Trisurf Monte Carlo simulator
Samo Penic
2016-07-13 fc6f3ef0a9822f3d5f06d38e556dbb5f2e985f4a
src/tape
@@ -1,6 +1,6 @@
####### Vesicle definitions ###########
# nshell is a number of divisions of dipyramid
nshell=5
nshell=17
# dmax is the max. bond length (in units l_min)
dmax=1.7
# dmin_interspecies in the min. dist. between different vertex species (in units l_min)
@@ -14,7 +14,7 @@
# (pswitch=1: calc. p*dV energy contribution)
pswitch = 0
# pressure difference: p_inside - p_outside (in units kT/l_min^3):
pressure=-10.0
pressure=10.0
#Constant volume constraint (0 disable constant volume, 1 enable wiht additional vertex move, 2 enable with epsvol)
constvolswitch=0
@@ -25,11 +25,13 @@
####### Polymer (brush) definitions ###########
# npoly is a number of polymers attached to npoly distinct vertices on vesicle
npoly=0
npoly=400
# nmono is a number of monomers in each polymer
nmono=2
nmono=10
# Spring constant between monomers of the polymer
k_spring=800
#set to 1 if half of the polymeres are inside the vesicle
internal_poly=1
####### Filament (inside the vesicle) definitions ###########
# nfil is a number of filaments inside the vesicle
@@ -57,7 +59,7 @@
mcsweeps=200
#how many initial mcsweeps*inititer MC sweeps before recording to disk?
#2
inititer=10
inititer=1
#how many records do you want on the disk iteration are there in a run?
#10000
iterations=100