dont know

Samo Penic

2014-03-05 719c9febac2eaff9483fda487b57684afbb59bb2

 src/general.h

@@ -8,10 +8,11 @@
  * @file header.h
  * @author Samo Penic
  * @date 5.3.2001
  *
  * 
  * Header file for general inclusion in all the code, defining data structures
  * and general constans. All datatypes used in the code is also defined here.
  *
  * Miha: branch trisurf-polyel
  */

/* Defines */
@@ -60,6 +61,11 @@
 *   TS_DOUBLE_LONGDOUBLE
*/
#define TS_DOUBLE_DOUBLE

/** @brief Constant defines the size by which vertex_list expands at once, so expansion is not needed each time new data arrives. Also
 * vlist will be decreased by same steps.
 */
#define TS_VLIST_CHUNK 7

/** For the purpose of greater flexibility all data types used in the program
 *  shouldn't use standard C types, but should use types defined here.
@@ -125,8 +131,12 @@
    ts_uint coord_type;
} ts_coord;

<<<<<<< HEAD



=======
>>>>>>> e9eab4fb2f72383a1a2adbe5f09f7bbd1fd45768
/** @brief Data structure of all data connected to a vertex
 *
 *  ts_vertex holds the data for one single point (bead, vertex). To understand how to use it
@@ -136,8 +146,9 @@
        ts_double x; /**< The x coordinate of vertex. */
        ts_double y; /**< The y coordinate of vertex. */
        ts_double z; /**< The z coordinate of vertex. */
        ts_uint neigh_no; /**< The number of neighbours. */
        struct ts_vertex **neigh; /**< The pointer that holds neigh_no pointers to this structure. */
//        ts_uint neigh_no; /**< The number of neighbours. */
//        struct ts_vertex **neigh; /**< The pointer that holds neigh_no pointers to this structure. */
   struct ts_vertex_list *neigh;
        ts_double *bond_length; /**< Obsolete! The bond lenght is moved to ts_bond */
        ts_double *bond_length_dual; /**< Obsolete! Bond length in dual lattice is moved to ts_bond! */
        ts_double curvature;
@@ -154,21 +165,28 @@
        ts_double projArea;
        ts_double relR;
        ts_double solAngle;
   struct ts_poly *grafted_poly;
};
typedef struct ts_vertex ts_vertex;

typedef struct {
struct ts_vertex_list{
    ts_uint n;
    ts_uint list_size;
    ts_vertex **vtx;

} ts_vertex_list;
};
typedef struct ts_vertex_list ts_vertex_list;

struct ts_bond {
    ts_uint idx;
       ts_uint idx;
   ts_vertex *vtx1;
   ts_vertex *vtx2;
   ts_vertex *adjvtx[2];
   struct ts_triangle *tria[2];
    ts_double bond_length;
    ts_double bond_length_dual;
   ts_bool tainted;
   ts_double energy;
};
typedef struct ts_bond ts_bond;

@@ -187,6 +205,7 @@
   ts_double ynorm;
   ts_double znorm;
    ts_double area; // firstly needed for sh.c
    ts_double volume; // firstly needed for sh.c
};
typedef struct ts_triangle ts_triangle;

@@ -215,11 +234,30 @@

typedef struct {
    ts_uint l;
    ts_uint i;
    ts_double **ulm;
    ts_double **sumUlm2;
    ts_uint N;
    ts_double **co;
    ts_double ***Ylmi;
} ts_spharm;



struct ts_poly {
   ts_vertex_list *vlist;
   ts_bond_list *blist;
   ts_vertex *grafted_vtx;
   ts_double k;
};
typedef struct ts_poly ts_poly;


struct ts_poly_list {
   ts_uint   n;
   ts_poly **poly;
};
typedef struct ts_poly_list ts_poly_list;




@@ -227,14 +265,17 @@
   ts_vertex_list *vlist;
   ts_bond_list *blist;
   ts_triangle_list *tlist;
    ts_cell_list *clist;
   ts_cell_list *clist;
   ts_uint nshell;
    ts_double bending_rigidity;
    ts_double dmax;
    ts_double stepsize;
    ts_double cm[3];
    ts_double volume;
    ts_spharm *sphHarmonics;
   ts_double bending_rigidity;
   ts_double dmax;
   ts_double stepsize;
      ts_double cm[3];
   ts_double volume;
   ts_spharm *sphHarmonics;

   ts_poly_list *poly_list;
   ts_double spring_constant;
} ts_vesicle;