Trisurf Monte Carlo simulator
Samo Penic
2014-03-08 2870ab279d5dce60c24e7a3e35d8a5e421003548
backuping vtxes complete. debugging bondflip
3 files modified
3 files deleted
3 files added
2055 ■■■■■ changed files
aclocal.m4 436 ●●●●● patch | view | raw | blame | history
depcomp 1 ●●●● patch | view | raw | blame | history
depcomp 791 ●●●●● patch | view | raw | blame | history
install-sh 1 ●●●● patch | view | raw | blame | history
install-sh 527 ●●●●● patch | view | raw | blame | history
missing 1 ●●●● patch | view | raw | blame | history
missing 215 ●●●●● patch | view | raw | blame | history
src/bondflip.c 81 ●●●●● patch | view | raw | blame | history
src/triangle.c 2 ●●●●● patch | view | raw | blame | history
aclocal.m4
@@ -1,8 +1,7 @@
# generated automatically by aclocal 1.11.3 -*- Autoconf -*-
# generated automatically by aclocal 1.13.3 -*- Autoconf -*-
# Copyright (C) 1996, 1997, 1998, 1999, 2000, 2001, 2002, 2003, 2004,
# 2005, 2006, 2007, 2008, 2009, 2010, 2011 Free Software Foundation,
# Inc.
# Copyright (C) 1996-2013 Free Software Foundation, Inc.
# This file is free software; the Free Software Foundation
# gives unlimited permission to copy and/or distribute it,
# with or without modifications, as long as this notice is preserved.
@@ -12,22 +11,20 @@
# even the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A
# PARTICULAR PURPOSE.
m4_ifndef([AC_CONFIG_MACRO_DIRS], [m4_defun([_AM_CONFIG_MACRO_DIRS], [])m4_defun([AC_CONFIG_MACRO_DIRS], [_AM_CONFIG_MACRO_DIRS($@)])])
m4_ifndef([AC_AUTOCONF_VERSION],
  [m4_copy([m4_PACKAGE_VERSION], [AC_AUTOCONF_VERSION])])dnl
m4_if(m4_defn([AC_AUTOCONF_VERSION]), [2.68],,
[m4_warning([this file was generated for autoconf 2.68.
m4_if(m4_defn([AC_AUTOCONF_VERSION]), [2.69],,
[m4_warning([this file was generated for autoconf 2.69.
You have another version of autoconf.  It may work, but is not guaranteed to.
If you have problems, you may need to regenerate the build system entirely.
To do so, use the procedure documented by the package, typically `autoreconf'.])])
To do so, use the procedure documented by the package, typically 'autoreconf'.])])
# Copyright (C) 2002, 2003, 2005, 2006, 2007, 2008, 2011 Free Software
# Foundation, Inc.
# Copyright (C) 2002-2013 Free Software Foundation, Inc.
#
# This file is free software; the Free Software Foundation
# gives unlimited permission to copy and/or distribute it,
# with or without modifications, as long as this notice is preserved.
# serial 1
# AM_AUTOMAKE_VERSION(VERSION)
# ----------------------------
@@ -35,10 +32,10 @@
# generated from the m4 files accompanying Automake X.Y.
# (This private macro should not be called outside this file.)
AC_DEFUN([AM_AUTOMAKE_VERSION],
[am__api_version='1.11'
[am__api_version='1.13'
dnl Some users find AM_AUTOMAKE_VERSION and mistake it for a way to
dnl require some minimum version.  Point them to the right macro.
m4_if([$1], [1.11.3], [],
m4_if([$1], [1.13.3], [],
      [AC_FATAL([Do not call $0, use AM_INIT_AUTOMAKE([$1]).])])dnl
])
@@ -54,24 +51,22 @@
# Call AM_AUTOMAKE_VERSION and AM_AUTOMAKE_VERSION so they can be traced.
# This function is AC_REQUIREd by AM_INIT_AUTOMAKE.
AC_DEFUN([AM_SET_CURRENT_AUTOMAKE_VERSION],
[AM_AUTOMAKE_VERSION([1.11.3])dnl
[AM_AUTOMAKE_VERSION([1.13.3])dnl
m4_ifndef([AC_AUTOCONF_VERSION],
  [m4_copy([m4_PACKAGE_VERSION], [AC_AUTOCONF_VERSION])])dnl
_AM_AUTOCONF_VERSION(m4_defn([AC_AUTOCONF_VERSION]))])
# AM_AUX_DIR_EXPAND                                         -*- Autoconf -*-
# Copyright (C) 2001, 2003, 2005, 2011 Free Software Foundation, Inc.
# Copyright (C) 2001-2013 Free Software Foundation, Inc.
#
# This file is free software; the Free Software Foundation
# gives unlimited permission to copy and/or distribute it,
# with or without modifications, as long as this notice is preserved.
# serial 1
# For projects using AC_CONFIG_AUX_DIR([foo]), Autoconf sets
# $ac_aux_dir to `$srcdir/foo'.  In other projects, it is set to
# `$srcdir', `$srcdir/..', or `$srcdir/../..'.
# $ac_aux_dir to '$srcdir/foo'.  In other projects, it is set to
# '$srcdir', '$srcdir/..', or '$srcdir/../..'.
#
# Of course, Automake must honor this variable whenever it calls a
# tool from the auxiliary directory.  The problem is that $srcdir (and
@@ -90,7 +85,7 @@
#
# The reason of the latter failure is that $top_srcdir and $ac_aux_dir
# are both prefixed by $srcdir.  In an in-source build this is usually
# harmless because $srcdir is `.', but things will broke when you
# harmless because $srcdir is '.', but things will broke when you
# start a VPATH build or use an absolute $srcdir.
#
# So we could use something similar to $top_srcdir/$ac_aux_dir/missing,
@@ -116,21 +111,18 @@
# AM_CONDITIONAL                                            -*- Autoconf -*-
# Copyright (C) 1997, 2000, 2001, 2003, 2004, 2005, 2006, 2008
# Free Software Foundation, Inc.
# Copyright (C) 1997-2013 Free Software Foundation, Inc.
#
# This file is free software; the Free Software Foundation
# gives unlimited permission to copy and/or distribute it,
# with or without modifications, as long as this notice is preserved.
# serial 9
# AM_CONDITIONAL(NAME, SHELL-CONDITION)
# -------------------------------------
# Define a conditional.
AC_DEFUN([AM_CONDITIONAL],
[AC_PREREQ(2.52)dnl
 ifelse([$1], [TRUE],  [AC_FATAL([$0: invalid condition: $1])],
[AC_PREREQ([2.52])dnl
 m4_if([$1], [TRUE],  [AC_FATAL([$0: invalid condition: $1])],
    [$1], [FALSE], [AC_FATAL([$0: invalid condition: $1])])dnl
AC_SUBST([$1_TRUE])dnl
AC_SUBST([$1_FALSE])dnl
@@ -150,16 +142,14 @@
Usually this means the macro was only invoked conditionally.]])
fi])])
# Copyright (C) 1999, 2000, 2001, 2002, 2003, 2004, 2005, 2006, 2009,
# 2010, 2011 Free Software Foundation, Inc.
# Copyright (C) 1999-2013 Free Software Foundation, Inc.
#
# This file is free software; the Free Software Foundation
# gives unlimited permission to copy and/or distribute it,
# with or without modifications, as long as this notice is preserved.
# serial 12
# There are a few dirty hacks below to avoid letting `AC_PROG_CC' be
# There are a few dirty hacks below to avoid letting 'AC_PROG_CC' be
# written in clear, in which case automake, when reading aclocal.m4,
# will think it sees a *use*, and therefore will trigger all it's
# C support machinery.  Also note that it means that autoscan, seeing
@@ -169,7 +159,7 @@
# _AM_DEPENDENCIES(NAME)
# ----------------------
# See how the compiler implements dependency checking.
# NAME is "CC", "CXX", "GCJ", or "OBJC".
# NAME is "CC", "CXX", "OBJC", "OBJCXX", "UPC", or "GJC".
# We try a few techniques and use that to set a single cache variable.
#
# We don't AC_REQUIRE the corresponding AC_PROG_CC since the latter was
@@ -182,11 +172,12 @@
AC_REQUIRE([AM_MAKE_INCLUDE])dnl
AC_REQUIRE([AM_DEP_TRACK])dnl
ifelse([$1], CC,   [depcc="$CC"   am_compiler_list=],
       [$1], CXX,  [depcc="$CXX"  am_compiler_list=],
       [$1], OBJC, [depcc="$OBJC" am_compiler_list='gcc3 gcc'],
       [$1], UPC,  [depcc="$UPC"  am_compiler_list=],
       [$1], GCJ,  [depcc="$GCJ"  am_compiler_list='gcc3 gcc'],
m4_if([$1], [CC],   [depcc="$CC"   am_compiler_list=],
      [$1], [CXX],  [depcc="$CXX"  am_compiler_list=],
      [$1], [OBJC], [depcc="$OBJC" am_compiler_list='gcc3 gcc'],
      [$1], [OBJCXX], [depcc="$OBJCXX" am_compiler_list='gcc3 gcc'],
      [$1], [UPC],  [depcc="$UPC"  am_compiler_list=],
      [$1], [GCJ],  [depcc="$GCJ"  am_compiler_list='gcc3 gcc'],
                   [depcc="$$1"   am_compiler_list=])
AC_CACHE_CHECK([dependency style of $depcc],
@@ -195,8 +186,8 @@
  # We make a subdir and do the tests there.  Otherwise we can end up
  # making bogus files that we don't know about and never remove.  For
  # instance it was reported that on HP-UX the gcc test will end up
  # making a dummy file named `D' -- because `-MD' means `put the output
  # in D'.
  # making a dummy file named 'D' -- because '-MD' means "put the output
  # in D".
  rm -rf conftest.dir
  mkdir conftest.dir
  # Copy depcomp to subdir because otherwise we won't find it if we're
@@ -236,16 +227,16 @@
    : > sub/conftest.c
    for i in 1 2 3 4 5 6; do
      echo '#include "conftst'$i'.h"' >> sub/conftest.c
      # Using `: > sub/conftst$i.h' creates only sub/conftst1.h with
      # Solaris 8's {/usr,}/bin/sh.
      touch sub/conftst$i.h
      # Using ": > sub/conftst$i.h" creates only sub/conftst1.h with
      # Solaris 10 /bin/sh.
      echo '/* dummy */' > sub/conftst$i.h
    done
    echo "${am__include} ${am__quote}sub/conftest.Po${am__quote}" > confmf
    # We check with `-c' and `-o' for the sake of the "dashmstdout"
    # We check with '-c' and '-o' for the sake of the "dashmstdout"
    # mode.  It turns out that the SunPro C++ compiler does not properly
    # handle `-M -o', and we need to detect this.  Also, some Intel
    # versions had trouble with output in subdirs
    # handle '-M -o', and we need to detect this.  Also, some Intel
    # versions had trouble with output in subdirs.
    am__obj=sub/conftest.${OBJEXT-o}
    am__minus_obj="-o $am__obj"
    case $depmode in
@@ -254,8 +245,8 @@
      test "$am__universal" = false || continue
      ;;
    nosideeffect)
      # after this tag, mechanisms are not by side-effect, so they'll
      # only be used when explicitly requested
      # After this tag, mechanisms are not by side-effect, so they'll
      # only be used when explicitly requested.
      if test "x$enable_dependency_tracking" = xyes; then
    continue
      else
@@ -263,7 +254,7 @@
      fi
      ;;
    msvc7 | msvc7msys | msvisualcpp | msvcmsys)
