Merge branch 'stretching-devel' into plane-new

Samo Penic

2019-02-08 4019ca8157136a68b6e43b31f166dc93acd81b4d

 src/general.h

@@ -195,11 +195,13 @@
   ts_double znorm;
    ts_double area; // firstly needed for sh.c
    ts_double volume; // firstly needed for sh.c
   ts_double energy;
};
typedef struct ts_triangle ts_triangle;

struct ts_triangle_list{
    ts_uint n;
   ts_double a0;
    ts_triangle **tria;
};
typedef struct ts_triangle_list ts_triangle_list;
@@ -250,6 +252,11 @@
typedef struct ts_poly_list ts_poly_list;


typedef struct{
   ts_float z_max;
   ts_float z_min;
   ts_int force_switch;
} ts_confinement_plane;

typedef struct {
   long int nshell;
@@ -268,6 +275,8 @@
   long int pswitch;
    long int constvolswitch;
    long int constareaswitch;
   long int stretchswitch;
   ts_double xkA0;
    ts_double constvolprecision;
       char *multiprocessing;
      long int brezveze0;
@@ -289,6 +298,9 @@
   ts_double c0;
   ts_double w;
   ts_double F;
   long int plane_confinement_switch;
   ts_double plane_d;
   ts_double plane_F;
} ts_tape;


@@ -314,13 +326,14 @@
   ts_double spring_constant;
   ts_double pressure;
   ts_int pswitch;
    ts_tape *tape;
    ts_tape *tape;
   ts_double R_nucleus;
   ts_double R_nucleusX;
   ts_double R_nucleusY;
   ts_double R_nucleusZ;
   ts_double nucleus_center[3];
    ts_double area;
   ts_double area;
   ts_confinement_plane confinement_plane;
} ts_vesicle;


@@ -373,4 +386,5 @@
int createPidFile(const char *progName, const char *pidFile, int flags);

int lockRegion(int fd, int type, int whence, int start, int len);
char *libVersion();
#endif