Fixed restoration (partially)

Samo Penic

2016-02-29 e87e4e4fcbba57d36dfd17b92f413ccf2c1b322a

 src/restore.c

@@ -74,8 +74,8 @@
/* TODO: cells, polymeres, filaments, core, tape */

   fprintf(stderr,"Restoration completed\n");
   exit(0);
   vesicle_free(vesicle);
   exit(0);
   return TS_SUCCESS;
}

@@ -190,14 +190,18 @@
   char *tria;
   char *vtx[3];
   
   ts_uint i;
   ts_uint i,j;
   triangles = xmlNodeListGetString(doc, cur->xmlChildrenNode, 1);
   tria=(char *)triangles;
   for(i=0;i<3;i++)   vtx[i]=strtok(tria," ");
   vtx[0]=strtok(tria," ");
   for(i=1;i<3;i++)   vtx[i]=strtok(NULL," ");
   j=0;
   while(vtx[2]!=NULL){
      triangle_add(vesicle->tlist, vesicle->vlist->vtx[atoi(vtx[0])],vesicle->vlist->vtx[atoi(vtx[1])],vesicle->vlist->vtx[atoi(vtx[2])]);
      for(i=0;i<3;i++)   vtx[i]=strtok(NULL," ");
      j++;
   }   
   fprintf(stderr,"Parsing triangles %s j=%d\n",triangles,j);	

   xmlFree(triangles);
   return TS_SUCCESS;
@@ -211,7 +215,8 @@
   ts_uint i,j;
   triangles = xmlNodeListGetString(doc, cur->xmlChildrenNode, 1);
   tria=(char *)triangles;
   for(i=0;i<3;i++)   ntria[i]=strtok(tria," ");
   ntria[0]=strtok(tria," ");
   for(i=1;i<3;i++)   ntria[i]=strtok(NULL," ");
   j=0;
   while(ntria[2]!=NULL){
      triangle_add_neighbour(vesicle->tlist->tria[j],vesicle->tlist->tria[atoi(ntria[0])]);
@@ -266,7 +271,8 @@
      if ((!xmlStrcmp(child->name, (const xmlChar *)"DataArray"))){
         points = xmlNodeListGetString(doc, child->xmlChildrenNode, 1);
         pts=(char *)points;
         for(i=0;i<3;i++)   token[i]=strtok(pts," ");
         token[0]=strtok(pts," ");
         for(i=1;i<3;i++)   token[i]=strtok(NULL," ");
         idx=0;
         while(token[0]!=NULL){
            vesicle->vlist->vtx[idx]->x=atof(token[0]);
@@ -291,7 +297,8 @@
      if ((!xmlStrcmp(child->name, (const xmlChar *)"DataArray"))){
         bonds = xmlNodeListGetString(doc, child->xmlChildrenNode, 1);
         b=(char *)bonds;
         for(i=0;i<2;i++)   token[i]=strtok(b," ");
         token[0]=strtok(b," ");
         token[1]=strtok(NULL," ");
         idx=0;
         while(token[0]!=NULL){
            bond_add(vesicle->blist, vesicle->vlist->vtx[atoi(token[0])], vesicle->vlist->vtx[atoi(token[1])]);