      # This compiler won't grok `-c -o', but also, the minuso test has
      # This compiler won't grok '-c -o', but also, the minuso test has
      # not run yet.  These depmodes are late enough in the game, and
      # so weak that their functioning should not be impacted.
      am__obj=conftest.${OBJEXT-o}
@@ -311,7 +302,7 @@
# AM_SET_DEPDIR
# -------------
# Choose a directory name for dependency files.
# This macro is AC_REQUIREd in _AM_DEPENDENCIES
# This macro is AC_REQUIREd in _AM_DEPENDENCIES.
AC_DEFUN([AM_SET_DEPDIR],
[AC_REQUIRE([AM_SET_LEADING_DOT])dnl
AC_SUBST([DEPDIR], ["${am__leading_dot}deps"])dnl
@@ -321,9 +312,13 @@
# AM_DEP_TRACK
# ------------
AC_DEFUN([AM_DEP_TRACK],
[AC_ARG_ENABLE(dependency-tracking,
[  --disable-dependency-tracking  speeds up one-time build
  --enable-dependency-tracking   do not reject slow dependency extractors])
[AC_ARG_ENABLE([dependency-tracking], [dnl
AS_HELP_STRING(
  [--enable-dependency-tracking],
  [do not reject slow dependency extractors])
AS_HELP_STRING(
  [--disable-dependency-tracking],
  [speeds up one-time build])])
if test "x$enable_dependency_tracking" != xno; then
  am_depcomp="$ac_aux_dir/depcomp"
  AMDEPBACKSLASH='\'
@@ -338,20 +333,18 @@
# Generate code to set up dependency tracking.              -*- Autoconf -*-
# Copyright (C) 1999, 2000, 2001, 2002, 2003, 2004, 2005, 2008
# Free Software Foundation, Inc.
# Copyright (C) 1999-2013 Free Software Foundation, Inc.
#
# This file is free software; the Free Software Foundation
# gives unlimited permission to copy and/or distribute it,
# with or without modifications, as long as this notice is preserved.
#serial 5
# _AM_OUTPUT_DEPENDENCY_COMMANDS
# ------------------------------
AC_DEFUN([_AM_OUTPUT_DEPENDENCY_COMMANDS],
[{
  # Autoconf 2.62 quotes --file arguments for eval, but not when files
  # Older Autoconf quotes --file arguments for eval, but not when files
  # are listed without --file.  Let's play safe and only enable the eval
  # if we detect the quoting.
  case $CONFIG_FILES in
@@ -364,7 +357,7 @@
    # Strip MF so we end up with the name of the file.
    mf=`echo "$mf" | sed -e 's/:.*$//'`
    # Check whether this is an Automake generated Makefile or not.
    # We used to match only the files named `Makefile.in', but
    # We used to match only the files named 'Makefile.in', but
    # some people rename them; so instead we look at the file content.
    # Grep'ing the first line is not enough: some people post-process
    # each Makefile.in and add a new line on top of each file to say so.
@@ -376,21 +369,19 @@
      continue
    fi
    # Extract the definition of DEPDIR, am__include, and am__quote
    # from the Makefile without running `make'.
    # from the Makefile without running 'make'.
    DEPDIR=`sed -n 's/^DEPDIR = //p' < "$mf"`
    test -z "$DEPDIR" && continue
    am__include=`sed -n 's/^am__include = //p' < "$mf"`
    test -z "am__include" && continue
    test -z "$am__include" && continue
    am__quote=`sed -n 's/^am__quote = //p' < "$mf"`
    # When using ansi2knr, U may be empty or an underscore; expand it
    U=`sed -n 's/^U = //p' < "$mf"`
    # Find all dependency output files, they are included files with
    # $(DEPDIR) in their names.  We invoke sed twice because it is the
    # simplest approach to changing $(DEPDIR) to its actual value in the
    # expansion.
    for file in `sed -n "
      s/^$am__include $am__quote\(.*(DEPDIR).*\)$am__quote"'$/\1/p' <"$mf" | \
     sed -e 's/\$(DEPDIR)/'"$DEPDIR"'/g' -e 's/\$U/'"$U"'/g'`; do
     sed -e 's/\$(DEPDIR)/'"$DEPDIR"'/g'`; do
      # Make sure the directory exists.
      test -f "$dirpart/$file" && continue
      fdir=`AS_DIRNAME(["$file"])`
@@ -408,7 +399,7 @@
# This macro should only be invoked once -- use via AC_REQUIRE.
#
# This code is only required when automatic dependency tracking
# is enabled.  FIXME.  This creates each `.P' file that we will
# is enabled.  FIXME.  This creates each '.P' file that we will
# need in order to bootstrap the dependency handling code.
AC_DEFUN([AM_OUTPUT_DEPENDENCY_COMMANDS],
[AC_CONFIG_COMMANDS([depfiles],
@@ -418,14 +409,11 @@
# Do all the work for Automake.                             -*- Autoconf -*-
# Copyright (C) 1996, 1997, 1998, 1999, 2000, 2001, 2002, 2003, 2004,
# 2005, 2006, 2008, 2009 Free Software Foundation, Inc.
# Copyright (C) 1996-2013 Free Software Foundation, Inc.
#
# This file is free software; the Free Software Foundation
# gives unlimited permission to copy and/or distribute it,
# with or without modifications, as long as this notice is preserved.
# serial 16
# This macro actually does too much.  Some checks are only needed if
# your package does certain things.  But this isn't really a big deal.
@@ -442,7 +430,7 @@
# arguments mandatory, and then we can depend on a new Autoconf
# release and drop the old call support.
AC_DEFUN([AM_INIT_AUTOMAKE],
[AC_PREREQ([2.62])dnl
[AC_PREREQ([2.65])dnl
dnl Autoconf wants to disallow AM_ names.  We explicitly allow
dnl the ones we care about.
m4_pattern_allow([^AM_[A-Z]+FLAGS$])dnl
@@ -471,31 +459,40 @@
# Define the identity of the package.
dnl Distinguish between old-style and new-style calls.
m4_ifval([$2],
[m4_ifval([$3], [_AM_SET_OPTION([no-define])])dnl
[AC_DIAGNOSE([obsolete],
             [$0: two- and three-arguments forms are deprecated.])
m4_ifval([$3], [_AM_SET_OPTION([no-define])])dnl
 AC_SUBST([PACKAGE], [$1])dnl
 AC_SUBST([VERSION], [$2])],
[_AM_SET_OPTIONS([$1])dnl
dnl Diagnose old-style AC_INIT with new-style AM_AUTOMAKE_INIT.
m4_if(m4_ifdef([AC_PACKAGE_NAME], 1)m4_ifdef([AC_PACKAGE_VERSION], 1), 11,,
m4_if(
  m4_ifdef([AC_PACKAGE_NAME], [ok]):m4_ifdef([AC_PACKAGE_VERSION], [ok]),
  [ok:ok],,
  [m4_fatal([AC_INIT should be called with package and version arguments])])dnl
 AC_SUBST([PACKAGE], ['AC_PACKAGE_TARNAME'])dnl
 AC_SUBST([VERSION], ['AC_PACKAGE_VERSION'])])dnl
_AM_IF_OPTION([no-define],,
[AC_DEFINE_UNQUOTED(PACKAGE, "$PACKAGE", [Name of package])
 AC_DEFINE_UNQUOTED(VERSION, "$VERSION", [Version number of package])])dnl
[AC_DEFINE_UNQUOTED([PACKAGE], ["$PACKAGE"], [Name of package])
 AC_DEFINE_UNQUOTED([VERSION], ["$VERSION"], [Version number of package])])dnl
# Some tools Automake needs.
AC_REQUIRE([AM_SANITY_CHECK])dnl
AC_REQUIRE([AC_ARG_PROGRAM])dnl
AM_MISSING_PROG(ACLOCAL, aclocal-${am__api_version})
AM_MISSING_PROG(AUTOCONF, autoconf)
AM_MISSING_PROG(AUTOMAKE, automake-${am__api_version})
AM_MISSING_PROG(AUTOHEADER, autoheader)
AM_MISSING_PROG(MAKEINFO, makeinfo)
AM_MISSING_PROG([ACLOCAL], [aclocal-${am__api_version}])
AM_MISSING_PROG([AUTOCONF], [autoconf])
AM_MISSING_PROG([AUTOMAKE], [automake-${am__api_version}])
AM_MISSING_PROG([AUTOHEADER], [autoheader])
AM_MISSING_PROG([MAKEINFO], [makeinfo])
AC_REQUIRE([AM_PROG_INSTALL_SH])dnl
AC_REQUIRE([AM_PROG_INSTALL_STRIP])dnl
AC_REQUIRE([AM_PROG_MKDIR_P])dnl
AC_REQUIRE([AC_PROG_MKDIR_P])dnl
# For better backward compatibility.  To be removed once Automake 1.9.x
# dies out for good.  For more background, see:
# <http://lists.gnu.org/archive/html/automake/2012-07/msg00001.html>
# <http://lists.gnu.org/archive/html/automake/2012-07/msg00014.html>
AC_SUBST([mkdir_p], ['$(MKDIR_P)'])
# We need awk for the "check" target.  The system "awk" is bad on
# some platforms.
AC_REQUIRE([AC_PROG_AWK])dnl
@@ -506,28 +503,32 @@
                 [_AM_PROG_TAR([v7])])])
_AM_IF_OPTION([no-dependencies],,
[AC_PROVIDE_IFELSE([AC_PROG_CC],
          [_AM_DEPENDENCIES(CC)],
          [define([AC_PROG_CC],
              defn([AC_PROG_CC])[_AM_DEPENDENCIES(CC)])])dnl
          [_AM_DEPENDENCIES([CC])],
          [m4_define([AC_PROG_CC],
                 m4_defn([AC_PROG_CC])[_AM_DEPENDENCIES([CC])])])dnl
AC_PROVIDE_IFELSE([AC_PROG_CXX],
          [_AM_DEPENDENCIES(CXX)],
          [define([AC_PROG_CXX],
              defn([AC_PROG_CXX])[_AM_DEPENDENCIES(CXX)])])dnl
          [_AM_DEPENDENCIES([CXX])],
          [m4_define([AC_PROG_CXX],
                 m4_defn([AC_PROG_CXX])[_AM_DEPENDENCIES([CXX])])])dnl
AC_PROVIDE_IFELSE([AC_PROG_OBJC],
          [_AM_DEPENDENCIES(OBJC)],
          [define([AC_PROG_OBJC],
              defn([AC_PROG_OBJC])[_AM_DEPENDENCIES(OBJC)])])dnl
          [_AM_DEPENDENCIES([OBJC])],
          [m4_define([AC_PROG_OBJC],
                 m4_defn([AC_PROG_OBJC])[_AM_DEPENDENCIES([OBJC])])])dnl
AC_PROVIDE_IFELSE([AC_PROG_OBJCXX],
          [_AM_DEPENDENCIES([OBJCXX])],
          [m4_define([AC_PROG_OBJCXX],
                 m4_defn([AC_PROG_OBJCXX])[_AM_DEPENDENCIES([OBJCXX])])])dnl
])
_AM_IF_OPTION([silent-rules], [AC_REQUIRE([AM_SILENT_RULES])])dnl
dnl The `parallel-tests' driver may need to know about EXEEXT, so add the
dnl `am__EXEEXT' conditional if _AM_COMPILER_EXEEXT was seen.  This macro
dnl is hooked onto _AC_COMPILER_EXEEXT early, see below.
AC_REQUIRE([AM_SILENT_RULES])dnl
dnl The testsuite driver may need to know about EXEEXT, so add the
dnl 'am__EXEEXT' conditional if _AM_COMPILER_EXEEXT was seen.  This
dnl macro is hooked onto _AC_COMPILER_EXEEXT early, see below.
