Trisurf Monte Carlo simulator
Samo Penic
2016-02-29 bb40336eb8a2acc9f2e3d2e9059b7d90afe5c0c4
src/restore.c
@@ -12,6 +12,7 @@
#include "triangle.h"
#include "bond.h"
#include "energy.h"
#include "poly.h"
#include "initial_distribution.h"
ts_bool parseDump(char *dumpfname) {
@@ -68,13 +69,16 @@
   }
   
   xmlFreeDoc(doc);
   vesicle->poly_list=init_poly_list(0, 0, vesicle->vlist, vesicle);
   init_normal_vectors(vesicle->tlist);
   mean_curvature_and_energy(vesicle);
/* TODO: cells, polymeres, filaments, core, tape */
   fprintf(stderr,"Restoration completed\n");
   write_vertex_xml_file(vesicle,999);
//   write_vertex_xml_file(vesicle,999);
   vesicle_free(vesicle);
   exit(0);
   return TS_SUCCESS;
@@ -294,12 +298,13 @@
}
ts_bool parseXMLBonds(ts_vesicle *vesicle,xmlDocPtr doc, xmlNodePtr cur){
   xmlNodePtr child = cur->xmlChildrenNode;
   xmlChar *bonds;
   xmlChar *bonds, *conname;
   char *b;
   int idx;
   char *token[2];
   while (child != NULL) {
      if ((!xmlStrcmp(child->name, (const xmlChar *)"DataArray")) && !xmlStrcmp(xmlGetProp(child, (xmlChar *)"Name"), (const xmlChar *)"connectivity") ){
      conname=xmlGetProp(child, (xmlChar *)"Name");
      if ((!xmlStrcmp(child->name, (const xmlChar *)"DataArray")) && !xmlStrcmp(conname, (const xmlChar *)"connectivity") ){
         bonds = xmlNodeListGetString(doc, child->xmlChildrenNode, 1);
         b=(char *)bonds;
         token[0]=strtok(b," ");
@@ -313,6 +318,7 @@
         }
         xmlFree(bonds);
      }
      xmlFree(conname);
      child=child->next;
   }
   fprintf(stderr,"Bond data j=%d\n",idx);