Trisurf Monte Carlo simulator
Samo Penic
2018-10-11 b4e2e6dbd5049ae279f0f74838cd21b625148c72
src/frame.c
@@ -1,8 +1,11 @@
/* vim: set ts=4 sts=4 sw=4 noet : */
#include<stdlib.h>
#include "general.h"
#include "cell.h"
#include "frame.h"
#include "triangle.h"
ts_bool centermass(ts_vesicle *vesicle){
    ts_uint i,j, n=vesicle->vlist->n;
    ts_vertex **vtx=vesicle->vlist->vtx;
@@ -39,10 +42,19 @@
         vesicle->filament_list->poly[i]->vlist->vtx[j]->z-=vesicle->cm[2];
      }
    }
//move nucleus for the same vector as we moved vesicle
   vesicle->nucleus_center[0]-=vesicle->cm[0];
   vesicle->nucleus_center[1]-=vesicle->cm[1];
   vesicle->nucleus_center[2]-=vesicle->cm[2];
    vesicle->cm[0]=0.0;
    vesicle->cm[1]=0.0;
    vesicle->cm[2]=0.0;
    for(i=0;i<vesicle->tlist->n;i++){
        triangle_normal_vector(vesicle->tlist->tria[i]);
    }
    return TS_SUCCESS;
}
@@ -60,20 +72,23 @@
    }
//Add all polymers to cells
if(vesicle->poly_list!=NULL){
    for(i=0;i<vesicle->poly_list->n;i++){
   for(j=0;j<vesicle->poly_list->poly[i]->vlist->n;j++){
       cellidx=vertex_self_avoidance(vesicle, vesicle->poly_list->poly[i]->vlist->vtx[j]);
       cell_add_vertex(vesicle->clist->cell[cellidx],vesicle->poly_list->poly[i]->vlist->vtx[j]);
   }
    }
}
//Add all filaments to cells
if(vesicle->filament_list!=NULL){
     for(i=0;i<vesicle->filament_list->n;i++){
   for(j=0;j<vesicle->filament_list->poly[i]->vlist->n;j++){
       cellidx=vertex_self_avoidance(vesicle, vesicle->filament_list->poly[i]->vlist->vtx[j]);
       cell_add_vertex(vesicle->clist->cell[cellidx],vesicle->filament_list->poly[i]->vlist->vtx[j]);
   }
    }
}
    return TS_SUCCESS;
}