A fix in restoring from snapshot when filaments are used

Samo Penic

2016-05-24 301c87b8a0ae31d97adf840d90dd241ffb3328b6

 src/tape

@@ -1,6 +1,6 @@
####### Vesicle definitions ###########
# nshell is a number of divisions of dipyramid
nshell=5
nshell=17
# dmax is the max. bond length (in units l_min)
dmax=1.7
# dmin_interspecies in the min. dist. between different vertex species (in units l_min)
@@ -12,12 +12,12 @@

# Pressure calculations
# (pswitch=1: calc. p*dV energy contribution)
pswitch = 0
pswitch = 1
# pressure difference: p_inside - p_outside (in units kT/l_min^3):
pressure=0.0
pressure=-10.0

#Constant volume constraint (0 disable constant volume, 1 enable wiht additional vertex move, 2 enable with epsvol)
constvolswitch=2
constvolswitch=0
constvolprecision=1e-14

#Constant area constraint (0 disable constant area, 2 enable constant area with epsarea)
@@ -25,7 +25,7 @@

####### Polymer (brush) definitions ###########
# npoly is a number of polymers attached to npoly distinct vertices on vesicle
npoly=0
npoly=3
# nmono is a number of monomers in each polymer
nmono=10
# Spring constant between monomers of the polymer
@@ -33,7 +33,7 @@

####### Filament (inside the vesicle) definitions ###########
# nfil is a number of filaments inside the vesicle
nfil=0
nfil=2
# nfono is a number of monomers in each filament
nfono=300
# Persistence lenght of the filaments (in units l_min)
@@ -42,7 +42,9 @@
####### Nucleus (inside the vesicle) ###########
# Radius of an impenetrable hard sphere inside the vesicle
R_nucleus=0

R_nucleusX=2.0
R_nucleusY=6.0
R_nucleusZ=2.0
#######  Cell definitions ############
nxmax=60
nymax=60