Trisurf Monte Carlo simulator
Samo Penic
2016-05-24 cc95bd1ca5e69ce13766ca0acea11560531ed620
src/tape
@@ -1,6 +1,6 @@
####### Vesicle definitions ###########
# nshell is a number of divisions of dipyramid
nshell=17
nshell=10
# dmax is the max. bond length (in units l_min)
dmax=1.7
# dmin_interspecies in the min. dist. between different vertex species (in units l_min)
@@ -12,18 +12,20 @@
# Pressure calculations
# (pswitch=1: calc. p*dV energy contribution)
pswitch = 0
pswitch = 1
# pressure difference: p_inside - p_outside (in units kT/l_min^3):
pressure=0.0
pressure=-10.0
#Constant volume constraint (0 disable constant volume, 1 enable wiht additional vertex move, 2 enable with epsvol)
constvolswitch=2
constvolswitch=0
constvolprecision=1e-14
#Constant area constraint (0 disable constant area, 2 enable constant area with epsarea)
constareaswitch=2
####### Polymer (brush) definitions ###########
# npoly is a number of polymers attached to npoly distinct vertices on vesicle
npoly=5
npoly=0
# nmono is a number of monomers in each polymer
nmono=10
# Spring constant between monomers of the polymer
@@ -40,7 +42,9 @@
####### Nucleus (inside the vesicle) ###########
# Radius of an impenetrable hard sphere inside the vesicle
R_nucleus=0
R_nucleusX=2.0
R_nucleusY=6.0
R_nucleusZ=2.0
#######  Cell definitions ############
nxmax=60
nymax=60
@@ -50,7 +54,7 @@
####### Program Control ############
#how many MC sweeps between subsequent records of states to disk
#200000
mcsweeps=20
mcsweeps=2000
#how many initial mcsweeps*inititer MC sweeps before recording to disk?
#2
inititer=0