seems to work.

Samo Penic

2014-06-13 d27c077296c88b4a78288bed7454c3a60279c26e

 src/cross-section.c

@@ -9,17 +9,17 @@
 * if a distance of point to plane (given by equation $D=\frac{ax_0+by_0+cz_0+d}{\sqrt{a^2+b^2+c^2}}$, where $x_0$, $y_0$ and $z_0$ are coordinates of a given vertex) is less than maximal allowed distance between vertices {\tt sqrt(vesicle->dmax)} than vertex is a candidate for crossection calculation.
 *
 */
ts_coord_list get_crossection_with_plane(ts_vesicle vesicle,ts_double a,ts_double b,ts_double c, ts_double d){
ts_coord_list *get_crossection_with_plane(ts_vesicle *vesicle,ts_double a,ts_double b,ts_double c, ts_double d){


   ts_uint i, j, k;
   ts_uint i, j;
   ts_double pp,Dsq; // distance from the plane squared
   ts_double ppn,Dsqn; // distance from the plane squared of a neighbor
   ts_double ppn; // distance from the plane squared of a neighbor
   ts_double u; //factor to scale vector from first vector to the second to get intersection
   ts_vertex *vtx;

   ts_coord_list *pts=init_coord_list();
   for(i=0;i<vesicle->vlist->N;i++){
   for(i=0;i<vesicle->vlist->n;i++){
      vtx=vesicle->vlist->vtx[i];

      pp=vtx->x*a+vtx->y*b+vtx->z*c+d;
@@ -28,10 +28,10 @@
         for(j=0;j<vtx->neigh_no;j++){
            ppn=vtx->neigh[j]->x*a+vtx->neigh[j]->y*b+vtx->neigh[j]->z*c+d;
            if(pp*ppn<0){ //the combination of vertices are good candidates for a crossection
               u=pp/(a*(vtx->x-vtx->neigh[j]->x)+b*(vtx->y-vtx->neigh[j]->y)+c(vtx->z-vtx->neigh[j]->z));
               add_coord(pts, vtx->x+u(vtx->neigh[j]->x - vtx->x),
                     vtx->y+u(vtx->neigh[j]->y - vtx->y),		
                     vtx->z+u(vtx->neigh[j]->z - vtx->z),
               u=pp/(a*(vtx->x-vtx->neigh[j]->x)+b*(vtx->y-vtx->neigh[j]->y)+c*(vtx->z-vtx->neigh[j]->z));
               add_coord(pts, vtx->x+u*(vtx->neigh[j]->x - vtx->x),
                     vtx->y+u*(vtx->neigh[j]->y - vtx->y),		
                     vtx->z+u*(vtx->neigh[j]->z - vtx->z),
                     TS_COORD_CARTESIAN);      
            }
         }