AC_CONFIG_COMMANDS_PRE(dnl
[m4_provide_if([_AM_COMPILER_EXEEXT],
  [AM_CONDITIONAL([am__EXEEXT], [test -n "$EXEEXT"])])])dnl
])
dnl Hook into `_AC_COMPILER_EXEEXT' early to learn its expansion.  Do not
dnl Hook into '_AC_COMPILER_EXEEXT' early to learn its expansion.  Do not
dnl add the conditional right here, as _AC_COMPILER_EXEEXT may be further
dnl mangled by Autoconf and run in a shell conditional statement.
m4_define([_AC_COMPILER_EXEEXT],
@@ -555,14 +556,11 @@
done
echo "timestamp for $_am_arg" >`AS_DIRNAME(["$_am_arg"])`/stamp-h[]$_am_stamp_count])
# Copyright (C) 2001, 2003, 2005, 2008, 2011 Free Software Foundation,
# Inc.
# Copyright (C) 2001-2013 Free Software Foundation, Inc.
#
# This file is free software; the Free Software Foundation
# gives unlimited permission to copy and/or distribute it,
# with or without modifications, as long as this notice is preserved.
# serial 1
# AM_PROG_INSTALL_SH
# ------------------
@@ -577,15 +575,13 @@
    install_sh="\${SHELL} $am_aux_dir/install-sh"
  esac
fi
AC_SUBST(install_sh)])
AC_SUBST([install_sh])])
# Copyright (C) 2003, 2005  Free Software Foundation, Inc.
# Copyright (C) 2003-2013 Free Software Foundation, Inc.
#
# This file is free software; the Free Software Foundation
# gives unlimited permission to copy and/or distribute it,
# with or without modifications, as long as this notice is preserved.
# serial 2
# Check whether the underlying file-system supports filenames
# with a leading dot.  For instance MS-DOS doesn't.
@@ -602,13 +598,11 @@
# Check to see how 'make' treats includes.                -*- Autoconf -*-
# Copyright (C) 2001, 2002, 2003, 2005, 2009  Free Software Foundation, Inc.
# Copyright (C) 2001-2013 Free Software Foundation, Inc.
#
# This file is free software; the Free Software Foundation
# gives unlimited permission to copy and/or distribute it,
# with or without modifications, as long as this notice is preserved.
# serial 4
# AM_MAKE_INCLUDE()
# -----------------
@@ -627,7 +621,7 @@
_am_result=none
# First try GNU make style include.
echo "include confinc" > confmf
# Ignore all kinds of additional output from `make'.
# Ignore all kinds of additional output from 'make'.
case `$am_make -s -f confmf 2> /dev/null` in #(
*the\ am__doit\ target*)
  am__include=include
@@ -654,14 +648,11 @@
# Fake the existence of programs that GNU maintainers use.  -*- Autoconf -*-
# Copyright (C) 1997, 1999, 2000, 2001, 2003, 2004, 2005, 2008
# Free Software Foundation, Inc.
# Copyright (C) 1997-2013 Free Software Foundation, Inc.
#
# This file is free software; the Free Software Foundation
# gives unlimited permission to copy and/or distribute it,
# with or without modifications, as long as this notice is preserved.
# serial 6
# AM_MISSING_PROG(NAME, PROGRAM)
# ------------------------------
@@ -670,11 +661,10 @@
$1=${$1-"${am_missing_run}$2"}
AC_SUBST($1)])
# AM_MISSING_HAS_RUN
# ------------------
# Define MISSING if not defined so far and test if it supports --run.
# If it does, set am_missing_run to use it, otherwise, to nothing.
# Define MISSING if not defined so far and test if it is modern enough.
# If it is, set am_missing_run to use it, otherwise, to nothing.
AC_DEFUN([AM_MISSING_HAS_RUN],
[AC_REQUIRE([AM_AUX_DIR_EXPAND])dnl
AC_REQUIRE_AUX_FILE([missing])dnl
@@ -687,53 +677,21 @@
  esac
fi
# Use eval to expand $SHELL
if eval "$MISSING --run true"; then
  am_missing_run="$MISSING --run "
if eval "$MISSING --is-lightweight"; then
  am_missing_run="$MISSING "
else
  am_missing_run=
  AC_MSG_WARN([`missing' script is too old or missing])
  AC_MSG_WARN(['missing' script is too old or missing])
fi
])
# Copyright (C) 2003, 2004, 2005, 2006, 2011 Free Software Foundation,
# Inc.
#
# This file is free software; the Free Software Foundation
# gives unlimited permission to copy and/or distribute it,
# with or without modifications, as long as this notice is preserved.
# serial 1
# AM_PROG_MKDIR_P
# ---------------
# Check for `mkdir -p'.
AC_DEFUN([AM_PROG_MKDIR_P],
[AC_PREREQ([2.60])dnl
AC_REQUIRE([AC_PROG_MKDIR_P])dnl
dnl Automake 1.8 to 1.9.6 used to define mkdir_p.  We now use MKDIR_P,
dnl while keeping a definition of mkdir_p for backward compatibility.
dnl @MKDIR_P@ is magic: AC_OUTPUT adjusts its value for each Makefile.
dnl However we cannot define mkdir_p as $(MKDIR_P) for the sake of
dnl Makefile.ins that do not define MKDIR_P, so we do our own
dnl adjustment using top_builddir (which is defined more often than
dnl MKDIR_P).
AC_SUBST([mkdir_p], ["$MKDIR_P"])dnl
case $mkdir_p in
  [[\\/$]]* | ?:[[\\/]]*) ;;
  */*) mkdir_p="\$(top_builddir)/$mkdir_p" ;;
esac
])
# Helper functions for option handling.                     -*- Autoconf -*-
# Copyright (C) 2001, 2002, 2003, 2005, 2008, 2010 Free Software
# Foundation, Inc.
# Copyright (C) 2001-2013 Free Software Foundation, Inc.
#
# This file is free software; the Free Software Foundation
# gives unlimited permission to copy and/or distribute it,
# with or without modifications, as long as this notice is preserved.
# serial 5
# _AM_MANGLE_OPTION(NAME)
# -----------------------
@@ -744,7 +702,7 @@
# --------------------
# Set option NAME.  Presently that only means defining a flag for this option.
AC_DEFUN([_AM_SET_OPTION],
[m4_define(_AM_MANGLE_OPTION([$1]), 1)])
[m4_define(_AM_MANGLE_OPTION([$1]), [1])])
# _AM_SET_OPTIONS(OPTIONS)
# ------------------------
@@ -760,22 +718,16 @@
# Check to make sure that the build environment is sane.    -*- Autoconf -*-
# Copyright (C) 1996, 1997, 2000, 2001, 2003, 2005, 2008
# Free Software Foundation, Inc.
# Copyright (C) 1996-2013 Free Software Foundation, Inc.
#
# This file is free software; the Free Software Foundation
# gives unlimited permission to copy and/or distribute it,
# with or without modifications, as long as this notice is preserved.
# serial 5
# AM_SANITY_CHECK
# ---------------
AC_DEFUN([AM_SANITY_CHECK],
[AC_MSG_CHECKING([whether build environment is sane])
# Just in case
sleep 1
echo timestamp > conftest.file
# Reject unsafe characters in $srcdir or the absolute working directory
# name.  Accept space and tab only in the latter.
am_lf='
@@ -786,21 +738,23 @@
esac
case $srcdir in
  *[[\\\"\#\$\&\'\`$am_lf\ \    ]]*)
    AC_MSG_ERROR([unsafe srcdir value: `$srcdir']);;
    AC_MSG_ERROR([unsafe srcdir value: '$srcdir']);;
esac
# Do `set' in a subshell so we don't clobber the current shell's
# Do 'set' in a subshell so we don't clobber the current shell's
# arguments.  Must try -L first in case configure is actually a
# symlink; some systems play weird games with the mod time of symlinks
# (eg FreeBSD returns the mod time of the symlink's containing
# directory).
if (
   am_has_slept=no
   for am_try in 1 2; do
     echo "timestamp, slept: $am_has_slept" > conftest.file
   set X `ls -Lt "$srcdir/configure" conftest.file 2> /dev/null`
   if test "$[*]" = "X"; then
      # -L didn't work.
      set X `ls -t "$srcdir/configure" conftest.file`
   fi
   rm -f conftest.file
   if test "$[*]" != "X $srcdir/configure conftest.file" \
      && test "$[*]" != "X conftest.file $srcdir/configure"; then
@@ -811,7 +765,13 @@
      AC_MSG_ERROR([ls -t appears to fail.  Make sure there is not a broken
alias in your environment])
   fi
     if test "$[2]" = conftest.file || test $am_try -eq 2; then
       break
     fi
     # Just in case.
     sleep 1
     am_has_slept=yes
   done
   test "$[2]" = conftest.file
   )
then
@@ -821,45 +781,117 @@
   AC_MSG_ERROR([newly created file is older than distributed files!
Check your system clock])
fi
AC_MSG_RESULT(yes)])
AC_MSG_RESULT([yes])
# If we didn't sleep, we still need to ensure time stamps of config.status and
# generated files are strictly newer.
am_sleep_pid=
if grep 'slept: no' conftest.file >/dev/null 2>&1; then
  ( sleep 1 ) &
  am_sleep_pid=$!
fi
AC_CONFIG_COMMANDS_PRE(
  [AC_MSG_CHECKING([that generated files are newer than configure])
   if test -n "$am_sleep_pid"; then
     # Hide warnings about reused PIDs.
     wait $am_sleep_pid 2>/dev/null
   fi
   AC_MSG_RESULT([done])])
rm -f conftest.file
])
# Copyright (C) 2001, 2003, 2005, 2011 Free Software Foundation, Inc.
# Copyright (C) 2009-2013 Free Software Foundation, Inc.
#
# This file is free software; the Free Software Foundation
# gives unlimited permission to copy and/or distribute it,
# with or without modifications, as long as this notice is preserved.
# serial 1
# AM_SILENT_RULES([DEFAULT])
# --------------------------
# Enable less verbose build rules; with the default set to DEFAULT
# ("yes" being less verbose, "no" or empty being verbose).
AC_DEFUN([AM_SILENT_RULES],
[AC_ARG_ENABLE([silent-rules], [dnl
AS_HELP_STRING(
  [--enable-silent-rules],
  [less verbose build output (undo: "make V=1")])
AS_HELP_STRING(
  [--disable-silent-rules],
  [verbose build output (undo: "make V=0")])dnl
])
case $enable_silent_rules in @%:@ (((
  yes) AM_DEFAULT_VERBOSITY=0;;
   no) AM_DEFAULT_VERBOSITY=1;;
    *) AM_DEFAULT_VERBOSITY=m4_if([$1], [yes], [0], [1]);;
esac
dnl
dnl A few 'make' implementations (e.g., NonStop OS and NextStep)
dnl do not support nested variable expansions.
dnl See automake bug#9928 and bug#10237.
am_make=${MAKE-make}
AC_CACHE_CHECK([whether $am_make supports nested variables],
   [am_cv_make_support_nested_variables],
   [if AS_ECHO([['TRUE=$(BAR$(V))
BAR0=false
BAR1=true
V=1
am__doit:
    @$(TRUE)
.PHONY: am__doit']]) | $am_make -f - >/dev/null 2>&1; then
  am_cv_make_support_nested_variables=yes
else
  am_cv_make_support_nested_variables=no
fi])
if test $am_cv_make_support_nested_variables = yes; then
  dnl Using '$V' instead of '$(V)' breaks IRIX make.
  AM_V='$(V)'
  AM_DEFAULT_V='$(AM_DEFAULT_VERBOSITY)'
else
  AM_V=$AM_DEFAULT_VERBOSITY
  AM_DEFAULT_V=$AM_DEFAULT_VERBOSITY
fi
AC_SUBST([AM_V])dnl
AM_SUBST_NOTMAKE([AM_V])dnl
AC_SUBST([AM_DEFAULT_V])dnl
AM_SUBST_NOTMAKE([AM_DEFAULT_V])dnl
AC_SUBST([AM_DEFAULT_VERBOSITY])dnl
AM_BACKSLASH='\'
AC_SUBST([AM_BACKSLASH])dnl
_AM_SUBST_NOTMAKE([AM_BACKSLASH])dnl
])
# Copyright (C) 2001-2013 Free Software Foundation, Inc.
#
# This file is free software; the Free Software Foundation
# gives unlimited permission to copy and/or distribute it,
# with or without modifications, as long as this notice is preserved.
# AM_PROG_INSTALL_STRIP
# ---------------------
# One issue with vendor `install' (even GNU) is that you can't
# One issue with vendor 'install' (even GNU) is that you can't
# specify the program used to strip binaries.  This is especially
# annoying in cross-compiling environments, where the build's strip
# is unlikely to handle the host's binaries.
# Fortunately install-sh will honor a STRIPPROG variable, so we
# always use install-sh in `make install-strip', and initialize
# always use install-sh in "make install-strip", and initialize
# STRIPPROG with the value of the STRIP variable (set by the user).
AC_DEFUN([AM_PROG_INSTALL_STRIP],
[AC_REQUIRE([AM_PROG_INSTALL_SH])dnl
# Installed binaries are usually stripped using `strip' when the user
# run `make install-strip'.  However `strip' might not be the right
# Installed binaries are usually stripped using 'strip' when the user
# run "make install-strip".  However 'strip' might not be the right
# tool to use in cross-compilation environments, therefore Automake
# will honor the `STRIP' environment variable to overrule this program.
dnl Don't test for $cross_compiling = yes, because it might be `maybe'.
