Solved some, still missing some

Samo Penic

2019-10-17 692fb5ed82bb9b6ee4be4d5463323585d142c0ea

 src/restore.c

@@ -79,11 +79,10 @@
      // END Point Position data & Bonds
   cur = cur->next;
   }
	
   xmlFreeDoc(doc);

//   vesicle->poly_list=init_poly_list(0, 0, vesicle->vlist, vesicle);

   set_vesicle_values_from_tape(vesicle);
   init_normal_vectors(vesicle->tlist);
   mean_curvature_and_energy(vesicle);
   sweep_attraction_bond_energy(vesicle);
@@ -157,7 +156,8 @@
   //fprintf(stderr,"nvtx=%u\n",atoi((char *)nvtx));
   //TODO: check if nvtx is in agreement with nshell from tape
   ts_vesicle *vesicle=init_vesicle(atoi((char *)nvtx),tape->ncxmax,tape->ncymax,tape->nczmax,tape->stepsize);
   //vesicle->poly_list=init_poly_list(atoi((char *)npoly),atoi((char *)nmono), vesicle->vlist, vesicle);
//   vesicle->poly_list=init_poly_list(atoi((char *)npoly),atoi((char *)nmono), vesicle->vlist, vesicle);
   vesicle->poly_list=init_empty_poly_list(atoi((char *)npoly),atoi((char *)nmono));
   xmlFree(nvtx);
   xmlFree(npoly);
   xmlFree(nmono);
@@ -190,9 +190,8 @@
   child = child->next;
   }


   vesicle->tape=tape;
   set_vesicle_values_from_tape(vesicle);
//   set_vesicle_values_from_tape(vesicle);
   return vesicle;
}