Trisurf Monte Carlo simulator
Samo Penic
2019-10-19 dba66b4f8a25cb7eb18de5f7ffca97e179d7a5d9
commit | author | age
dba66b 1 #include<stdio.h>
SP 2 #include<stdlib.h>
3 #include<general.h>
4 #include<string.h>
5 #include<zlib.h>
6 #include<inttypes.h>
7 #include<b64zlib_compression.h>
8
9
10 /* zlib compression base64 encoded */
11 /* compressed must not be pre-malloced */
12 /* taken from https://gist.github.com/arq5x/5315739 */
13 /* This function is not to be used in compressing paraview data. See below. */
14 ts_uint ts_compress_data(char *data, ts_uint data_len, char **compressed){
15     z_stream defstream;
16     defstream.zalloc = Z_NULL;
17     defstream.zfree = Z_NULL;
18     defstream.opaque = Z_NULL;
19     defstream.avail_in = data_len+1;
20     defstream.next_in = (unsigned char *)data;    
21     char *compr=(char *)malloc(data_len*sizeof(char));
22     defstream.avail_out = data_len+1;
23     defstream.next_out = (unsigned char *)compr;
24     deflateInit(&defstream, 6);
25 //    deflateInit(&defstream, Z_BEST_COMPRESSION);
26         deflate(&defstream, Z_FINISH);
27         deflateEnd(&defstream);
28     *compressed=compr;
29     return defstream.total_out;
30 }
31
32 ts_uint ts_compress_string64(char *data, ts_uint data_len, char **encoded_compressed){
33     size_t nbase;
34     char *compr;
35     size_t number_of_compressed_bytes=ts_compress_data(data, data_len, &compr);
36     *encoded_compressed=base64_encode((unsigned char *)compr,number_of_compressed_bytes,&nbase);
37     free(compr);
38     return nbase;
39 }
40
41 char *ts_compress(char *data, ts_uint data_len){
42     size_t nbase1, nbase2;
43     unsigned char *compr=(unsigned char *)malloc(data_len);
44     size_t number_of_compressed_bytes=data_len;
45
46     compress(compr,&number_of_compressed_bytes, (unsigned char *)data, data_len);
47 //    printf("Compressdion error code=%d, Z_OK=%d, Z_BUF_ERROR=%d", errcode, Z_OK, Z_BUF_ERROR);
48
49     char *encoded_compressed=base64_encode((unsigned char *)compr,number_of_compressed_bytes,&nbase1);
50
51     free(compr);
52
53     ts_uint header[4]={1, data_len, data_len, number_of_compressed_bytes};
54
55     char *encoded_header=(char *)base64_encode((unsigned char *)header, 4*sizeof(ts_uint), &nbase2);
56     char *return_value=malloc((nbase1+nbase2+1)*sizeof(char));
57     strncpy(return_value,encoded_header,nbase2);
58     strncpy(return_value+nbase2,encoded_compressed,nbase1);
59     *(return_value+nbase1+nbase2)=0;
60
61 //    printf("Compressed size in bytes= %ld, size of encoded header= %ld, size of encoded compressed= %ld.\n",number_of_compressed_bytes, nbase2, nbase1);
62     free(encoded_compressed);
63     free(encoded_header);
64     return return_value;
65 }
66
67 ts_uint ts_decompress_string64(char *b64, ts_uint data_len, char **decompressed){
68 return TS_SUCCESS;
69
70 }
71
72 /* base64 encoding, taken from http://stackoverflow.com/questions/342409/how-do-i-base64-encode-decode-in-c */
73 static char encoding_table[] = {'A', 'B', 'C', 'D', 'E', 'F', 'G', 'H',
74                                 'I', 'J', 'K', 'L', 'M', 'N', 'O', 'P',
75                                 'Q', 'R', 'S', 'T', 'U', 'V', 'W', 'X',
76                                 'Y', 'Z', 'a', 'b', 'c', 'd', 'e', 'f',
77                                 'g', 'h', 'i', 'j', 'k', 'l', 'm', 'n',
78                                 'o', 'p', 'q', 'r', 's', 't', 'u', 'v',
79                                 'w', 'x', 'y', 'z', '0', '1', '2', '3',
80                                 '4', '5', '6', '7', '8', '9', '+', '/'};
81 static char *decoding_table = NULL;
82 static int mod_table[] = {0, 2, 1};
83
84
85 char *base64_encode(const unsigned char *data, size_t input_length, size_t *output_length) {
86     *output_length = 4 * ((input_length + 2) / 3);
87     int i,j;
88     char *encoded_data = malloc(*output_length);
89     if (encoded_data == NULL) return NULL;
90     
91     for (i = 0, j = 0; i < input_length;) {
92
93            uint32_t octet_a = i < input_length ? (unsigned char)data[i++] : 0;
94         uint32_t octet_b = i < input_length ? (unsigned char)data[i++] : 0;
95            uint32_t octet_c = i < input_length ? (unsigned char)data[i++] : 0;
96         uint32_t triple = (octet_a << 0x10) + (octet_b << 0x08) + octet_c;
97
98            encoded_data[j++] = encoding_table[(triple >> 3 * 6) & 0x3F];
99            encoded_data[j++] = encoding_table[(triple >> 2 * 6) & 0x3F];
100            encoded_data[j++] = encoding_table[(triple >> 1 * 6) & 0x3F];
101            encoded_data[j++] = encoding_table[(triple >> 0 * 6) & 0x3F];
102     }
103
104     for (i = 0; i < mod_table[input_length % 3]; i++)
105            encoded_data[*output_length - 1 - i] = '=';
106
107     return encoded_data;
108 }
109
110
111 unsigned char *base64_decode(const char *data, size_t input_length, size_t *output_length) {
112     int i,j;
113     if (decoding_table == NULL) build_decoding_table();
114
115     if (input_length % 4 != 0) return NULL;
116
117     *output_length = input_length / 4 * 3;
118     if (data[input_length - 1] == '=') (*output_length)--;
119     if (data[input_length - 2] == '=') (*output_length)--;
120
121     unsigned char *decoded_data = malloc(*output_length);
122     if (decoded_data == NULL) return NULL;
123
124     for (i = 0, j = 0; i < input_length;) {
125            uint32_t sextet_a = data[i] == '=' ? 0 & i++ : decoding_table[(int)data[i++]];
126            uint32_t sextet_b = data[i] == '=' ? 0 & i++ : decoding_table[(int)data[i++]];
127            uint32_t sextet_c = data[i] == '=' ? 0 & i++ : decoding_table[(int)data[i++]];
128            uint32_t sextet_d = data[i] == '=' ? 0 & i++ : decoding_table[(int)data[i++]];
129
130            uint32_t triple = (sextet_a << 3 * 6)
131             + (sextet_b << 2 * 6)
132             + (sextet_c << 1 * 6)
133             + (sextet_d << 0 * 6);
134
135            if (j < *output_length) decoded_data[j++] = (triple >> 2 * 8) & 0xFF;
136            if (j < *output_length) decoded_data[j++] = (triple >> 1 * 8) & 0xFF;
137            if (j < *output_length) decoded_data[j++] = (triple >> 0 * 8) & 0xFF;
138     }
139     if(decoding_table !=NULL) free(decoding_table);
140     return decoded_data;
141 }
142
143
144 void build_decoding_table() {
145
146     decoding_table = malloc(256);
147     int i;
148     for (i = 0; i < 64; i++)
149         decoding_table[(unsigned char) encoding_table[i]] = i;
150 }
151
152
153 void base64_cleanup() {
154     free(decoding_table);
155 }
156
157
158