# will honor the 'STRIP' environment variable to overrule this program.
dnl Don't test for $cross_compiling = yes, because it might be 'maybe'.
if test "$cross_compiling" != no; then
  AC_CHECK_TOOL([STRIP], [strip], :)
fi
INSTALL_STRIP_PROGRAM="\$(install_sh) -c -s"
AC_SUBST([INSTALL_STRIP_PROGRAM])])
# Copyright (C) 2006, 2008, 2010 Free Software Foundation, Inc.
# Copyright (C) 2006-2013 Free Software Foundation, Inc.
#
# This file is free software; the Free Software Foundation
# gives unlimited permission to copy and/or distribute it,
# with or without modifications, as long as this notice is preserved.
# serial 3
# _AM_SUBST_NOTMAKE(VARIABLE)
# ---------------------------
@@ -874,18 +906,16 @@
# Check how to create a tarball.                            -*- Autoconf -*-
# Copyright (C) 2004, 2005, 2012 Free Software Foundation, Inc.
# Copyright (C) 2004-2013 Free Software Foundation, Inc.
#
# This file is free software; the Free Software Foundation
# gives unlimited permission to copy and/or distribute it,
# with or without modifications, as long as this notice is preserved.
# serial 2
# _AM_PROG_TAR(FORMAT)
# --------------------
# Check how to create a tarball in format FORMAT.
# FORMAT should be one of `v7', `ustar', or `pax'.
# FORMAT should be one of 'v7', 'ustar', or 'pax'.
#
# Substitute a variable $(am__tar) that is a command
# writing to stdout a FORMAT-tarball containing the directory
@@ -895,26 +925,62 @@
# Substitute a variable $(am__untar) that extract such
# a tarball read from stdin.
#     $(am__untar) < result.tar
#
AC_DEFUN([_AM_PROG_TAR],
[# Always define AMTAR for backward compatibility.  Yes, it's still used
# in the wild :-(  We should find a proper way to deprecate it ...
AC_SUBST([AMTAR], ['$${TAR-tar}'])
# We'll loop over all known methods to create a tar archive until one works.
_am_tools='gnutar m4_if([$1], [ustar], [plaintar]) pax cpio none'
m4_if([$1], [v7],
     [am__tar='$${TAR-tar} chof - "$$tardir"' am__untar='$${TAR-tar} xf -'],
     [m4_case([$1], [ustar],, [pax],,
  [m4_case([$1],
    [ustar],
     [# The POSIX 1988 'ustar' format is defined with fixed-size fields.
      # There is notably a 21 bits limit for the UID and the GID.  In fact,
      # the 'pax' utility can hang on bigger UID/GID (see automake bug#8343
      # and bug#13588).
      am_max_uid=2097151 # 2^21 - 1
      am_max_gid=$am_max_uid
      # The $UID and $GID variables are not portable, so we need to resort
      # to the POSIX-mandated id(1) utility.  Errors in the 'id' calls
      # below are definitely unexpected, so allow the users to see them
      # (that is, avoid stderr redirection).
      am_uid=`id -u || echo unknown`
      am_gid=`id -g || echo unknown`
      AC_MSG_CHECKING([whether UID '$am_uid' is supported by ustar format])
      if test $am_uid -le $am_max_uid; then
         AC_MSG_RESULT([yes])
      else
         AC_MSG_RESULT([no])
         _am_tools=none
      fi
      AC_MSG_CHECKING([whether GID '$am_gid' is supported by ustar format])
      if test $am_gid -le $am_max_gid; then
         AC_MSG_RESULT([yes])
      else
        AC_MSG_RESULT([no])
        _am_tools=none
      fi],
  [pax],
    [],
              [m4_fatal([Unknown tar format])])
AC_MSG_CHECKING([how to create a $1 tar archive])
# Loop over all known methods to create a tar archive until one works.
_am_tools='gnutar m4_if([$1], [ustar], [plaintar]) pax cpio none'
  # Go ahead even if we have the value already cached.  We do so because we
  # need to set the values for the 'am__tar' and 'am__untar' variables.
_am_tools=${am_cv_prog_tar_$1-$_am_tools}
# Do not fold the above two line into one, because Tru64 sh and
# Solaris sh will not grok spaces in the rhs of `-'.
for _am_tool in $_am_tools
do
  for _am_tool in $_am_tools; do
  case $_am_tool in
  gnutar)
    for _am_tar in tar gnutar gtar;
    do
      for _am_tar in tar gnutar gtar; do
      AM_RUN_LOG([$_am_tar --version]) && break
    done
    am__tar="$_am_tar --format=m4_if([$1], [pax], [posix], [$1]) -chf - "'"$$tardir"'
@@ -950,7 +1016,7 @@
  # and am__untar set.
  test -n "${am_cv_prog_tar_$1}" && break
  # tar/untar a dummy directory, and stop if the command works
    # tar/untar a dummy directory, and stop if the command works.
  rm -rf conftest.dir
  mkdir conftest.dir
  echo GrepMe > conftest.dir/file
@@ -958,6 +1024,7 @@
  rm -rf conftest.dir
  if test -s conftest.tar; then
    AM_RUN_LOG([$am__untar <conftest.tar])
      AM_RUN_LOG([cat conftest.dir/file])
    grep GrepMe conftest.dir/file >/dev/null 2>&1 && break
  fi
done
@@ -965,6 +1032,7 @@
AC_CACHE_VAL([am_cv_prog_tar_$1], [am_cv_prog_tar_$1=$_am_tool])
AC_MSG_RESULT([$am_cv_prog_tar_$1])])
AC_SUBST([am__tar])
AC_SUBST([am__untar])
]) # _AM_PROG_TAR
depcomp
File was deleted
depcomp
New file
@@ -0,0 +1,791 @@
#! /bin/sh
# depcomp - compile a program generating dependencies as side-effects
scriptversion=2013-05-30.07; # UTC
# Copyright (C) 1999-2013 Free Software Foundation, Inc.
# This program is free software; you can redistribute it and/or modify
# it under the terms of the GNU General Public License as published by
# the Free Software Foundation; either version 2, or (at your option)
# any later version.
# This program is distributed in the hope that it will be useful,
# but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
# MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the
# GNU General Public License for more details.
# You should have received a copy of the GNU General Public License
# along with this program.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
# As a special exception to the GNU General Public License, if you
# distribute this file as part of a program that contains a
# configuration script generated by Autoconf, you may include it under
# the same distribution terms that you use for the rest of that program.
# Originally written by Alexandre Oliva <oliva@dcc.unicamp.br>.
case $1 in
  '')
    echo "$0: No command.  Try '$0 --help' for more information." 1>&2
    exit 1;
    ;;
  -h | --h*)
    cat <<\EOF
Usage: depcomp [--help] [--version] PROGRAM [ARGS]
Run PROGRAMS ARGS to compile a file, generating dependencies
as side-effects.
Environment variables:
  depmode     Dependency tracking mode.
  source      Source file read by 'PROGRAMS ARGS'.
  object      Object file output by 'PROGRAMS ARGS'.
  DEPDIR      directory where to store dependencies.
  depfile     Dependency file to output.
  tmpdepfile  Temporary file to use when outputting dependencies.
  libtool     Whether libtool is used (yes/no).
Report bugs to <bug-automake@gnu.org>.
EOF
    exit $?
    ;;
  -v | --v*)
    echo "depcomp $scriptversion"
    exit $?
    ;;
esac
# Get the directory component of the given path, and save it in the
# global variables '$dir'.  Note that this directory component will
# be either empty or ending with a '/' character.  This is deliberate.
set_dir_from ()
{
  case $1 in
    */*) dir=`echo "$1" | sed -e 's|/[^/]*$|/|'`;;
      *) dir=;;
  esac
}
# Get the suffix-stripped basename of the given path, and save it the
# global variable '$base'.
set_base_from ()
{
  base=`echo "$1" | sed -e 's|^.*/||' -e 's/\.[^.]*$//'`
}
# If no dependency file was actually created by the compiler invocation,
# we still have to create a dummy depfile, to avoid errors with the
# Makefile "include basename.Plo" scheme.
make_dummy_depfile ()
{
  echo "#dummy" > "$depfile"
}
# Factor out some common post-processing of the generated depfile.
# Requires the auxiliary global variable '$tmpdepfile' to be set.
aix_post_process_depfile ()
{
  # If the compiler actually managed to produce a dependency file,
  # post-process it.
  if test -f "$tmpdepfile"; then
    # Each line is of the form 'foo.o: dependency.h'.
    # Do two passes, one to just change these to
    #   $object: dependency.h
    # and one to simply output
    #   dependency.h:
    # which is needed to avoid the deleted-header problem.
    { sed -e "s,^.*\.[$lower]*:,$object:," < "$tmpdepfile"
      sed -e "s,^.*\.[$lower]*:[$tab ]*,," -e 's,$,:,' < "$tmpdepfile"
    } > "$depfile"
    rm -f "$tmpdepfile"
  else
    make_dummy_depfile
  fi
}
# A tabulation character.
tab='    '
# A newline character.
nl='
'
# Character ranges might be problematic outside the C locale.
# These definitions help.
upper=ABCDEFGHIJKLMNOPQRSTUVWXYZ
lower=abcdefghijklmnopqrstuvwxyz
digits=0123456789
alpha=${upper}${lower}
if test -z "$depmode" || test -z "$source" || test -z "$object"; then
  echo "depcomp: Variables source, object and depmode must be set" 1>&2
  exit 1
fi
# Dependencies for sub/bar.o or sub/bar.obj go into sub/.deps/bar.Po.
depfile=${depfile-`echo "$object" |
  sed 's|[^\\/]*$|'${DEPDIR-.deps}'/&|;s|\.\([^.]*\)$|.P\1|;s|Pobj$|Po|'`}
tmpdepfile=${tmpdepfile-`echo "$depfile" | sed 's/\.\([^.]*\)$/.T\1/'`}
rm -f "$tmpdepfile"
# Avoid interferences from the environment.
gccflag= dashmflag=
# Some modes work just like other modes, but use different flags.  We
# parameterize here, but still list the modes in the big case below,
# to make depend.m4 easier to write.  Note that we *cannot* use a case
# here, because this file can only contain one case statement.
if test "$depmode" = hp; then
  # HP compiler uses -M and no extra arg.
  gccflag=-M
  depmode=gcc
fi
if test "$depmode" = dashXmstdout; then
  # This is just like dashmstdout with a different argument.
  dashmflag=-xM
  depmode=dashmstdout
fi
cygpath_u="cygpath -u -f -"
if test "$depmode" = msvcmsys; then
  # This is just like msvisualcpp but w/o cygpath translation.
  # Just convert the backslash-escaped backslashes to single forward
  # slashes to satisfy depend.m4
  cygpath_u='sed s,\\\\,/,g'
  depmode=msvisualcpp
fi
if test "$depmode" = msvc7msys; then
  # This is just like msvc7 but w/o cygpath translation.
  # Just convert the backslash-escaped backslashes to single forward
  # slashes to satisfy depend.m4
  cygpath_u='sed s,\\\\,/,g'
  depmode=msvc7
fi
if test "$depmode" = xlc; then
  # IBM C/C++ Compilers xlc/xlC can output gcc-like dependency information.
  gccflag=-qmakedep=gcc,-MF
  depmode=gcc
fi
case "$depmode" in
gcc3)
## gcc 3 implements dependency tracking that does exactly what
## we want.  Yay!  Note: for some reason libtool 1.4 doesn't like
## it if -MD -MP comes after the -MF stuff.  Hmm.
## Unfortunately, FreeBSD c89 acceptance of flags depends upon
## the command line argument order; so add the flags where they
## appear in depend2.am.  Note that the slowdown incurred here
## affects only configure: in makefiles, %FASTDEP% shortcuts this.
  for arg
  do
    case $arg in
    -c) set fnord "$@" -MT "$object" -MD -MP -MF "$tmpdepfile" "$arg" ;;
    *)  set fnord "$@" "$arg" ;;
    esac
    shift # fnord
    shift # $arg
  done
  "$@"
  stat=$?
  if test $stat -ne 0; then
    rm -f "$tmpdepfile"
    exit $stat
  fi
  mv "$tmpdepfile" "$depfile"
  ;;
gcc)
## Note that this doesn't just cater to obsosete pre-3.x GCC compilers.
## but also to in-use compilers like IMB xlc/xlC and the HP C compiler.
## (see the conditional assignment to $gccflag above).
## There are various ways to get dependency output from gcc.  Here's
## why we pick this rather obscure method:
## - Don't want to use -MD because we'd like the dependencies to end
##   up in a subdir.  Having to rename by hand is ugly.
##   (We might end up doing this anyway to support other compilers.)
## - The DEPENDENCIES_OUTPUT environment variable makes gcc act like
##   -MM, not -M (despite what the docs say).  Also, it might not be
##   supported by the other compilers which use the 'gcc' depmode.
## - Using -M directly means running the compiler twice (even worse
##   than renaming).
  if test -z "$gccflag"; then
    gccflag=-MD,
  fi
  "$@" -Wp,"$gccflag$tmpdepfile"
  stat=$?
