finished rewritting. start debugging

Samo Penic

2013-11-30 6fa0c93a432b95a6b888882494fcafb11c41515c

 src/timestep.c

@@ -7,7 +7,6 @@
#include "vertexmove.h"
#include "bondflip.h"
#include "frame.h"
#include "vertex.h"
#include "io.h"
ts_bool run_simulation(ts_vesicle *vesicle, ts_uint mcsweeps, ts_uint inititer, ts_uint iterations){
   ts_uint i, j;
@@ -31,25 +30,21 @@
ts_bool single_timestep(ts_vesicle *vesicle){
    ts_bool retval;
    ts_double rnvec[3];
    ts_uint i;// b;
    ts_uint i, b;
    for(i=0;i<vesicle->vlist->n;i++){
        rnvec[0]=drand48();
        rnvec[1]=drand48();
        rnvec[2]=drand48();
   vertex_taint(vesicle->vlist->vtx[i],1);
//      ts_fprintf(stdout, "Vertex %d should be tainted, level=%d.\n", i, vesicle->vlist->vtx[i]->locked);
   if(vertex_tainted(vesicle->vlist->vtx[i],1,1)){
      ts_fprintf(stdout, "Vertex %d tainted, level=%d. Waiting....\n", i, vesicle->vlist->vtx[i]->locked);
      while(vertex_tainted(vesicle->vlist->vtx[i],1,1));
   }
        retval=single_verticle_timestep(vesicle,vesicle->vlist->vtx[i],rnvec);
   vertex_untaint(vesicle->vlist->vtx[i],1);
//      ts_fprintf(stdout, "Vertex %d should be untainted, level=%d.\n", i, vesicle->vlist->vtx[i]->locked);
    }

//   ts_int cnt=0;
/*
    for(i=0;i<vesicle->vlist->n;i++){
//why is rnvec needed in bondflip?
/*        rnvec[0]=drand48();
        rnvec[1]=drand48();
        rnvec[2]=drand48();
*/ 
   b=rand() % vesicle->blist->n;
        //find a bond and return a pointer to a bond...
        //call single_bondflip_timestep...
@@ -57,7 +52,6 @@
//   if(retval==TS_SUCCESS) cnt++;        
    } 
//   printf("Bondflip success rate in one sweep: %d/%d=%e\n", cnt,vesicle->blist->n,(double)cnt/(double)vesicle->blist->n);
*/
   if(retval);
    return TS_SUCCESS;
}