Added stub function for clustering

Samo Penic

2016-07-05 62b11daa07f943c5ab047049cf2e2803188d467c

 src/general.h

@@ -156,7 +156,8 @@
        ts_double projArea;
        ts_double relR;
        ts_double solAngle;
   struct ts_poly *grafted_poly;
      struct ts_poly *grafted_poly;
      struct ts_cluster *cluster;
};
typedef struct ts_vertex ts_vertex;

@@ -260,6 +261,9 @@
   long int nfil;
   long int nfono;
   long int R_nucleus;
   ts_double R_nucleusX;
   ts_double R_nucleusY;
   ts_double R_nucleusZ;
   long int pswitch;
    long int constvolswitch;
    long int constareaswitch;
@@ -280,6 +284,9 @@
   long int mcsweeps;
   long int quiet;
   long int shc;
   long int number_of_vertices_with_c0;
   ts_double c0;
   ts_double w;
} ts_tape;


@@ -307,9 +314,27 @@
   ts_int pswitch;
    ts_tape *tape;
   ts_double R_nucleus;
   ts_double R_nucleusX;
   ts_double R_nucleusY;
   ts_double R_nucleusZ;
   ts_double nucleus_center[3];
    ts_double area;
} ts_vesicle;



struct ts_cluster{
   ts_uint nvtx;
   ts_uint idx;
   ts_vertex **vtx;
};

typedef struct ts_cluster ts_cluster;

typedef struct{
   ts_uint n;
   ts_cluster **cluster;
} ts_cluster_list;


/* GLOBAL VARIABLES */
@@ -339,4 +364,11 @@
#define VTX(n) &(vlist->vtx[n])
#define VTX_DATA(n) vlist->vtx[n].data


/* FOR PID GENERATION ROUTINE */
#define CPF_CLOEXEC 1

int createPidFile(const char *progName, const char *pidFile, int flags);

int lockRegion(int fd, int type, int whence, int start, int len);
#endif