added statistics output to the outer loop

Samo Penic

2014-04-07 37d14a0a50ed40f536cc3821b3584552e1b75c5c

 src/io.h

@@ -1,6 +1,57 @@
#ifndef _IO_H
#define _IO_H

/** @ Global variables for I/O operations like filenames etc. */
/*static char mastername[1024];
static char prefixname[1024];
static ts_bool restore=0;
static char tape[1024]; */
int force_from_tape;


typedef struct {
   long int nshell;
   long int ncxmax;
   long int ncymax;
   long int nczmax;
   long int npoly;
   long int nmono;
   long int nfil;
   long int nfono;
   long int R_nucleus;
   long int pswitch;
       char *multiprocessing;
      long int brezveze0;
       long int brezveze1;
       long int brezveze2;
       ts_double xk0;
   ts_double dmax;
   ts_double dmin_interspecies;
   ts_double stepsize;
   ts_double kspring;
   ts_double xi;
   ts_double pressure;
   long int iterations;
   long int inititer;
   long int mcsweeps;
   long int quiet;
} ts_tape;

typedef struct{
   ts_int force_from_tape;
   ts_int reset_iteration_count;
    char path[1024]; //path where all files should be added
    char output_fullfilename[1024]; //name of the master file
    char dump_fullfilename[1024]; //name of the dump file
    char tape_fullfilename[1024]; //name of the tape file
} ts_args;

ts_args command_line_args;

ts_bool parse_args(int argc, char **argv);



/** @brief Prints the position of vertices for the whole list
 *  
 *  The function is meant more or less as a debug tool, but can be used in production
@@ -46,8 +97,13 @@
 *   @param *text is a description line (max. 255 characters) to be included in the file
 */
ts_bool write_vertex_vtk_file(ts_vesicle *vesicle,ts_char *filename, ts_char *text);
ts_bool write_vertex_xml_file(ts_vesicle *vesicle, ts_uint timestepno);
ts_bool write_master_xml_file(ts_char *filename);
ts_bool write_pov_file(ts_vesicle *vesicle, char *filename);

ts_bool parsetape(ts_vesicle *vesicle,ts_uint *iterations);
ts_tape *parsetape(char *filename);
ts_bool tape_free(ts_tape *tape);


ts_bool dump_state(ts_vesicle *vesicle, ts_uint iteration);
ts_vesicle *restore_state(ts_uint *iteration);
#endif