triangles added to the data structure.

Samo Penic

2010-11-28 a2a67644115039486dc07aa4d9d636267f99b22a

 src/vertex.c

@@ -3,37 +3,40 @@
#include<string.h>
#include "general.h"
#include "vertex.h"
#include "bond.h"
#include<stdio.h>

/* Argument je struktura vlist in stevilo vertexov, ki jih zelimo dati v
 * vlist je lahko NULL, N mora biti vecje od 0. Ce vlist obstaja, potem resizamo
 * vlist na stevilo N.
 */
ts_vertex **init_vertex_list(ts_uint N){	
ts_vertex_list *init_vertex_list(ts_uint N){	
   ts_int i;
    ts_vertex **vlist;
    ts_vertex *tlist;
    ts_vertex_list *vlist=(ts_vertex_list *)malloc(sizeof(ts_vertex_list));
    
   if(N==0){
      err("Initialized vertex list with zero elements. Pointer set to NULL");
      vlist=NULL;
      return NULL;
        vlist->n=0;
      vlist->vtx=NULL;
      return vlist;
   }
      vlist=(ts_vertex **)malloc(N*sizeof(ts_vertex *));
        if(vlist==NULL)
            fatal("Fatal error reserving memory space for vertex list! Could number of requsted vertices be too large?", 100);
        
        for(i=0;i<N;i++){
               vlist[i]=init_vertex(i); 
        }
	
    vlist->vtx=(ts_vertex **)malloc(N*sizeof(ts_vertex *));
    tlist=(ts_vertex *)malloc(N*sizeof(ts_vertex));
    if(vlist->vtx==NULL || tlist==NULL)
        fatal("Fatal error reserving memory space for vertex list! Could number of requsted vertices be too large?", 100);
    for(i=0;i<N;i++) {
        vlist->vtx[i]=&tlist[i];
        vlist->vtx[i]->data=init_vertex_data();
        vlist->vtx[i]->idx=i;
    }
    vlist->n=N;
   return vlist;
}

ts_vertex *init_vertex(ts_uint idx){
    ts_vertex *vtx;
    vtx=(ts_vertex *)malloc(sizeof(ts_vertex));
    if(vtx==NULL)
ts_vertex_data *init_vertex_data(){
    ts_vertex_data *data;
    data=(ts_vertex_data *)calloc(1,sizeof(ts_vertex_data));
    if(data==NULL)
        fatal("Fatal error reserving memory space for ts_vertex! Memory full?", 100);
    vtx->idx=idx;
    return vtx;
    return data;
}

/*
@@ -49,46 +52,133 @@



ts_bool vtx_add_neighbour(ts_vertex **vtx, ts_vertex **nvtx){
ts_bool vtx_add_neighbour(ts_vertex *vtx, ts_vertex *nvtx){
    ts_uint i;
    /* no neighbour can be null! */
    if(vtx==NULL || nvtx==NULL) return TS_FAIL;
    
    /*if it is already a neighbour don't add it to the list */
    for(i=0; i<(*vtx)->neigh_no;i++){
        if((*vtx)->neigh[i]==nvtx) return TS_FAIL;
    for(i=0; i<vtx->data->neigh_no;i++){
        if(vtx->data->neigh[i]==nvtx) return TS_FAIL;
    }
    ts_uint nn=(*vtx)->neigh_no++;
    (*vtx)->neigh=(ts_vertex ***)realloc((*vtx)->neigh, nn*sizeof(ts_vertex **));
    (*vtx)->neigh[nn]=nvtx;
    ts_uint nn=++vtx->data->neigh_no;
    vtx->data->neigh=(ts_vertex **)realloc(vtx->data->neigh, nn*sizeof(ts_vertex *));
    vtx->data->neigh[nn-1]=nvtx;

    /* pa se sosedu dodamo vertex */
    /*if it is already a neighbour don't add it to the list */
    for(i=0; i<(*nvtx)->neigh_no;i++){
        if((*nvtx)->neigh[i]==vtx) return TS_FAIL;
    for(i=0; i<nvtx->data->neigh_no;i++){
        if(nvtx->data->neigh[i]==vtx) return TS_FAIL;
    } 
    nn=(*nvtx)->neigh_no++;
    (*nvtx)->neigh=(ts_vertex ***)realloc((*nvtx)->neigh, nn*sizeof(ts_vertex **));
    (*nvtx)->neigh[nn]=vtx;
    nn=++nvtx->data->neigh_no;
    nvtx->data->neigh=(ts_vertex **)realloc(nvtx->data->neigh, nn*sizeof(ts_vertex *));
    nvtx->data->neigh[nn-1]=vtx;