  if test $stat -ne 0; then
    rm -f "$tmpdepfile"
    exit $stat
  fi
  rm -f "$depfile"
  echo "$object : \\" > "$depfile"
  # The second -e expression handles DOS-style file names with drive
  # letters.
  sed -e 's/^[^:]*: / /' \
      -e 's/^['$alpha']:\/[^:]*: / /' < "$tmpdepfile" >> "$depfile"
## This next piece of magic avoids the "deleted header file" problem.
## The problem is that when a header file which appears in a .P file
## is deleted, the dependency causes make to die (because there is
## typically no way to rebuild the header).  We avoid this by adding
## dummy dependencies for each header file.  Too bad gcc doesn't do
## this for us directly.
## Some versions of gcc put a space before the ':'.  On the theory
## that the space means something, we add a space to the output as
## well.  hp depmode also adds that space, but also prefixes the VPATH
## to the object.  Take care to not repeat it in the output.
## Some versions of the HPUX 10.20 sed can't process this invocation
## correctly.  Breaking it into two sed invocations is a workaround.
  tr ' ' "$nl" < "$tmpdepfile" \
    | sed -e 's/^\\$//' -e '/^$/d' -e "s|.*$object$||" -e '/:$/d' \
    | sed -e 's/$/ :/' >> "$depfile"
  rm -f "$tmpdepfile"
  ;;
hp)
  # This case exists only to let depend.m4 do its work.  It works by
  # looking at the text of this script.  This case will never be run,
  # since it is checked for above.
  exit 1
  ;;
sgi)
  if test "$libtool" = yes; then
    "$@" "-Wp,-MDupdate,$tmpdepfile"
  else
    "$@" -MDupdate "$tmpdepfile"
  fi
  stat=$?
  if test $stat -ne 0; then
    rm -f "$tmpdepfile"
    exit $stat
  fi
  rm -f "$depfile"
  if test -f "$tmpdepfile"; then  # yes, the sourcefile depend on other files
    echo "$object : \\" > "$depfile"
    # Clip off the initial element (the dependent).  Don't try to be
    # clever and replace this with sed code, as IRIX sed won't handle
    # lines with more than a fixed number of characters (4096 in
    # IRIX 6.2 sed, 8192 in IRIX 6.5).  We also remove comment lines;
    # the IRIX cc adds comments like '#:fec' to the end of the
    # dependency line.
    tr ' ' "$nl" < "$tmpdepfile" \
      | sed -e 's/^.*\.o://' -e 's/#.*$//' -e '/^$/ d' \
      | tr "$nl" ' ' >> "$depfile"
    echo >> "$depfile"
    # The second pass generates a dummy entry for each header file.
    tr ' ' "$nl" < "$tmpdepfile" \
      | sed -e 's/^.*\.o://' -e 's/#.*$//' -e '/^$/ d' -e 's/$/:/' \
      >> "$depfile"
  else
    make_dummy_depfile
  fi
  rm -f "$tmpdepfile"
  ;;
xlc)
  # This case exists only to let depend.m4 do its work.  It works by
  # looking at the text of this script.  This case will never be run,
  # since it is checked for above.
  exit 1
  ;;
aix)
  # The C for AIX Compiler uses -M and outputs the dependencies
  # in a .u file.  In older versions, this file always lives in the
  # current directory.  Also, the AIX compiler puts '$object:' at the
  # start of each line; $object doesn't have directory information.
  # Version 6 uses the directory in both cases.
  set_dir_from "$object"
  set_base_from "$object"
  if test "$libtool" = yes; then
    tmpdepfile1=$dir$base.u
    tmpdepfile2=$base.u
    tmpdepfile3=$dir.libs/$base.u
    "$@" -Wc,-M
  else
    tmpdepfile1=$dir$base.u
    tmpdepfile2=$dir$base.u
    tmpdepfile3=$dir$base.u
    "$@" -M
  fi
  stat=$?
  if test $stat -ne 0; then
    rm -f "$tmpdepfile1" "$tmpdepfile2" "$tmpdepfile3"
    exit $stat
  fi
  for tmpdepfile in "$tmpdepfile1" "$tmpdepfile2" "$tmpdepfile3"
  do
    test -f "$tmpdepfile" && break
  done
  aix_post_process_depfile
  ;;
tcc)
  # tcc (Tiny C Compiler) understand '-MD -MF file' since version 0.9.26
  # FIXME: That version still under development at the moment of writing.
  #        Make that this statement remains true also for stable, released
  #        versions.
  # It will wrap lines (doesn't matter whether long or short) with a
  # trailing '\', as in:
  #
  #   foo.o : \
  #    foo.c \
  #    foo.h \
  #
  # It will put a trailing '\' even on the last line, and will use leading
  # spaces rather than leading tabs (at least since its commit 0394caf7
  # "Emit spaces for -MD").
  "$@" -MD -MF "$tmpdepfile"
  stat=$?
  if test $stat -ne 0; then
    rm -f "$tmpdepfile"
    exit $stat
  fi
  rm -f "$depfile"
  # Each non-empty line is of the form 'foo.o : \' or ' dep.h \'.
  # We have to change lines of the first kind to '$object: \'.
  sed -e "s|.*:|$object :|" < "$tmpdepfile" > "$depfile"
  # And for each line of the second kind, we have to emit a 'dep.h:'
  # dummy dependency, to avoid the deleted-header problem.
  sed -n -e 's|^  *\(.*\) *\\$|\1:|p' < "$tmpdepfile" >> "$depfile"
  rm -f "$tmpdepfile"
  ;;
## The order of this option in the case statement is important, since the
## shell code in configure will try each of these formats in the order
## listed in this file.  A plain '-MD' option would be understood by many
## compilers, so we must ensure this comes after the gcc and icc options.
pgcc)
  # Portland's C compiler understands '-MD'.
  # Will always output deps to 'file.d' where file is the root name of the
  # source file under compilation, even if file resides in a subdirectory.
  # The object file name does not affect the name of the '.d' file.
  # pgcc 10.2 will output
  #    foo.o: sub/foo.c sub/foo.h
  # and will wrap long lines using '\' :
  #    foo.o: sub/foo.c ... \
  #     sub/foo.h ... \
  #     ...
  set_dir_from "$object"
  # Use the source, not the object, to determine the base name, since
  # that's sadly what pgcc will do too.
  set_base_from "$source"
  tmpdepfile=$base.d
  # For projects that build the same source file twice into different object
  # files, the pgcc approach of using the *source* file root name can cause
  # problems in parallel builds.  Use a locking strategy to avoid stomping on
  # the same $tmpdepfile.
  lockdir=$base.d-lock
  trap "
    echo '$0: caught signal, cleaning up...' >&2
    rmdir '$lockdir'
    exit 1
  " 1 2 13 15
  numtries=100
  i=$numtries
  while test $i -gt 0; do
    # mkdir is a portable test-and-set.
    if mkdir "$lockdir" 2>/dev/null; then
      # This process acquired the lock.
      "$@" -MD
      stat=$?
      # Release the lock.
      rmdir "$lockdir"
      break
    else
      # If the lock is being held by a different process, wait
      # until the winning process is done or we timeout.
      while test -d "$lockdir" && test $i -gt 0; do
        sleep 1
        i=`expr $i - 1`
      done
    fi
    i=`expr $i - 1`
  done
  trap - 1 2 13 15
  if test $i -le 0; then
    echo "$0: failed to acquire lock after $numtries attempts" >&2
    echo "$0: check lockdir '$lockdir'" >&2
    exit 1
  fi
  if test $stat -ne 0; then
    rm -f "$tmpdepfile"
    exit $stat
  fi
  rm -f "$depfile"
  # Each line is of the form `foo.o: dependent.h',
  # or `foo.o: dep1.h dep2.h \', or ` dep3.h dep4.h \'.
  # Do two passes, one to just change these to
  # `$object: dependent.h' and one to simply `dependent.h:'.
  sed "s,^[^:]*:,$object :," < "$tmpdepfile" > "$depfile"
  # Some versions of the HPUX 10.20 sed can't process this invocation
  # correctly.  Breaking it into two sed invocations is a workaround.
  sed 's,^[^:]*: \(.*\)$,\1,;s/^\\$//;/^$/d;/:$/d' < "$tmpdepfile" \
    | sed -e 's/$/ :/' >> "$depfile"
  rm -f "$tmpdepfile"
  ;;
hp2)
  # The "hp" stanza above does not work with aCC (C++) and HP's ia64
  # compilers, which have integrated preprocessors.  The correct option
  # to use with these is +Maked; it writes dependencies to a file named
  # 'foo.d', which lands next to the object file, wherever that
  # happens to be.
  # Much of this is similar to the tru64 case; see comments there.
  set_dir_from  "$object"
  set_base_from "$object"
  if test "$libtool" = yes; then
    tmpdepfile1=$dir$base.d
    tmpdepfile2=$dir.libs/$base.d
    "$@" -Wc,+Maked
  else
    tmpdepfile1=$dir$base.d
    tmpdepfile2=$dir$base.d
    "$@" +Maked
  fi
  stat=$?
  if test $stat -ne 0; then
     rm -f "$tmpdepfile1" "$tmpdepfile2"
     exit $stat
  fi
  for tmpdepfile in "$tmpdepfile1" "$tmpdepfile2"
  do
    test -f "$tmpdepfile" && break
  done
  if test -f "$tmpdepfile"; then
    sed -e "s,^.*\.[$lower]*:,$object:," "$tmpdepfile" > "$depfile"
    # Add 'dependent.h:' lines.
    sed -ne '2,${
               s/^ *//
               s/ \\*$//
               s/$/:/
               p
             }' "$tmpdepfile" >> "$depfile"
  else
    make_dummy_depfile
  fi
  rm -f "$tmpdepfile" "$tmpdepfile2"
  ;;
tru64)
  # The Tru64 compiler uses -MD to generate dependencies as a side
  # effect.  'cc -MD -o foo.o ...' puts the dependencies into 'foo.o.d'.
  # At least on Alpha/Redhat 6.1, Compaq CCC V6.2-504 seems to put
  # dependencies in 'foo.d' instead, so we check for that too.
  # Subdirectories are respected.
  set_dir_from  "$object"
  set_base_from "$object"
  if test "$libtool" = yes; then
    # Libtool generates 2 separate objects for the 2 libraries.  These
    # two compilations output dependencies in $dir.libs/$base.o.d and
    # in $dir$base.o.d.  We have to check for both files, because
    # one of the two compilations can be disabled.  We should prefer
    # $dir$base.o.d over $dir.libs/$base.o.d because the latter is
    # automatically cleaned when .libs/ is deleted, while ignoring
    # the former would cause a distcleancheck panic.
    tmpdepfile1=$dir$base.o.d          # libtool 1.5
    tmpdepfile2=$dir.libs/$base.o.d    # Likewise.
    tmpdepfile3=$dir.libs/$base.d      # Compaq CCC V6.2-504
    "$@" -Wc,-MD
  else
    tmpdepfile1=$dir$base.d
    tmpdepfile2=$dir$base.d
    tmpdepfile3=$dir$base.d
    "$@" -MD
  fi
  stat=$?
  if test $stat -ne 0; then
    rm -f "$tmpdepfile1" "$tmpdepfile2" "$tmpdepfile3"
    exit $stat
  fi
  for tmpdepfile in "$tmpdepfile1" "$tmpdepfile2" "$tmpdepfile3"
  do
    test -f "$tmpdepfile" && break
  done
  # Same post-processing that is required for AIX mode.
  aix_post_process_depfile
  ;;
msvc7)
  if test "$libtool" = yes; then
    showIncludes=-Wc,-showIncludes
  else
    showIncludes=-showIncludes
  fi
  "$@" $showIncludes > "$tmpdepfile"
  stat=$?
  grep -v '^Note: including file: ' "$tmpdepfile"
  if test $stat -ne 0; then
    rm -f "$tmpdepfile"
    exit $stat
  fi
  rm -f "$depfile"
  echo "$object : \\" > "$depfile"
  # The first sed program below extracts the file names and escapes
  # backslashes for cygpath.  The second sed program outputs the file
  # name when reading, but also accumulates all include files in the
  # hold buffer in order to output them again at the end.  This only
  # works with sed implementations that can handle large buffers.
  sed < "$tmpdepfile" -n '
/^Note: including file:  *\(.*\)/ {
  s//\1/
  s/\\/\\\\/g
  p
}' | $cygpath_u | sort -u | sed -n '
s/ /\\ /g
s/\(.*\)/'"$tab"'\1 \\/p
s/.\(.*\) \\/\1:/
H
$ {
  s/.*/'"$tab"'/
  G
  p
}' >> "$depfile"
  echo >> "$depfile" # make sure the fragment doesn't end with a backslash
  rm -f "$tmpdepfile"
  ;;
msvc7msys)
  # This case exists only to let depend.m4 do its work.  It works by
  # looking at the text of this script.  This case will never be run,
  # since it is checked for above.
  exit 1
  ;;
#nosideeffect)
  # This comment above is used by automake to tell side-effect
  # dependency tracking mechanisms from slower ones.
dashmstdout)
  # Important note: in order to support this mode, a compiler *must*
  # always write the preprocessed file to stdout, regardless of -o.
  "$@" || exit $?
