Added possibility of internal pegs. It can break the system however

Samo Penic

2016-07-11 e984829db39b2778e4f66c34524329ad09749c45

 src/sh.c

@@ -1,8 +1,10 @@
/* vim: set ts=4 sts=4 sw=4 noet : */
#include<math.h>
#include<stdlib.h>
#include "general.h"
#include "sh.h"

#include "io.h"
#include <string.h>


ts_spharm *sph_init(ts_vertex_list *vlist, ts_uint l){
@@ -402,8 +404,10 @@
ts_bool saveAvgUlm2(ts_vesicle *vesicle){

   FILE *fh;
	
   fh=fopen("sph2out.dat", "w");
    char filename[10000];
    strcpy(filename, command_line_args.path);
    strcat(filename, "sph2out.dat");
   fh=fopen(filename, "w");
   if(fh==NULL){
      err("Cannot open file %s for writing");
      return TS_FAIL;