Trisurf Monte Carlo simulator
Samo Penic
2012-07-12 a7a6d6d521ea3006963ae3f1a3fd8975cf3ba9b2
src/vertexmove.c
@@ -21,9 +21,7 @@
    ts_uint cellidx; 
    ts_double delta_energy,oenergy;
   //This will hold all the information of vtx and its neighbours
//   ts_vertex **backupvtx=(ts_vertex **)calloc(vtx->neigh_no+1,sizeof(ts_vertex *));
   ts_vertex backupvtx[20];
//   backupvtx[0]=(ts_vertex *)malloc(sizeof(ts_vertex));
   memcpy((void *)&backupvtx[0],(void *)vtx,sizeof(ts_vertex));
       //temporarly moving the vertex
   vtx->x=vtx->x+vesicle->stepsize*(2.0*rn[0]-1.0);
@@ -34,9 +32,6 @@
        dist=vtx_distance_sq(vtx,vtx->neigh[i]);
        if(dist<1.0 || dist>vesicle->dmax) {
      vtx=memcpy((void *)vtx,(void *)&backupvtx[0],sizeof(ts_vertex));
//      free(backupvtx[0]);
//      free(backupvtx);
//   fprintf(stderr,"Fail 1, dist=%f, vesicle->dmax=%f\n", dist, vesicle->dmax);
      return TS_FAIL;
      }
    }
@@ -46,23 +41,18 @@
     retval=cell_occupation_number_and_internal_proximity(vesicle->clist,cellidx,&backupvtx[0],vtx);
    if(retval==TS_FAIL){
      vtx=memcpy((void *)vtx,(void *)&backupvtx[0],sizeof(ts_vertex));
//      free(backupvtx[0]);
//      free(backupvtx);
//   fprintf(stderr,"Fail 2\n");
        return TS_FAIL;
    } 
   
 
    //if all the tests are successful, then energy for vtx and neighbours is calculated
   for(i=0;i<vtx->neigh_no;i++){
//   backupvtx[i+1]=(ts_vertex *)malloc(sizeof(ts_vertex));
   memcpy((void *)&backupvtx[i+1],(void *)vtx->neigh[i],sizeof(ts_vertex));
   }
    delta_energy=0;
    //update the normals of triangles that share bead i.
    for(i=0;i<vtx->tristar_no;i++) triangle_normal_vector(vtx->tristar[i]);
    //energy and curvature
    energy_vertex(vtx);
    delta_energy=vtx->xk*(vtx->energy - (&backupvtx[0])->energy);
    //the same is done for neighbouring vertices
@@ -86,12 +76,9 @@
    {
    //not accepted, reverting changes
   vtx=memcpy((void *)vtx,(void *)&backupvtx[0],sizeof(ts_vertex));
//   free(backupvtx[0]);
   for(i=0;i<vtx->neigh_no;i++){
   vtx->neigh[i]=memcpy((void *)vtx->neigh[i],(void *)&backupvtx[i+1],sizeof(ts_vertex));
//   free(backupvtx[i+1]);
   }
//   free(backupvtx);
//   fprintf(stderr,"Reverted\n");
   
    //update the normals of triangles that share bead i.
@@ -101,15 +88,6 @@
    }
}
    //END MONTE CARLOOOOOOO
    //TODO: change cell occupation if necessary!
//   fprintf(stderr,"Success!!\n");
//   free(backupvtx[0]);
//   for(i=0;i<vtx->neigh_no;i++){
//   free(backupvtx[i+1]);
//   }
//   free(backupvtx);
//   fprintf(stderr,"Accepted\n");
    return TS_SUCCESS;
}