Trisurf Monte Carlo simulator
Samo Penic
2018-05-15 cf7aba67c608a693466b0ac439d719bc49cd29f9
src/tape
@@ -1,10 +1,6 @@
####### Vesicle definitions ###########
# nshell is a number of divisions of dipyramid
<<<<<<< HEAD
nshell=17
=======
nshell=10
>>>>>>> nirgov
# dmax is the max. bond length (in units l_min)
dmax=1.7
# dmin_interspecies in the min. dist. between different vertex species (in units l_min)
@@ -27,11 +23,16 @@
#Constant area constraint (0 disable constant area, 2 enable constant area with epsarea)
constareaswitch=0
#Stretching
stretchswitch=1
xkA0=1.0
####### Polymer (brush) definitions ###########
# npoly is a number of polymers attached to npoly distinct vertices on vesicle
npoly=800
npoly=0
# nmono is a number of monomers in each polymer
nmono=6
nmono=10
# Spring constant between monomers of the polymer
k_spring=800
#set to 1 if half of the polymeres are inside the vesicle
@@ -60,10 +61,10 @@
####### Program Control ############
#how many MC sweeps between subsequent records of states to disk
#200000
mcsweeps=2000
mcsweeps=200
#how many initial mcsweeps*inititer MC sweeps before recording to disk?
#2
inititer=10
inititer=1
#how many records do you want on the disk iteration are there in a run?
#10000
iterations=100
@@ -90,10 +91,9 @@
#cuda options???
#NirGov branch only!
#number of vertices with spontaneous curvature (integer)
number_of_vertices_with_c0=100
#spontaneous curvature (float)
#c0/2 is spontaneous curvature. c0 is used as (c1+c1-c0)^2 in energy term (float)
c0=0.5
#energy of attraction of vertices with spontaneous curvature (float, positive value for attraction)
w=10.0