  # Remove the call to Libtool.
  if test "$libtool" = yes; then
    while test "X$1" != 'X--mode=compile'; do
      shift
    done
    shift
  fi
  # Remove '-o $object'.
  IFS=" "
  for arg
  do
    case $arg in
    -o)
      shift
      ;;
    $object)
      shift
      ;;
    *)
      set fnord "$@" "$arg"
      shift # fnord
      shift # $arg
      ;;
    esac
  done
  test -z "$dashmflag" && dashmflag=-M
  # Require at least two characters before searching for ':'
  # in the target name.  This is to cope with DOS-style filenames:
  # a dependency such as 'c:/foo/bar' could be seen as target 'c' otherwise.
  "$@" $dashmflag |
    sed "s|^[$tab ]*[^:$tab ][^:][^:]*:[$tab ]*|$object: |" > "$tmpdepfile"
  rm -f "$depfile"
  cat < "$tmpdepfile" > "$depfile"
  # Some versions of the HPUX 10.20 sed can't process this sed invocation
  # correctly.  Breaking it into two sed invocations is a workaround.
  tr ' ' "$nl" < "$tmpdepfile" \
    | sed -e 's/^\\$//' -e '/^$/d' -e '/:$/d' \
    | sed -e 's/$/ :/' >> "$depfile"
  rm -f "$tmpdepfile"
  ;;
dashXmstdout)
  # This case only exists to satisfy depend.m4.  It is never actually
  # run, as this mode is specially recognized in the preamble.
  exit 1
  ;;
makedepend)
  "$@" || exit $?
  # Remove any Libtool call
  if test "$libtool" = yes; then
    while test "X$1" != 'X--mode=compile'; do
      shift
    done
    shift
  fi
  # X makedepend
  shift
  cleared=no eat=no
  for arg
  do
    case $cleared in
    no)
      set ""; shift
      cleared=yes ;;
    esac
    if test $eat = yes; then
      eat=no
      continue
    fi
    case "$arg" in
    -D*|-I*)
      set fnord "$@" "$arg"; shift ;;
    # Strip any option that makedepend may not understand.  Remove
    # the object too, otherwise makedepend will parse it as a source file.
    -arch)
      eat=yes ;;
    -*|$object)
      ;;
    *)
      set fnord "$@" "$arg"; shift ;;
    esac
  done
  obj_suffix=`echo "$object" | sed 's/^.*\././'`
  touch "$tmpdepfile"
  ${MAKEDEPEND-makedepend} -o"$obj_suffix" -f"$tmpdepfile" "$@"
  rm -f "$depfile"
  # makedepend may prepend the VPATH from the source file name to the object.
  # No need to regex-escape $object, excess matching of '.' is harmless.
  sed "s|^.*\($object *:\)|\1|" "$tmpdepfile" > "$depfile"
  # Some versions of the HPUX 10.20 sed can't process the last invocation
  # correctly.  Breaking it into two sed invocations is a workaround.
  sed '1,2d' "$tmpdepfile" \
    | tr ' ' "$nl" \
    | sed -e 's/^\\$//' -e '/^$/d' -e '/:$/d' \
    | sed -e 's/$/ :/' >> "$depfile"
  rm -f "$tmpdepfile" "$tmpdepfile".bak
  ;;
cpp)
  # Important note: in order to support this mode, a compiler *must*
  # always write the preprocessed file to stdout.
  "$@" || exit $?
  # Remove the call to Libtool.
  if test "$libtool" = yes; then
    while test "X$1" != 'X--mode=compile'; do
      shift
    done
    shift
  fi
  # Remove '-o $object'.
  IFS=" "
  for arg
  do
    case $arg in
    -o)
      shift
      ;;
    $object)
      shift
      ;;
    *)
      set fnord "$@" "$arg"
      shift # fnord
      shift # $arg
      ;;
    esac
  done
  "$@" -E \
    | sed -n -e '/^# [0-9][0-9]* "\([^"]*\)".*/ s:: \1 \\:p' \
             -e '/^#line [0-9][0-9]* "\([^"]*\)".*/ s:: \1 \\:p' \
    | sed '$ s: \\$::' > "$tmpdepfile"
  rm -f "$depfile"
  echo "$object : \\" > "$depfile"
  cat < "$tmpdepfile" >> "$depfile"
  sed < "$tmpdepfile" '/^$/d;s/^ //;s/ \\$//;s/$/ :/' >> "$depfile"
  rm -f "$tmpdepfile"
  ;;
msvisualcpp)
  # Important note: in order to support this mode, a compiler *must*
  # always write the preprocessed file to stdout.
  "$@" || exit $?
  # Remove the call to Libtool.
  if test "$libtool" = yes; then
    while test "X$1" != 'X--mode=compile'; do
      shift
    done
    shift
  fi
  IFS=" "
  for arg
  do
    case "$arg" in
    -o)
      shift
      ;;
    $object)
      shift
      ;;
    "-Gm"|"/Gm"|"-Gi"|"/Gi"|"-ZI"|"/ZI")
        set fnord "$@"
        shift
        shift
        ;;
    *)
        set fnord "$@" "$arg"
        shift
        shift
        ;;
    esac
  done
  "$@" -E 2>/dev/null |
  sed -n '/^#line [0-9][0-9]* "\([^"]*\)"/ s::\1:p' | $cygpath_u | sort -u > "$tmpdepfile"
  rm -f "$depfile"
  echo "$object : \\" > "$depfile"
  sed < "$tmpdepfile" -n -e 's% %\\ %g' -e '/^\(.*\)$/ s::'"$tab"'\1 \\:p' >> "$depfile"
  echo "$tab" >> "$depfile"
  sed < "$tmpdepfile" -n -e 's% %\\ %g' -e '/^\(.*\)$/ s::\1\::p' >> "$depfile"
  rm -f "$tmpdepfile"
  ;;
msvcmsys)
  # This case exists only to let depend.m4 do its work.  It works by
  # looking at the text of this script.  This case will never be run,
  # since it is checked for above.
  exit 1
  ;;
none)
  exec "$@"
  ;;
*)
  echo "Unknown depmode $depmode" 1>&2
  exit 1
  ;;
esac
exit 0
# Local Variables:
# mode: shell-script
# sh-indentation: 2
# eval: (add-hook 'write-file-hooks 'time-stamp)
# time-stamp-start: "scriptversion="
# time-stamp-format: "%:y-%02m-%02d.%02H"
# time-stamp-time-zone: "UTC"
# time-stamp-end: "; # UTC"
# End:
install-sh
File was deleted
install-sh
New file
@@ -0,0 +1,527 @@
#!/bin/sh
# install - install a program, script, or datafile
scriptversion=2011-11-20.07; # UTC
# This originates from X11R5 (mit/util/scripts/install.sh), which was
# later released in X11R6 (xc/config/util/install.sh) with the
# following copyright and license.
#
# Copyright (C) 1994 X Consortium
#
# Permission is hereby granted, free of charge, to any person obtaining a copy
# of this software and associated documentation files (the "Software"), to
# deal in the Software without restriction, including without limitation the
# rights to use, copy, modify, merge, publish, distribute, sublicense, and/or
# sell copies of the Software, and to permit persons to whom the Software is
# furnished to do so, subject to the following conditions:
#
# The above copyright notice and this permission notice shall be included in
# all copies or substantial portions of the Software.
#
# THE SOFTWARE IS PROVIDED "AS IS", WITHOUT WARRANTY OF ANY KIND, EXPRESS OR
# IMPLIED, INCLUDING BUT NOT LIMITED TO THE WARRANTIES OF MERCHANTABILITY,
# FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE AND NONINFRINGEMENT.  IN NO EVENT SHALL THE
# X CONSORTIUM BE LIABLE FOR ANY CLAIM, DAMAGES OR OTHER LIABILITY, WHETHER IN
# AN ACTION OF CONTRACT, TORT OR OTHERWISE, ARISING FROM, OUT OF OR IN CONNEC-
# TION WITH THE SOFTWARE OR THE USE OR OTHER DEALINGS IN THE SOFTWARE.
#
# Except as contained in this notice, the name of the X Consortium shall not
# be used in advertising or otherwise to promote the sale, use or other deal-
# ings in this Software without prior written authorization from the X Consor-
# tium.
#
#
# FSF changes to this file are in the public domain.
#
# Calling this script install-sh is preferred over install.sh, to prevent
# 'make' implicit rules from creating a file called install from it
# when there is no Makefile.
#
# This script is compatible with the BSD install script, but was written
# from scratch.
nl='
'
IFS=" ""    $nl"
# set DOITPROG to echo to test this script
# Don't use :- since 4.3BSD and earlier shells don't like it.
doit=${DOITPROG-}
if test -z "$doit"; then
  doit_exec=exec
else
  doit_exec=$doit
fi
# Put in absolute file names if you don't have them in your path;
# or use environment vars.
chgrpprog=${CHGRPPROG-chgrp}
chmodprog=${CHMODPROG-chmod}
chownprog=${CHOWNPROG-chown}
cmpprog=${CMPPROG-cmp}
cpprog=${CPPROG-cp}
mkdirprog=${MKDIRPROG-mkdir}
mvprog=${MVPROG-mv}
rmprog=${RMPROG-rm}
stripprog=${STRIPPROG-strip}
posix_glob='?'
initialize_posix_glob='
  test "$posix_glob" != "?" || {
    if (set -f) 2>/dev/null; then
      posix_glob=
    else
      posix_glob=:
    fi
  }
'
posix_mkdir=
# Desired mode of installed file.
mode=0755
chgrpcmd=
chmodcmd=$chmodprog
chowncmd=
mvcmd=$mvprog
rmcmd="$rmprog -f"
stripcmd=
src=
dst=
dir_arg=
dst_arg=
copy_on_change=false
no_target_directory=
usage="\
Usage: $0 [OPTION]... [-T] SRCFILE DSTFILE
   or: $0 [OPTION]... SRCFILES... DIRECTORY
   or: $0 [OPTION]... -t DIRECTORY SRCFILES...
   or: $0 [OPTION]... -d DIRECTORIES...
In the 1st form, copy SRCFILE to DSTFILE.
In the 2nd and 3rd, copy all SRCFILES to DIRECTORY.
In the 4th, create DIRECTORIES.
Options:
     --help     display this help and exit.
     --version  display version info and exit.
  -c            (ignored)
  -C            install only if different (preserve the last data modification time)
  -d            create directories instead of installing files.
  -g GROUP      $chgrpprog installed files to GROUP.
  -m MODE       $chmodprog installed files to MODE.
  -o USER       $chownprog installed files to USER.
  -s            $stripprog installed files.
  -t DIRECTORY  install into DIRECTORY.
  -T            report an error if DSTFILE is a directory.
