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Samo Penic

2013-11-27 0652ee2715994b48a9bbfd1132bf0b65ad206289

 src/vesicle.c

@@ -13,6 +13,7 @@
    vesicle->blist=init_bond_list();
    vesicle->tlist=init_triangle_list();
    vesicle->clist=init_cell_list(ncmax1, ncmax2, ncmax3, stepsize);
    vesicle->mutex=(ts_mutex *)malloc(sizeof(ts_mutex));
    return vesicle;
}

@@ -37,20 +38,21 @@
    return TS_SUCCESS;
}

/* @brief Function makes a sum of partial volumes of each triangle. Volumes of
 *
 * Partial volumes are calculated when we calculate normals of triangles. It is
 * relatively easy to calculate the volume of vesicle if we take into account
 * that the volume of the whole vertex is simply sum of all partial volumes of
 * all the triangles.
 */
ts_bool vesicle_volume(ts_vesicle *vesicle){
    ts_double volume;
    ts_double vol;
    ts_uint i;
    ts_triangle **tria=vesicle->tlist->tria;
    volume=0;
    for(i=0; i<vesicle->tlist->n;i++){
        vol=(tria[i]->vertex[0]->x+ tria[i]->vertex[1]->x + tria[i]->vertex[2]->x) * tria[i]->xnorm + 
       (tria[i]->vertex[0]->y+ tria[i]->vertex[1]->y + tria[i]->vertex[2]->y) * tria[i]->ynorm + 
    (tria[i]->vertex[0]->z+ tria[i]->vertex[1]->z + tria[i]->vertex[2]->z) *
tria[i]->znorm;
    volume=volume-vol/18.0;
    volume=volume+tria[i]->volume;
    }

    vesicle->volume=volume;
    return TS_SUCCESS;
}