continuation s working. now reset counter is needed

Samo Penic

2014-03-08 62681163a4c47fc6dbd6b2b96f84171b20cba3ed

 src/timestep.c

@@ -9,19 +9,20 @@
#include "frame.h"
#include "io.h"

ts_bool run_simulation(ts_vesicle *vesicle, ts_uint mcsweeps, ts_uint inititer, ts_uint iterations){
ts_bool run_simulation(ts_vesicle *vesicle, ts_uint mcsweeps, ts_uint inititer, ts_uint iterations, ts_uint start_iteration){
   ts_uint i, j;

   centermass(vesicle);
   cell_occupation(vesicle);
   ts_fprintf(stdout, "Starting simulation (first %d x %d MC sweeps will not be recorded on disk)\n", inititer, mcsweeps);
   for(i=0;i<inititer+iterations;i++){
   if(start_iteration<inititer) ts_fprintf(stdout, "Starting simulation (first %d x %d MC sweeps will not be recorded on disk)\n", inititer, mcsweeps);
   for(i=start_iteration;i<inititer+iterations;i++){
      for(j=0;j<mcsweeps;j++){
         single_timestep(vesicle);
      }
      centermass(vesicle);
      cell_occupation(vesicle);
      ts_fprintf(stdout,"Done %d out of %d iterations (x %d MC sweeps).\n",i+1,inititer+iterations,mcsweeps);
            dump_state(vesicle,i);
      if(i>inititer){
         write_vertex_xml_file(vesicle,i-inititer);
      }