Environment variables override the default commands:
  CHGRPPROG CHMODPROG CHOWNPROG CMPPROG CPPROG MKDIRPROG MVPROG
  RMPROG STRIPPROG
"
while test $# -ne 0; do
  case $1 in
    -c) ;;
    -C) copy_on_change=true;;
    -d) dir_arg=true;;
    -g) chgrpcmd="$chgrpprog $2"
    shift;;
    --help) echo "$usage"; exit $?;;
    -m) mode=$2
    case $mode in
      *' '* | *'    '* | *'
'*      | *'*'* | *'?'* | *'['*)
        echo "$0: invalid mode: $mode" >&2
        exit 1;;
    esac
    shift;;
    -o) chowncmd="$chownprog $2"
    shift;;
    -s) stripcmd=$stripprog;;
    -t) dst_arg=$2
    # Protect names problematic for 'test' and other utilities.
    case $dst_arg in
      -* | [=\(\)!]) dst_arg=./$dst_arg;;
    esac
    shift;;
    -T) no_target_directory=true;;
    --version) echo "$0 $scriptversion"; exit $?;;
    --)    shift
    break;;
    -*)    echo "$0: invalid option: $1" >&2
    exit 1;;
    *)  break;;
  esac
  shift
done
if test $# -ne 0 && test -z "$dir_arg$dst_arg"; then
  # When -d is used, all remaining arguments are directories to create.
  # When -t is used, the destination is already specified.
  # Otherwise, the last argument is the destination.  Remove it from $@.
  for arg
  do
    if test -n "$dst_arg"; then
      # $@ is not empty: it contains at least $arg.
      set fnord "$@" "$dst_arg"
      shift # fnord
    fi
    shift # arg
    dst_arg=$arg
    # Protect names problematic for 'test' and other utilities.
    case $dst_arg in
      -* | [=\(\)!]) dst_arg=./$dst_arg;;
    esac
  done
fi
if test $# -eq 0; then
  if test -z "$dir_arg"; then
    echo "$0: no input file specified." >&2
    exit 1
  fi
  # It's OK to call 'install-sh -d' without argument.
  # This can happen when creating conditional directories.
  exit 0
fi
if test -z "$dir_arg"; then
  do_exit='(exit $ret); exit $ret'
  trap "ret=129; $do_exit" 1
  trap "ret=130; $do_exit" 2
  trap "ret=141; $do_exit" 13
  trap "ret=143; $do_exit" 15
  # Set umask so as not to create temps with too-generous modes.
  # However, 'strip' requires both read and write access to temps.
  case $mode in
    # Optimize common cases.
    *644) cp_umask=133;;
    *755) cp_umask=22;;
    *[0-7])
      if test -z "$stripcmd"; then
    u_plus_rw=
      else
    u_plus_rw='% 200'
      fi
      cp_umask=`expr '(' 777 - $mode % 1000 ')' $u_plus_rw`;;
    *)
      if test -z "$stripcmd"; then
    u_plus_rw=
      else
    u_plus_rw=,u+rw
      fi
      cp_umask=$mode$u_plus_rw;;
  esac
fi
for src
do
  # Protect names problematic for 'test' and other utilities.
  case $src in
    -* | [=\(\)!]) src=./$src;;
  esac
  if test -n "$dir_arg"; then
    dst=$src
    dstdir=$dst
    test -d "$dstdir"
    dstdir_status=$?
  else
    # Waiting for this to be detected by the "$cpprog $src $dsttmp" command
    # might cause directories to be created, which would be especially bad
    # if $src (and thus $dsttmp) contains '*'.
    if test ! -f "$src" && test ! -d "$src"; then
      echo "$0: $src does not exist." >&2
      exit 1
    fi
    if test -z "$dst_arg"; then
      echo "$0: no destination specified." >&2
      exit 1
    fi
    dst=$dst_arg
    # If destination is a directory, append the input filename; won't work
    # if double slashes aren't ignored.
    if test -d "$dst"; then
      if test -n "$no_target_directory"; then
    echo "$0: $dst_arg: Is a directory" >&2
    exit 1
      fi
      dstdir=$dst
      dst=$dstdir/`basename "$src"`
      dstdir_status=0
    else
      # Prefer dirname, but fall back on a substitute if dirname fails.
      dstdir=`
    (dirname "$dst") 2>/dev/null ||
    expr X"$dst" : 'X\(.*[^/]\)//*[^/][^/]*/*$' \| \
         X"$dst" : 'X\(//\)[^/]' \| \
         X"$dst" : 'X\(//\)$' \| \
         X"$dst" : 'X\(/\)' \| . 2>/dev/null ||
    echo X"$dst" |
        sed '/^X\(.*[^/]\)\/\/*[^/][^/]*\/*$/{
           s//\1/
           q
         }
         /^X\(\/\/\)[^/].*/{
           s//\1/
           q
         }
         /^X\(\/\/\)$/{
           s//\1/
           q
         }
         /^X\(\/\).*/{
           s//\1/
           q
         }
         s/.*/./; q'
      `
      test -d "$dstdir"
      dstdir_status=$?
    fi
  fi
  obsolete_mkdir_used=false
  if test $dstdir_status != 0; then
    case $posix_mkdir in
      '')
    # Create intermediate dirs using mode 755 as modified by the umask.
    # This is like FreeBSD 'install' as of 1997-10-28.
    umask=`umask`
    case $stripcmd.$umask in
      # Optimize common cases.
      *[2367][2367]) mkdir_umask=$umask;;
      .*0[02][02] | .[02][02] | .[02]) mkdir_umask=22;;
      *[0-7])
        mkdir_umask=`expr $umask + 22 \
          - $umask % 100 % 40 + $umask % 20 \
          - $umask % 10 % 4 + $umask % 2
        `;;
      *) mkdir_umask=$umask,go-w;;
    esac
    # With -d, create the new directory with the user-specified mode.
    # Otherwise, rely on $mkdir_umask.
    if test -n "$dir_arg"; then
      mkdir_mode=-m$mode
    else
      mkdir_mode=
    fi
    posix_mkdir=false
    case $umask in
      *[123567][0-7][0-7])
        # POSIX mkdir -p sets u+wx bits regardless of umask, which
        # is incompatible with FreeBSD 'install' when (umask & 300) != 0.
        ;;
      *)
        tmpdir=${TMPDIR-/tmp}/ins$RANDOM-$$
        trap 'ret=$?; rmdir "$tmpdir/d" "$tmpdir" 2>/dev/null; exit $ret' 0
        if (umask $mkdir_umask &&
        exec $mkdirprog $mkdir_mode -p -- "$tmpdir/d") >/dev/null 2>&1
        then
          if test -z "$dir_arg" || {
           # Check for POSIX incompatibilities with -m.
           # HP-UX 11.23 and IRIX 6.5 mkdir -m -p sets group- or
           # other-writable bit of parent directory when it shouldn't.
           # FreeBSD 6.1 mkdir -m -p sets mode of existing directory.
           ls_ld_tmpdir=`ls -ld "$tmpdir"`
           case $ls_ld_tmpdir in
             d????-?r-*) different_mode=700;;
             d????-?--*) different_mode=755;;
             *) false;;
           esac &&
           $mkdirprog -m$different_mode -p -- "$tmpdir" && {
             ls_ld_tmpdir_1=`ls -ld "$tmpdir"`
             test "$ls_ld_tmpdir" = "$ls_ld_tmpdir_1"
           }
         }
          then posix_mkdir=:
          fi
          rmdir "$tmpdir/d" "$tmpdir"
        else
          # Remove any dirs left behind by ancient mkdir implementations.
          rmdir ./$mkdir_mode ./-p ./-- 2>/dev/null
        fi
        trap '' 0;;
    esac;;
    esac
    if
      $posix_mkdir && (
    umask $mkdir_umask &&
    $doit_exec $mkdirprog $mkdir_mode -p -- "$dstdir"
      )
    then :
    else
      # The umask is ridiculous, or mkdir does not conform to POSIX,
      # or it failed possibly due to a race condition.  Create the
      # directory the slow way, step by step, checking for races as we go.
      case $dstdir in
    /*) prefix='/';;
    [-=\(\)!]*) prefix='./';;
    *)  prefix='';;
      esac
      eval "$initialize_posix_glob"
      oIFS=$IFS
      IFS=/
      $posix_glob set -f
      set fnord $dstdir
      shift
      $posix_glob set +f
      IFS=$oIFS
      prefixes=
      for d
      do
    test X"$d" = X && continue
    prefix=$prefix$d
    if test -d "$prefix"; then
      prefixes=
    else
      if $posix_mkdir; then
        (umask=$mkdir_umask &&
         $doit_exec $mkdirprog $mkdir_mode -p -- "$dstdir") && break
        # Don't fail if two instances are running concurrently.
        test -d "$prefix" || exit 1
      else
        case $prefix in
          *\'*) qprefix=`echo "$prefix" | sed "s/'/'\\\\\\\\''/g"`;;
          *) qprefix=$prefix;;
        esac
        prefixes="$prefixes '$qprefix'"
      fi
    fi
    prefix=$prefix/
      done
      if test -n "$prefixes"; then
    # Don't fail if two instances are running concurrently.
    (umask $mkdir_umask &&
     eval "\$doit_exec \$mkdirprog $prefixes") ||
      test -d "$dstdir" || exit 1
    obsolete_mkdir_used=true
      fi
    fi
  fi
  if test -n "$dir_arg"; then
    { test -z "$chowncmd" || $doit $chowncmd "$dst"; } &&
    { test -z "$chgrpcmd" || $doit $chgrpcmd "$dst"; } &&
    { test "$obsolete_mkdir_used$chowncmd$chgrpcmd" = false ||
      test -z "$chmodcmd" || $doit $chmodcmd $mode "$dst"; } || exit 1
  else
    # Make a couple of temp file names in the proper directory.
    dsttmp=$dstdir/_inst.$$_
    rmtmp=$dstdir/_rm.$$_
    # Trap to clean up those temp files at exit.
    trap 'ret=$?; rm -f "$dsttmp" "$rmtmp" && exit $ret' 0
    # Copy the file name to the temp name.
    (umask $cp_umask && $doit_exec $cpprog "$src" "$dsttmp") &&
    # and set any options; do chmod last to preserve setuid bits.
    #
    # If any of these fail, we abort the whole thing.  If we want to
    # ignore errors from any of these, just make sure not to ignore
    # errors from the above "$doit $cpprog $src $dsttmp" command.
    #
    { test -z "$chowncmd" || $doit $chowncmd "$dsttmp"; } &&
    { test -z "$chgrpcmd" || $doit $chgrpcmd "$dsttmp"; } &&
    { test -z "$stripcmd" || $doit $stripcmd "$dsttmp"; } &&
    { test -z "$chmodcmd" || $doit $chmodcmd $mode "$dsttmp"; } &&
    # If -C, don't bother to copy if it wouldn't change the file.
    if $copy_on_change &&
       old=`LC_ALL=C ls -dlL "$dst"    2>/dev/null` &&
       new=`LC_ALL=C ls -dlL "$dsttmp"    2>/dev/null` &&
       eval "$initialize_posix_glob" &&
       $posix_glob set -f &&
       set X $old && old=:$2:$4:$5:$6 &&
       set X $new && new=:$2:$4:$5:$6 &&
       $posix_glob set +f &&
       test "$old" = "$new" &&
       $cmpprog "$dst" "$dsttmp" >/dev/null 2>&1
    then
      rm -f "$dsttmp"
    else
      # Rename the file to the real destination.
      $doit $mvcmd -f "$dsttmp" "$dst" 2>/dev/null ||
      # The rename failed, perhaps because mv can't rename something else
      # to itself, or perhaps because mv is so ancient that it does not
      # support -f.
      {
    # Now remove or move aside any old file at destination location.
    # We try this two ways since rm can't unlink itself on some
    # systems and the destination file might be busy for other
    # reasons.  In this case, the final cleanup might fail but the new
    # file should still install successfully.
    {
      test ! -f "$dst" ||
      $doit $rmcmd -f "$dst" 2>/dev/null ||
      { $doit $mvcmd -f "$dst" "$rmtmp" 2>/dev/null &&
        { $doit $rmcmd -f "$rmtmp" 2>/dev/null; :; }
      } ||
      { echo "$0: cannot unlink or rename $dst" >&2
        (exit 1); exit 1
      }
    } &&
    # Now rename the file to the real destination.
    $doit $mvcmd "$dsttmp" "$dst"
      }
    fi || exit 1
    trap '' 0
  fi
done
# Local variables:
# eval: (add-hook 'write-file-hooks 'time-stamp)
# time-stamp-start: "scriptversion="
# time-stamp-format: "%:y-%02m-%02d.%02H"
# time-stamp-time-zone: "UTC"
# time-stamp-end: "; # UTC"
# End:
missing
File was deleted
missing
New file
@@ -0,0 +1,215 @@
#! /bin/sh
# Common wrapper for a few potentially missing GNU programs.
scriptversion=2012-06-26.16; # UTC
# Copyright (C) 1996-2013 Free Software Foundation, Inc.
# Originally written by Fran,cois Pinard <pinard@iro.umontreal.ca>, 1996.
# This program is free software; you can redistribute it and/or modify
# it under the terms of the GNU General Public License as published by
# the Free Software Foundation; either version 2, or (at your option)
# any later version.
# This program is distributed in the hope that it will be useful,
# but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
# MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the
# GNU General Public License for more details.
# You should have received a copy of the GNU General Public License
# along with this program.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
# As a special exception to the GNU General Public License, if you
# distribute this file as part of a program that contains a
# configuration script generated by Autoconf, you may include it under
# the same distribution terms that you use for the rest of that program.
if test $# -eq 0; then
  echo 1>&2 "Try '$0 --help' for more information"
  exit 1
fi
case $1 in
  --is-lightweight)
    # Used by our autoconf macros to check whether the available missing
    # script is modern enough.
    exit 0
    ;;
  --run)
    # Back-compat with the calling convention used by older automake.
    shift
    ;;
  -h|--h|--he|--hel|--help)
    echo "\
$0 [OPTION]... PROGRAM [ARGUMENT]...
