Found one bug in the code when calculating mprod. Fixed.

Samo Penic

2021-07-27 3197854e89eb9ffe5ff3137e274d16806c2028a5

 src/tape

@@ -14,7 +14,7 @@
# (pswitch=1: calc. p*dV energy contribution)
pswitch = 0
# pressure difference: p_inside - p_outside (in units kT/l_min^3):
pressure=10.0
pressure=10000.0

#Constant volume constraint (0 disable constant volume, 1 enable wiht additional vertex move, 2 enable with epsvol)
constvolswitch=0
@@ -25,18 +25,18 @@


#Stretching
stretchswitch=1
stretchswitch=0
xkA0=1.0

####### Polymer (brush) definitions ###########
# npoly is a number of polymers attached to npoly distinct vertices on vesicle
npoly=0
# nmono is a number of monomers in each polymer
nmono=10
nmono=20
# Spring constant between monomers of the polymer
k_spring=800
#set to 1 if half of the polymeres are inside the vesicle
internal_poly=1
internal_poly=0

####### Filament (inside the vesicle) definitions ###########
# nfil is a number of filaments inside the vesicle
@@ -53,9 +53,9 @@
R_nucleusY=0
R_nucleusZ=0
#######  Cell definitions ############
nxmax=60
nymax=60
nzmax=60
nxmax=150
nymax=150
nzmax=150


####### Program Control ############
@@ -92,7 +92,7 @@


#number of vertices with spontaneous curvature (integer)
number_of_vertices_with_c0=100
number_of_vertices_with_c0=0
#c0/2 is spontaneous curvature. c0 is used as (c1+c1-c0)^2 in energy term (float)
c0=0.5
#energy of attraction of vertices with spontaneous curvature (float, positive value for attraction)
@@ -103,7 +103,7 @@


#plane confinement
plane_confinement_switch=1
plane_confinement_switch=0
#final plane distance (float in lmin)
plane_d=10
#plane to vesicle repulsion force while closing