Trisurf Monte Carlo simulator
Samo Penic
2013-12-07 a2db521649cdcdfef3bdf6b306e05228a01498c0
commit | author | age
a6b1b5 1 ####### Vesicle definitions ###########
SP 2 # nshell is a number of divisions of dipyramid
3131dc 3 nshell=17
a6b1b5 4 # dmax is the square of the bond length 
SP 5 dmax=1.67
6 # bending rigidity of the membrane 
7 xk0=25.0
8 # max step size 
9 stepsize=0.15
10
a2db52 11 ####### Polymer definitions ###########
SP 12 # npoly is a number of polymers attached to npoly distinct vertices on vesicle
13 npoly=1000
14 # nmono is a number of monomers in each polymere
15 nmono=15
a6b1b5 16
SP 17 #######  Cell definitions ############
18 nxmax=60
19 nymax=60
20 nzmax=60
21
22
23 ####### Program Control ############
d7a113 24 #how many MC sweeps between subsequent records of states to disk
SP 25 mcsweeps=100
26 #how many initial mcsweeps*inititer MC sweeps before recording to disk?
dcf17d 27 inititer=100
d7a113 28 #how many records do you want on the disk iteration are there in a run?
dcf17d 29 iterations=1000
d7a113 30
a6b1b5 31
SP 32 #shut up if we are using cluster!!!
33 quiet=false
f74313 34
SP 35 #what type of multiprocessing? (*none, smp, cluster, distributed, cuda, auto)
36 #currently only none makes sense.
37 multiprocessing=none
38 #how many cores are allowed to process in SMP?
39 smp_cores=2
40 #how many nodes in cluster?
41 cluster_nodes=50
42 #max number of processes in distributed (voluntary) environment
43 distributed_processes=50
44 #cuda options???