/* Ustvari bond in doloci dolzino */
    return TS_SUCCESS;
}

/* TODO: optimize this. test this. */
ts_bool vtx_remove_neighbour(ts_vertex *vtx, ts_vertex *nvtx){
/* find a neighbour */
/* remove it from the list while shifting remaining neighbours up */
    ts_uint i,j=0;
    for(i=0;i<vtx->data->neigh_no;i++){
        if(vtx->data->neigh[i]!=nvtx){
            vtx->data->neigh[j]=vtx->data->neigh[i];
            j++;
        }
    }
/* resize memory. potentionally time consuming */
    vtx->data->neigh_no--;
    vtx->data->neigh=(ts_vertex **)realloc(vtx->data->neigh,vtx->data->neigh_no*sizeof(ts_vertex *));
    if(vtx->data->neigh == NULL && vtx->data->neigh_no!=0)
        fatal("Reallocation of memory failed during removal of vertex neighbour in vtx_remove_neighbour",100);

/* repeat for the neighbour */
/* find a neighbour */
/* remove it from the list while shifting remaining neighbours up */
    for(i=0;i<nvtx->data->neigh_no;i++){
        if(nvtx->data->neigh[i]!=vtx){
            nvtx->data->neigh[j]=nvtx->data->neigh[i];
            j++;
        }
    }
/* resize memory. potentionally time consuming. */
    nvtx->data->neigh_no--;
    nvtx->data->neigh=(ts_vertex **)realloc(nvtx->data->neigh,nvtx->data->neigh_no*sizeof(ts_vertex *));
    if(nvtx->data->neigh == NULL && nvtx->data->neigh_no!=0)
        fatal("Reallocation of memory failed during removal of vertex neighbour in vtx_remove_neighbour",100);

    return TS_SUCCESS;
}


ts_bool vtx_free(ts_vertex **vtx){
    if((*vtx)->neigh!=NULL)   free((*vtx)->neigh);
    if((*vtx)->tristar!=NULL) free((*vtx)->tristar);
    if((*vtx)->bond!=NULL)    free((*vtx)->bond);
    if((*vtx)->cell!=NULL)    free((*vtx)->cell);
    free(*vtx);
ts_bool vtx_add_bond(ts_bond_list *blist,ts_vertex *vtx1,ts_vertex *vtx2){
    ts_bond *bond;
    bond=bond_add(blist,vtx1,vtx2);
    if(bond==NULL) return TS_FAIL;
    vtx1->data->bond_no++;
    vtx2->data->bond_no++;

    vtx1->data->bond=(ts_bond **)realloc(vtx1->data->bond, vtx1->data->bond_no*sizeof(ts_bond *)); 
    vtx2->data->bond=(ts_bond **)realloc(vtx2->data->bond, vtx2->data->bond_no*sizeof(ts_bond *)); 
    vtx1->data->bond[vtx1->data->bond_no-1]=bond;
    vtx2->data->bond[vtx2->data->bond_no-1]=bond;
    return TS_SUCCESS;
}

ts_bool vtx_add_cneighbour(ts_bond_list *blist, ts_vertex *vtx1, ts_vertex *vtx2){
    ts_bool retval;
    retval=vtx_add_neighbour(vtx1,vtx2);
    if(retval==TS_SUCCESS)
    retval=vtx_add_bond(blist,vtx1,vtx2); 
    return retval;
}

/*TODO: write and optimize this urgently before use! */
ts_bool vtx_remove_cneighbour(ts_bond_list *blist, ts_vertex *vtx1, ts_vertex
*vtx2){
//    ts_bool retval;
/* remove the bond */
//retval=vtx_remove_bond(blist,vtx1,vtx2);
/* remove the vertices */
    return TS_SUCCESS;
}


inline ts_double vertex_distance_sq(ts_vertex **vtx1, ts_vertex **vtx2){

ts_bool vtx_data_free(ts_vertex_data *data){
    if(data->neigh!=NULL)   free(data->neigh);
    if(data->tristar!=NULL) free(data->tristar);
    if(data->bond!=NULL)    free(data->bond);
    if(data->cell!=NULL)    free(data->cell);
    free(data);
    return TS_SUCCESS;
}

/*not usable. can be deleted */
ts_bool vtx_free(ts_vertex  *vtx){
    vtx_data_free(vtx->data);
    free(vtx);
    return TS_SUCCESS;
}

ts_bool vtx_list_free(ts_vertex_list *vlist){
    int i;
    for(i=0;i<vlist->n;i++){
        vtx_data_free(vlist->vtx[i]->data);
    }
    free(*(vlist->vtx));
    free(vlist->vtx);
    free(vlist);
    return TS_SUCCESS;
}



/* rewrite for additional structure in chain */
/*inline ts_double vtx_distance_sq(ts_vertex *vtx1, ts_vertex *vtx2){
    ts_double dist;
#ifdef TS_DOUBLE_DOUBLE
    dist=pow((*vtx1)->x-(*vtx2)->x,2) + pow((*vtx1)->y-(*vtx2)->y,2) + pow((*vtx1)->z-(*vtx2)->z,2);
@@ -101,4 +191,4 @@
#endif
    return(dist);
}

*/