Minimal changes to trisurf core to permit the trout rbc simulations with el...

Samo Penic

2016-05-20 37791bf67add4094040a9b8706450695805bf88f

 python/trisurf/tsmgr.py

@@ -1,17 +1,43 @@
import sys, getopt
import tabulate
import subprocess,re

def printHelp():
   print('Python module tsmgr accept following switches:\n')
   print('tsmgr [-n process number] [-R] [-h] [-r] [-s] [-c comment text] [-a comment text]\n')
   print('[-n process number]: number of process for which -s -r -c or -a switch apply. Should be placed before any other switch');
   print('[-R]               : raw output for -s switch');
   print('[-r]               : run process');
   print('[-s]               : process status');
   print('[-c comment text]  : write new comment for process');
   print('[-a comment text]  : append additional comment for process');
   print('[-h]               : print help');


def getTrisurfVersion():
   p = subprocess.Popen('trisurf --version', shell=True, stdout=subprocess.PIPE, stderr=subprocess.STDOUT)
   lines=p.stdout.readlines()
   version=re.findall(r'[0-9a-f]{7}(?:-dirty)?', lines[0].decode('ascii'))
   p.wait()
   if(len(version)):
      return version[0]
   else:
      return "unknown version"

def start(Runs):
   argv=sys.argv[1:]
   processno=0
   raw=False
   try:
      opts, args = getopt.getopt(argv,"a:n:hrsc:")
      opts, args = getopt.getopt(argv,"Ra:n:hrsc:")
   except getopt.GetoptError:
      print('tsmgr [-n process number] [-h] [-r] [-s] [-c comment text] [-a comment text]')
      printHelp()
      sys.exit(2)
   for opt, arg in opts:
      if opt == '-h':
         print ('tsmgr [-n process number] [-h] [-r] [-s] [-c comment text] [-a comment text]')
      if opt == '-R':
         raw=True
      elif opt == '-h':
         printHelp()
         sys.exit()
      elif opt == '-r':
         if processno:
@@ -32,9 +58,11 @@
            line.insert(0,i)
            report.append(line)
            i=i+1
            #print(reportstr)
         print ("\n\nTrisurf running processes report\n")
         print (tabulate.tabulate(report,headers=["Run no.", "Run start time", "ETA", "Status", "PID", "Path", "Comment"], tablefmt='fancy_grid'))
         if(raw):
            print(report)
         else:
            print ("\n\nTrisurf running processes report\n")
            print (tabulate.tabulate(report,headers=["Run no.", "Run start time", "ETA", "Status", "PID", "Path", "Comment"], tablefmt='fancy_grid'))
      elif opt == '-n':
         processno=int(arg)
         if processno<1 or processno>len(Runs) :
@@ -50,7 +78,7 @@

         
      else:
         print('tsmgr [-n process number] [-h] [-r] [-s] [-c comment text] [-a comment text]')
         printHelp()
         sys.exit(2)