Trisurf Monte Carlo simulator
Samo Penic
2014-03-06 6705af6d3d02e47a797c53146666a1d168e1aefc
commit | author | age
d7639a 1 #include<stdio.h>
SP 2 #include<math.h>
3 #include "general.h"
4 #include "vertex.h"
a10dd5 5 #include "bond.h"
a2a676 6 #include "triangle.h"
bb77ca 7 #include "cell.h"
7958e9 8 #include "vesicle.h"
a6b1b5 9 #include "io.h"
7958e9 10 #include "initial_distribution.h"
dac2e5 11 #include "frame.h"
aec47d 12 #include "timestep.h"
8db569 13 #include "poly.h"
d7639a 14
SP 15 /** Entrance function to the program
16   * @param argv is a number of parameters used in program call (including the program name
17   * @param argc is a pointer to strings (character arrays) which holds the arguments
18   * @returns returns 0 on success, any other number on fail.
19 */
20
21 int main(int argv, char *argc[]){
d7a113 22 ts_uint inititer,mcsweeps, iterations;
3c1ac1 23 ts_vesicle *vesicle, *vesicle1;
b14a8d 24 /* THIS SHOULD GO INTO UNIT TEST
d7639a 25 ts_bool retval;
3131dc 26     ts_vertex_list *vlist=init_vertex_list(5);
b01cc1 27 ts_vertex_list *vlist1;
a10dd5 28 ts_bond_list *blist=init_bond_list();
a2a676 29 ts_triangle_list *tlist=init_triangle_list();
bb77ca 30 ts_cell_list *clist=init_cell_list(3,3,3,0.3);
d7639a 31
a10dd5 32 retval=vtx_add_cneighbour(blist,vlist->vtx[1],vlist->vtx[0]);
d7639a 33 if(retval==TS_FAIL) printf("1. already a member or vertex is null!\n");
a10dd5 34
e19e79 35 retval=vtx_add_neighbour(vlist->vtx[0],vlist->vtx[1]);
d7639a 36 if(retval==TS_FAIL) printf("2. already a member or vertex is null!\n");
306559 37 fprintf(stderr,"Was here");
e19e79 38 retval=vtx_remove_neighbour(vlist->vtx[1],vlist->vtx[0]);
9802f1 39 vtx_add_neighbour(vlist->vtx[0],vlist->vtx[1]);
306559 40 fprintf(stderr,"Was here too!\n");
9802f1 41
8f6a69 42 vlist->vtx[0]->x=1.0;
SP 43 vlist->vtx[0]->x=1.1;
b01cc1 44 vlist1=vertex_list_copy(vlist);
a10dd5 45 bond_add(blist, vlist->vtx[1],vlist->vtx[0]);
a2a676 46 triangle_add(tlist,vlist->vtx[1],vlist->vtx[2],vlist->vtx[3]);
a10dd5 47
a2a676 48 triangle_add(tlist,vlist->vtx[1],vlist->vtx[2],vlist->vtx[3]);
SP 49
34d3de 50 printf("Cell idx=1 has vertices=%u\n",clist->cell[0]->nvertex);
bb77ca 51 cell_add_vertex(clist->cell[0], vlist->vtx[0]);
34d3de 52 printf("Cell idx=1 has vertices=%u\n",clist->cell[0]->nvertex);
8f6a69 53 printf("Cell idx=1 has vertex[0] has x coordinate=%e\n",clist->cell[0]->vertex[0]->x);
bb77ca 54 cell_list_cell_occupation_clear(clist);
34d3de 55 printf("Cell idx=1 has vertices=%u\n",clist->cell[0]->nvertex);
bb77ca 56 cell_add_vertex(clist->cell[0], vlist->vtx[0]);
SP 57
58
a2a676 59 triangle_list_free(tlist);
a10dd5 60 bond_list_free(blist);
73f967 61 vtx_list_free(vlist);
bb77ca 62 cell_list_free(clist);
7958e9 63
b01cc1 64 vtx_list_free(vlist1);
SP 65 printf("Tests complete.\n");
b14a8d 66 */
063289 67 vesicle1=parsetape(&mcsweeps, &inititer, &iterations);
8db569 68
M 69 /*Testing */
a2db52 70 //vesicle->poly_list=init_poly_list(1400,20,vesicle->vlist);
8db569 71
a2db52 72 //poly_list_free(vesicle->poly_list);
8db569 73 /*End testing*/
3c1ac1 74
063289 75 dump_state(vesicle1);
314f2d 76
86f5e7 77 vesicle=restore_state();
SP 78 //vesicle_free(vesicle1);
79 run_simulation(vesicle1, mcsweeps, inititer, iterations);
a6b1b5 80 write_master_xml_file("test.pvd");
3131dc 81 write_dout_fcompat_file(vesicle,"dout");
7958e9 82 vesicle_free(vesicle);
SP 83
d7639a 84 return 0; //program finished perfectly ok. We return 0.
SP 85