Polymers thermicaly move now! HArmonic potential added.

Miha

2014-02-06 fedf2b217113800a15f367e111e2dbcad4a3c92c

 src/timestep.c

@@ -8,6 +8,7 @@
#include "bondflip.h"
#include "frame.h"
#include "io.h"

ts_bool run_simulation(ts_vesicle *vesicle, ts_uint mcsweeps, ts_uint inititer, ts_uint iterations){
   ts_uint i, j;

@@ -30,7 +31,7 @@
ts_bool single_timestep(ts_vesicle *vesicle){
    ts_bool retval;
    ts_double rnvec[3];
    ts_uint i, b;
    ts_uint i,j,b;
    for(i=0;i<vesicle->vlist->n;i++){
        rnvec[0]=drand48();
        rnvec[1]=drand48();
@@ -39,7 +40,7 @@
    }

//   ts_int cnt=0;
    for(i=0;i<vesicle->vlist->n;i++){
    for(i=0;i<3*vesicle->vlist->n;i++){
//why is rnvec needed in bondflip?
/*        rnvec[0]=drand48();
        rnvec[1]=drand48();
@@ -50,8 +51,19 @@
        //call single_bondflip_timestep...
        retval=single_bondflip_timestep(vesicle,vesicle->blist->bond[b],rnvec);
//   if(retval==TS_SUCCESS) cnt++;        
    } 
//   printf("Bondflip success rate in one sweep: %d/%d=%e\n", cnt,vesicle->blist->n,(double)cnt/(double)vesicle->blist->n);
    }

   for(i=0;i<vesicle->poly_list->n;i++){
   for(j=0;j<vesicle->poly_list->poly[i]->vlist->n;j++){
      rnvec[0]=drand48();
      rnvec[1]=drand48();
      rnvec[2]=drand48();
      retval=single_poly_vertex_move(vesicle,vesicle->poly_list->poly[i],vesicle->poly_list->poly[i]->vlist->vtx[j],rnvec);	
   }

   }
 
//   printf("Bondflip success rate in one sweep: %d/%d=%e\n", cnt,3*vesicle->blist->n,(double)cnt/(double)vesicle->blist->n/3.0);
   if(retval);
    return TS_SUCCESS;
}