Dump and restore complete and debugged. Still, use with caution

Samo Penic

2014-03-06 86f5e72cbecb70197e77fb5e411874d6b015ebdd

 src/io.c

@@ -22,7 +22,7 @@
    FILE *fh=fopen("dump.bin","wb");

    /* dump vesicle */
    fwrite(vesicle, sizeof(vesicle),1,fh);
    fwrite(vesicle, sizeof(ts_vesicle),1,fh);
    /* dump vertex list */
    fwrite(vesicle->vlist, sizeof(ts_vertex_list),1,fh);
    /* dump bond list */
@@ -144,7 +144,9 @@
/* we restore all the data from the dump */
    /* restore vesicle */
    ts_vesicle *vesicle=(ts_vesicle *)calloc(1,sizeof(ts_vesicle));
    retval=fread(vesicle, sizeof(vesicle),1,fh);
    retval=fread(vesicle, sizeof(ts_vesicle),1,fh);
//   fprintf(stderr,"was here! %e\n",vesicle->dmax);

    /* restore vertex list */
    vesicle->vlist=(ts_vertex_list *)malloc(sizeof(ts_vertex_list));
    retval=fread(vesicle->vlist, sizeof(ts_vertex_list),1,fh);
@@ -172,11 +174,13 @@
    for(i=0;i<vesicle->tlist->n;i++){
        vesicle->tlist->tria[i]=(ts_triangle *)malloc(sizeof(ts_triangle));
}

  /*restore vertices*/
/* prerequisity. Vertices must be malloced before vertexes are recreated */
    vesicle->vlist->vtx=(ts_vertex **)calloc(vesicle->vlist->n,sizeof(ts_vertex *));
    for(i=0;i<vesicle->vlist->n;i++){
 for(i=0;i<vesicle->vlist->n;i++){
        vesicle->vlist->vtx[i]=(ts_vertex *)malloc(sizeof(ts_vertex));
 }
  /*restore vertices*/
    for(i=0;i<vesicle->vlist->n;i++){
        retval=fread(vesicle->vlist->vtx[i],sizeof(ts_vertex),1,fh);
        /*restore neigh, bond, tristar. Ignoring cell */
        vesicle->vlist->vtx[i]->neigh=(ts_vertex **)calloc(vesicle->vlist->vtx[i]->neigh_no, sizeof(ts_vertex *));