     fprintf(stderr,"Found point data\n");
                     if(vesicle!=NULL)
                        parseXMLVertexPosition(vesicle, doc, cur);
                  }
                  if ((!xmlStrcmp(cur2->name, (const xmlChar *)"Cells"))){
                  fprintf(stderr,"Found cell(Bonds) data\n");
                  }
                  cur2=cur2->next;
               }	
            }
            cur1 = cur1->next;
         }
      }
      // END Point Position data & Bonds
   cur = cur->next;
   }
   
@@ -48,6 +69,9 @@
   return TS_SUCCESS;
}



/* this is a parser of additional data in xml */
ts_vesicle *parseTrisurfTag(xmlDocPtr doc, xmlNodePtr cur){
   fprintf(stderr,"Parsing trisurf tag\n");
   xmlNodePtr child;
@@ -194,3 +218,32 @@
   return TS_SUCCESS;
}


/* this is a parser of vertex positions and bonds from main xml data */
ts_bool parseXMLVertexPosition(ts_vesicle *vesicle,xmlDocPtr doc, xmlNodePtr cur){
   xmlNodePtr child = cur->xmlChildrenNode;
   xmlChar *points;
   char *pts;
   int i, idx;
   char *token[3];
   while (child != NULL) {
      if ((!xmlStrcmp(child->name, (const xmlChar *)"DataArray"))){
         points = xmlNodeListGetString(doc, child->xmlChildrenNode, 1);
         pts=(char *)points;
         for(i=0;i<3;i++)   token[i]=strtok(pts," ");
         idx=0;
         while(token[0]!=NULL){
            vesicle->vlist->vtx[idx]->x=atof(token[0]);
            vesicle->vlist->vtx[idx]->y=atof(token[1]);
            vesicle->vlist->vtx[idx]->z=atof(token[2]);
            for(i=0;i<3;i++)   token[i]=strtok(NULL," ");	
            idx++;
         }
         xmlFree(points);
      }
      child=child->next;
   }
   return TS_SUCCESS;
}