Merge branch 'trisurf-polyel'

Samo Penic

2014-03-08 c0d703a09da108f218b687beeec671f71b7a44c9

 src/vertexmove.c

@@ -18,7 +18,7 @@
    ts_double dist;
    ts_bool retval; 
    ts_uint cellidx; 
    ts_double delta_energy,oenergy;
    ts_double delta_energy,oenergy,dvol=0.0;
    ts_double costheta,sintheta,phi,r;
   //This will hold all the information of vtx and its neighbours
   ts_vertex backupvtx[20];
@@ -83,7 +83,9 @@
   memcpy((void *)&backupvtx[i+1],(void *)vtx->neigh[i],sizeof(ts_vertex));
   }


   if(vesicle->pswitch == 1){
      for(i=0;i<vtx->tristar_no;i++) dvol-=vtx->tristar[i]->volume;
   };

    delta_energy=0;
    //update the normals of triangles that share bead i.
@@ -97,6 +99,12 @@
        energy_vertex(vtx->neigh[i]);
        delta_energy+=vtx->neigh[i]->xk*(vtx->neigh[i]->energy-oenergy);
    }

   if(vesicle->pswitch == 1){
      for(i=0;i<vtx->tristar_no;i++) dvol+=vtx->tristar[i]->volume;
      delta_energy-=vesicle->pressure*dvol;
   };

/* No poly-bond energy for now!
   if(vtx->grafted_poly!=NULL){
      delta_energy+=