Added stub function for clustering

Samo Penic

2016-07-05 62b11daa07f943c5ab047049cf2e2803188d467c

 src/bondflip.c

@@ -168,6 +168,7 @@
  oldenergy+=kp->xk* kp->energy;
  oldenergy+=km->xk* km->energy;
  oldenergy+=it->xk* it->energy;
  oldenergy+=bond->energy; /* attraction with neighboring vertices, that have spontaneous curvature */
  //Neigbours of k, it, km, kp don't change its energy.

   if(vesicle->pswitch == 1 || vesicle->tape->constvolswitch>0){dvol = -lm->volume - lp->volume;}
@@ -177,7 +178,7 @@
*/

/* fix data structure for flipped bond */
    ts_flip_bond(k,it,km,kp, bond,lm, lp, lm2, lp1);
    ts_flip_bond(k,it,km,kp, bond,lm, lp, lm2, lp1, vesicle->tape->w);


/* Calculating the new energy */
@@ -186,6 +187,7 @@
  delta_energy+=kp->xk* kp->energy;
  delta_energy+=km->xk* km->energy;
  delta_energy+=it->xk* it->energy;
  delta_energy+=bond->energy; /* attraction with neighboring vertices, that have spontaneous curvature */
  //Neigbours of k, it, km, kp don't change its energy.

    delta_energy-=oldenergy;
@@ -369,7 +371,7 @@


ts_bool ts_flip_bond(ts_vertex *k,ts_vertex *it,ts_vertex *km, ts_vertex *kp,
ts_bond *bond, ts_triangle *lm, ts_triangle *lp, ts_triangle *lm2, ts_triangle *lp1){
ts_bond *bond, ts_triangle *lm, ts_triangle *lp, ts_triangle *lm2, ts_triangle *lp1, ts_double w_energy){

    ts_uint i; //lmidx, lpidx;
if(k==NULL || it==NULL || km==NULL || kp==NULL){
@@ -435,6 +437,7 @@
  energy_vertex(kp);
  energy_vertex(km);
  energy_vertex(it);
  attraction_bond_energy(bond, w_energy);
// END modifications to data structure!
    return TS_SUCCESS;
}