Tape is in the dump and successfully restored.

Samo Penic

2016-02-29 698ae18f535c3e388b6ebcdca1582005a29ff2f2

 src/restore.c

@@ -14,12 +14,12 @@
#include "energy.h"
#include "poly.h"
#include "initial_distribution.h"
#include "io.h"

ts_bool parseDump(char *dumpfname) {
   xmlDocPtr doc;
   xmlNodePtr cur, cur1,cur2;
   ts_vesicle *vesicle=NULL;

   doc = xmlParseFile(dumpfname);
   
   if (doc == NULL ) {
@@ -38,6 +38,11 @@
   
   cur = cur->xmlChildrenNode;
   while (cur != NULL) {

      if ((!xmlStrcmp(cur->name, (const xmlChar *)"tape"))){
         setGlobalTapeTXTfromTapeTag(doc, cur);
      }

      if ((!xmlStrcmp(cur->name, (const xmlChar *)"trisurf"))){
         vesicle=parseTrisurfTag(doc, cur);
      }
@@ -84,6 +89,12 @@
   return TS_SUCCESS;
}

ts_bool setGlobalTapeTXTfromTapeTag(xmlDocPtr doc, xmlNodePtr cur){
   xmlChar *tape = xmlNodeListGetString(doc, cur->xmlChildrenNode, 1);
   strcpy(tapetxt,(char *)tape);
   xmlFree(tape);
   return TS_SUCCESS;
}


/* this is a parser of additional data in xml */
@@ -129,8 +140,10 @@
   nvtx = xmlGetProp(cur, (xmlChar *)"nvtx");
   npoly=xmlGetProp(cur, (xmlChar *)"npoly");
   nfono=xmlGetProp(cur, (xmlChar *)"nfono");
   fprintf(stderr,"nvtx=%u\n",atoi((char *)nvtx));
   ts_vesicle *vesicle=init_vesicle(atoi((char *)nvtx),10,10,10,0.1);
   ts_tape *tape=parsetapebuffer(tapetxt);
   //fprintf(stderr,"nvtx=%u\n",atoi((char *)nvtx));
   //TODO: check if nvtx is in agreement with nshell from tape
   ts_vesicle *vesicle=init_vesicle(atoi((char *)nvtx),tape->ncxmax,tape->ncymax,tape->nczmax,tape->stepsize);
   //vesicle->poly_list=init_poly_list(atoi((char *)npoly),atoi((char *)nmono), vesicle->vlist, vesicle);
   xmlFree(nvtx);
   xmlFree(npoly);
@@ -155,6 +168,8 @@
   }


   vesicle->tape=tape;
   set_vesicle_values_from_tape(vesicle);

   return vesicle;
}