An attempt to fix polymer error while recreating vesicle from vtu.

Samo Penic

2019-08-08 d43116b7d609fa9cabae4068d037c1af3a20dae8

 src/vertex.c

@@ -1,3 +1,4 @@
/* vim: set ts=4 sts=4 sw=4 noet : */
#include<stdlib.h>
#include<math.h>
#include<string.h>
@@ -5,6 +6,14 @@
#include "vertex.h"
#include "bond.h"
#include<stdio.h>

ts_bool vertex_list_assign_id(ts_vertex_list *vlist, ts_uint id){
   ts_uint i;	
   for(i=0;i<vlist->n;i++){
      vlist->vtx[i]->id = id;
   }
   return TS_SUCCESS;
}

ts_vertex_list *init_vertex_list(ts_uint N){   
   ts_int i;
@@ -191,6 +200,19 @@
    return TS_SUCCESS;
}

/** Calculates the triple product of vectors defined by vertices vtx1, vtx2 and vtx3, ($\mathrm{vtx}_1\cdot(\mathrm{vtx}_2\cross\mathrm{vtx}_3$):
 *  \begin{vmatrix}
 *  x_1 & y_1 & z_1 \\
 *  x_2-x_1 & y_2-y_1 & z_2-z_1\\
 *  x_3-x_1 & y_3-y_1 & z_3-z_1\\
 *  \end{vmatrix}
 *  where the vertices coordinates are denoted by corresponding vertex index number. Function is used to determine the orientation of area formed by triangle formed by the three given vertices.
 *
 *      @param vtx1 is first vertex, according to which the orientation is calculated
 *      @param vtx2 is the second vertex
 *      @param vtx3 is the third vertex
 *      @returns directionality of the area of the triangle formed by vertices vtx1, vtx2 and vtx3. It is positive if vtx1, vtx2 and vtx3 are oriented counter-clockwise.
*/
inline ts_double vtx_direct(ts_vertex *vtx1, ts_vertex *vtx2, ts_vertex *vtx3){
    ts_double dX2=vtx2->x-vtx1->x;
    ts_double dY2=vtx2->y-vtx1->y;