Run 'PROGRAM [ARGUMENT]...', returning a proper advice when this fails due
to PROGRAM being missing or too old.
Options:
  -h, --help      display this help and exit
  -v, --version   output version information and exit
Supported PROGRAM values:
  aclocal   autoconf  autoheader   autom4te  automake  makeinfo
  bison     yacc      flex         lex       help2man
Version suffixes to PROGRAM as well as the prefixes 'gnu-', 'gnu', and
'g' are ignored when checking the name.
Send bug reports to <bug-automake@gnu.org>."
    exit $?
    ;;
  -v|--v|--ve|--ver|--vers|--versi|--versio|--version)
    echo "missing $scriptversion (GNU Automake)"
    exit $?
    ;;
  -*)
    echo 1>&2 "$0: unknown '$1' option"
    echo 1>&2 "Try '$0 --help' for more information"
    exit 1
    ;;
esac
# Run the given program, remember its exit status.
"$@"; st=$?
# If it succeeded, we are done.
test $st -eq 0 && exit 0
# Also exit now if we it failed (or wasn't found), and '--version' was
# passed; such an option is passed most likely to detect whether the
# program is present and works.
case $2 in --version|--help) exit $st;; esac
# Exit code 63 means version mismatch.  This often happens when the user
# tries to use an ancient version of a tool on a file that requires a
# minimum version.
if test $st -eq 63; then
  msg="probably too old"
elif test $st -eq 127; then
  # Program was missing.
  msg="missing on your system"
else
  # Program was found and executed, but failed.  Give up.
  exit $st
fi
perl_URL=http://www.perl.org/
flex_URL=http://flex.sourceforge.net/
gnu_software_URL=http://www.gnu.org/software
program_details ()
{
  case $1 in
    aclocal|automake)
      echo "The '$1' program is part of the GNU Automake package:"
      echo "<$gnu_software_URL/automake>"
      echo "It also requires GNU Autoconf, GNU m4 and Perl in order to run:"
      echo "<$gnu_software_URL/autoconf>"
      echo "<$gnu_software_URL/m4/>"
      echo "<$perl_URL>"
      ;;
    autoconf|autom4te|autoheader)
      echo "The '$1' program is part of the GNU Autoconf package:"
      echo "<$gnu_software_URL/autoconf/>"
      echo "It also requires GNU m4 and Perl in order to run:"
      echo "<$gnu_software_URL/m4/>"
      echo "<$perl_URL>"
      ;;
  esac
}
give_advice ()
{
  # Normalize program name to check for.
  normalized_program=`echo "$1" | sed '
    s/^gnu-//; t
    s/^gnu//; t
    s/^g//; t'`
  printf '%s\n' "'$1' is $msg."
  configure_deps="'configure.ac' or m4 files included by 'configure.ac'"
  case $normalized_program in
    autoconf*)
      echo "You should only need it if you modified 'configure.ac',"
      echo "or m4 files included by it."
      program_details 'autoconf'
      ;;
    autoheader*)
      echo "You should only need it if you modified 'acconfig.h' or"
      echo "$configure_deps."
      program_details 'autoheader'
      ;;
    automake*)
      echo "You should only need it if you modified 'Makefile.am' or"
      echo "$configure_deps."
      program_details 'automake'
      ;;
    aclocal*)
      echo "You should only need it if you modified 'acinclude.m4' or"
      echo "$configure_deps."
      program_details 'aclocal'
      ;;
   autom4te*)
      echo "You might have modified some maintainer files that require"
      echo "the 'automa4te' program to be rebuilt."
      program_details 'autom4te'
      ;;
    bison*|yacc*)
      echo "You should only need it if you modified a '.y' file."
      echo "You may want to install the GNU Bison package:"
      echo "<$gnu_software_URL/bison/>"
      ;;
    lex*|flex*)
      echo "You should only need it if you modified a '.l' file."
      echo "You may want to install the Fast Lexical Analyzer package:"
      echo "<$flex_URL>"
      ;;
    help2man*)
      echo "You should only need it if you modified a dependency" \
           "of a man page."
      echo "You may want to install the GNU Help2man package:"
      echo "<$gnu_software_URL/help2man/>"
    ;;
    makeinfo*)
      echo "You should only need it if you modified a '.texi' file, or"
      echo "any other file indirectly affecting the aspect of the manual."
      echo "You might want to install the Texinfo package:"
      echo "<$gnu_software_URL/texinfo/>"
      echo "The spurious makeinfo call might also be the consequence of"
      echo "using a buggy 'make' (AIX, DU, IRIX), in which case you might"
      echo "want to install GNU make:"
      echo "<$gnu_software_URL/make/>"
      ;;
    *)
      echo "You might have modified some files without having the proper"
      echo "tools for further handling them.  Check the 'README' file, it"
      echo "often tells you about the needed prerequisites for installing"
      echo "this package.  You may also peek at any GNU archive site, in"
      echo "case some other package contains this missing '$1' program."
      ;;
  esac
}
give_advice "$1" | sed -e '1s/^/WARNING: /' \
                       -e '2,$s/^/         /' >&2
# Propagate the correct exit status (expected to be 127 for a program
# not found, 63 for a program that failed due to version mismatch).
exit $st
# Local variables:
# eval: (add-hook 'write-file-hooks 'time-stamp)
# time-stamp-start: "scriptversion="
# time-stamp-format: "%:y-%02m-%02d.%02H"
# time-stamp-time-zone: "UTC"
# time-stamp-end: "; # UTC"
# End:
src/bondflip.c
@@ -11,6 +11,7 @@
#include "bondflip.h"
//#include "io.h"
#include<stdio.h>
#include<string.h>
ts_bool single_bondflip_timestep(ts_vesicle *vesicle, ts_bond *bond, ts_double *rn){
/*c  Vertex and triangle (lm and lp) indexing for bond flip:
@@ -114,6 +115,43 @@
if(lm2==NULL || lp1==NULL) fatal("ts_flip_bond: Cannot find triangles lm2 and lp1!",999);
    
/* backup old structure */
/* need to backup:
 * vertices k, kp, km, it
 * triangles lm, lp, lm2, lp1
 * bond
 */
ts_vertex *bck_vtx[4];
ts_triangle *bck_tria[4];
ts_bond *bck_bond;
ts_vertex *orig_vtx[]={k,it,kp,km};
ts_triangle *orig_tria[]={lm,lp, lm2,lp1};
fprintf(stderr,"Backuping!!!\n");
for(i=0;i<4;i++){
    bck_vtx[i]=(ts_vertex *)malloc(sizeof(ts_vertex));
    bck_tria[i]=(ts_triangle *)malloc(sizeof(ts_triangle));
    bck_bond=(ts_bond *)malloc(sizeof(ts_bond));
    /* level 2 pointers */
    bck_vtx[i]->neigh=(ts_vertex **)malloc(orig_vtx[i]->neigh_no*sizeof(ts_vertex *));
    bck_vtx[i]->tristar=(ts_triangle **)malloc(orig_vtx[i]->tristar_no*sizeof(ts_triangle *));
    bck_vtx[i]->bond=(ts_bond **)malloc(orig_vtx[i]->bond_no*sizeof(ts_bond *));
    bck_tria[i]->neigh=(ts_triangle **)malloc(orig_tria[i]->neigh_no*sizeof(ts_triangle *));
    bck_vtx[i]=memcpy(bck_vtx[i],orig_vtx[i],sizeof(ts_vertex));
    bck_vtx[i]->neigh=memcpy(bck_vtx[i]->neigh,orig_vtx[i]->neigh,orig_vtx[i]->neigh_no*sizeof(ts_vertex *));
    bck_vtx[i]->tristar=memcpy(bck_vtx[i]->tristar,orig_vtx[i]->tristar,orig_vtx[i]->tristar_no*sizeof(ts_triangle *));
    bck_vtx[i]->bond=memcpy(bck_vtx[i]->bond,orig_vtx[i]->bond,orig_vtx[i]->bond_no*sizeof(ts_bond *));
    bck_tria[i]=memcpy(bck_tria[i],orig_tria[i],sizeof(ts_triangle));
    bck_tria[i]->neigh=memcpy(bck_tria[i]->neigh,orig_tria[i]->neigh,orig_tria[i]->neigh_no*sizeof(ts_triangle *));
}
    bck_bond=memcpy(bck_bond,bond,sizeof(ts_bond));
fprintf(stderr,"Backup complete!!!\n");
/* end backup vertex */
/* Save old energy */
  oldenergy=0;
  oldenergy+=k->xk* k->energy;
@@ -157,13 +195,52 @@
            //not accepted, reverting changes
//            fprintf(stderr,"Failed to move, due to MC\n");
            ts_flip_bond(kp,km,k,it, bond, lm,lp,lm2,lp1);
      //      ts_flip_bond(kp,km,k,it, bond, lm,lp,lm2,lp1);
//    fprintf(stderr,"%e, %e, %e\n", lp->xnorm, lp->ynorm, lp->znorm);
    //restore all backups
            fprintf(stderr,"Restoring!!!\n");
for(i=0;i<4;i++){
    /* level 2 pointers */
    orig_vtx[i]=memcpy(orig_vtx[i],bck_vtx[i],sizeof(ts_vertex));
    orig_vtx[i]->neigh=memcpy(orig_vtx[i]->neigh,bck_vtx[i]->neigh,bck_vtx[i]->neigh_no*sizeof(ts_vertex *));
    orig_vtx[i]->tristar=memcpy(orig_vtx[i]->tristar,bck_vtx[i]->tristar,bck_vtx[i]->tristar_no*sizeof(ts_triangle *));
    orig_vtx[i]->bond=memcpy(orig_vtx[i]->bond,bck_vtx[i]->bond,bck_vtx[i]->bond_no*sizeof(ts_bond *));
    orig_tria[i]=memcpy(orig_tria[i],bck_tria[i],sizeof(ts_triangle));
    orig_tria[i]->neigh=memcpy(orig_tria[i]->neigh,bck_tria[i]->neigh,bck_tria[i]->neigh_no*sizeof(ts_triangle *));
}
    bond=memcpy(bond,bck_bond,sizeof(ts_bond));
    for(i=0;i<4;i++){
        vtx_free(bck_vtx[i]);
     free(bck_tria[i]->neigh);
        free(bck_tria[i]);
    }
        free(bck_bond);
            fprintf(stderr,"Restoration complete!!!\n");
            return TS_FAIL;
        }
    }
     /* IF BONDFLIP ACCEPTED, THEN RETURN SUCCESS! */
//            fprintf(stderr,"SUCCESS!!!\n");
            fprintf(stderr,"SUCCESS!!!\n");
    // delete all backups
    for(i=0;i<4;i++){
        vtx_free(bck_vtx[i]);
     free(bck_tria[i]->neigh);
        free(bck_tria[i]);
    }
        free(bck_bond);
    return TS_SUCCESS;
}
src/triangle.c
@@ -150,6 +150,7 @@
//    fprintf(stderr,"*** tria_number=%d\n",tria->neigh_no);
    tria->neigh=(ts_triangle **)realloc(tria->neigh,tria->neigh_no*sizeof(ts_triangle *));
    if(tria->neigh == NULL){
        fprintf(stderr,"Ooops: tria->neigh_no=%d\n",tria->neigh_no);
        fatal("Reallocation of memory failed during removal of vertex neighbour in triangle_remove_neighbour",100);
    }
/* we repeat the procedure for neighbour */
@@ -168,6 +169,7 @@
//    fprintf(stderr,"*** ntria_number=%d\n",ntria->neigh_no);
    ntria->neigh=(ts_triangle **)realloc(ntria->neigh,ntria->neigh_no*sizeof(ts_triangle *));
    if(ntria->neigh == NULL){
        fprintf(stderr,"Ooops: ntria->neigh_no=%d\n",ntria->neigh_no);
        fatal("Reallocation of memory failed during removal of vertex neighbour in triangle_remove_neighbour",100);
    }
    return TS_SUCCESS;