finished. debugging begins

Samo Penic

2014-11-12 43e534d0d6499cf47569787f2468a6941bd03721

 src/poly.c

@@ -61,7 +61,7 @@

   // Grafting polymers:
   if (vlist!=NULL){
      if (n_poly > vlist->n){fatal("Number of polymers larger then numbero f vertices on a vesicle.",310);}
      if (n_poly > vlist->n){fatal("Number of polymers larger than numbero f vertices on a vesicle.",310);}
   
      while(i<n_poly){
         gvtxi = rand() % vlist->n;
@@ -172,3 +172,42 @@
   
   return TS_SUCCESS;
}


ts_poly *remove_poly_with_index(ts_poly_list *poly_list, ts_uint idx){
   ts_uint i;
   ts_poly *removed_poly=poly_list->poly[idx];

   poly_list->n--; //decrease the total number of polymeres
   for(i=idx;i<poly_list->n;i++){ //move the rest of the polymeres up.
      poly_list->poly[i]=poly_list->poly[i+1];
//      poly_list->poly[idx]->idx=idx;
   }
	
   return removed_poly;
}


ts_bool remove_random_polymeres(ts_poly_list *poly_list, ts_uint number){

   ts_uint i, idx;
   ts_poly *poly;

   ts_poly **new_poly_array;
   if(number>poly_list->n) fatal("The number of polymeres to be removed from the list is greater than the number of total polymeres in the list",999);
   for(i=number;i>0;i--){
      idx=rand() % poly_list->n;
      poly=remove_poly_with_index(poly_list, idx);
      poly_free(poly);
   }
   printf("Addr before %ld\n", (long)poly_list->poly);
   new_poly_array=(ts_poly **)calloc(poly_list->n,sizeof(ts_poly *));
   for(i=0;i<poly_list->n;i++){
      new_poly_array[i]=poly_list->poly[i];
   }
   free(poly_list->poly);
   poly_list->poly=new_poly_array;
   printf("Addr after %ld\n", (long)poly_list->poly);
   return TS_SUCCESS;
}