Trisurf Monte Carlo simulator
Samo Penic
2016-07-13 90882f51387b945bc0f660d8b12200b2f48e80fa
python/tape
@@ -1,6 +1,6 @@
####### Vesicle definitions ###########
# nshell is a number of divisions of dipyramid
nshell=5
nshell=10
# dmax is the max. bond length (in units l_min)
dmax=1.7
# dmin_interspecies in the min. dist. between different vertex species (in units l_min)
@@ -17,15 +17,15 @@
pressure=0.0
#Constant volume constraint (0 disable constant volume, 1 enable wiht additional vertex move, 2 enable with epsvol)
constvolswitch=2
constvolswitch=0
constvolprecision=1e-14
#Constant area constraint (0 disable constant area, 2 enable constant area with epsarea)
constareaswitch=2
constareaswitch=0
####### Polymer (brush) definitions ###########
# npoly is a number of polymers attached to npoly distinct vertices on vesicle
npoly=2
npoly=60
# nmono is a number of monomers in each polymer
nmono=10
# Spring constant between monomers of the polymer
@@ -55,7 +55,7 @@
mcsweeps=200
#how many initial mcsweeps*inititer MC sweeps before recording to disk?
#2
inititer=0
inititer=10
#how many records do you want on the disk iteration are there in a run?
#10000
iterations=100
@@ -63,7 +63,7 @@
###### Spherical harmonics ###########
# If 0 then spherical harmonics are not calculated at all.
spherical_harmonics_coefficients=21
spherical_harmonics_coefficients=0
#shut up if we are using cluster!!!
quiet=false