Trisurf Monte Carlo simulator
Samo Penic
2014-03-08 62681163a4c47fc6dbd6b2b96f84171b20cba3ed
src/general.h
@@ -3,15 +3,15 @@
#include<stdarg.h>
#include<stdio.h>
/* @brief This is a header file, defining general constants and structures.
  * @file header.h
  * @author Samo Penic
  * @date 5.3.2001
  *
  *
  * Header file for general inclusion in all the code, defining data structures
  * and general constans. All datatypes used in the code is also defined here.
  *
  * Miha: branch trisurf-polyel
  */
/* Defines */
@@ -125,8 +125,6 @@
    ts_uint coord_type;
} ts_coord;
/** @brief Data structure of all data connected to a vertex
 *
 *  ts_vertex holds the data for one single point (bead, vertex). To understand how to use it
@@ -154,6 +152,7 @@
        ts_double projArea;
        ts_double relR;
        ts_double solAngle;
   struct ts_poly *grafted_poly;
};
typedef struct ts_vertex ts_vertex;
@@ -164,11 +163,13 @@
} ts_vertex_list;
struct ts_bond {
    ts_uint idx;
       ts_uint idx;
   ts_vertex *vtx1;
   ts_vertex *vtx2;
    ts_double bond_length;
    ts_double bond_length_dual;
   ts_bool tainted;
   ts_double energy;
};
typedef struct ts_bond ts_bond;
@@ -217,9 +218,29 @@
typedef struct {
    ts_uint l;
    ts_double **ulm;
    ts_double **sumUlm2;
    ts_uint N;
    ts_double **co;
    ts_double ***Ylmi;
} ts_spharm;
struct ts_poly {
   ts_vertex_list *vlist;
   ts_bond_list *blist;
   ts_vertex *grafted_vtx;
   ts_double k;
};
typedef struct ts_poly ts_poly;
struct ts_poly_list {
   ts_uint   n;
   ts_poly **poly;
};
typedef struct ts_poly_list ts_poly_list;
@@ -227,18 +248,45 @@
   ts_vertex_list *vlist;
   ts_bond_list *blist;
   ts_triangle_list *tlist;
    ts_cell_list *clist;
   ts_cell_list *clist;
   ts_uint nshell;
    ts_double bending_rigidity;
    ts_double dmax;
    ts_double stepsize;
    ts_double cm[3];
    ts_double volume;
    ts_spharm *sphHarmonics;
   ts_double bending_rigidity;
   ts_double dmax;
   ts_double stepsize;
      ts_double cm[3];
   ts_double volume;
   ts_spharm *sphHarmonics;
   ts_poly_list *poly_list;
   ts_double spring_constant;
   ts_double pressure;
   ts_int pswitch;
} ts_vesicle;
typedef struct {
   long int nshell;
   long int ncxmax;
   long int ncymax;
   long int nczmax;
   long int npoly;
   long int nmono;
   long int pswitch;
       char *multiprocessing;
      long int brezveze0;
       long int brezveze1;
       long int brezveze2;
       ts_double xk0;
   ts_double dmax;
   ts_double stepsize;
   ts_double kspring;
   ts_double pressure;
   long int iterations;
   long int inititer;
   long int mcsweeps;
   long int quiet;
} ts_tape;
/* GLOBAL VARIABLES */