Trisurf Monte Carlo simulator
Miha
2014-02-21 304510886da7e3969efd6d506e68652b533c0975
commit | author | age
a6b1b5 1 ####### Vesicle definitions ###########
SP 2 # nshell is a number of divisions of dipyramid
4a1b27 3 nshell=17
fedf2b 4 # dmax is the max. bond length 
304510 5 dmax=1.7
a6b1b5 6 # bending rigidity of the membrane 
SP 7 xk0=25.0
8 # max step size 
9 stepsize=0.15
10
a2db52 11 ####### Polymer definitions ###########
SP 12 # npoly is a number of polymers attached to npoly distinct vertices on vesicle
f8e6ba 13 npoly=30
48bb92 14 # nmono is a number of monomers in each polymer
f8e6ba 15 nmono=10
48bb92 16 # Spring constant between monomers of the polymer
M 17 k_spring=800
a6b1b5 18
SP 19 #######  Cell definitions ############
20 nxmax=60
21 nymax=60
22 nzmax=60
23
24
25 ####### Program Control ############
d7a113 26 #how many MC sweeps between subsequent records of states to disk
4a1b27 27 mcsweeps=5000
d7a113 28 #how many initial mcsweeps*inititer MC sweeps before recording to disk?
40aa5b 29 inititer=1
d7a113 30 #how many records do you want on the disk iteration are there in a run?
4a1b27 31 iterations=10000
d7a113 32
a6b1b5 33
SP 34 #shut up if we are using cluster!!!
35 quiet=false
f74313 36
SP 37 #what type of multiprocessing? (*none, smp, cluster, distributed, cuda, auto)
38 #currently only none makes sense.
39 multiprocessing=none
40 #how many cores are allowed to process in SMP?
41 smp_cores=2
42 #how many nodes in cluster?
43 cluster_nodes=50
44 #max number of processes in distributed (voluntary) environment
45 distributed_processes=50
46 #cuda options???