Code for incremental adding of inclusions done

Samo Penic

2020-04-26 3006183b769f2e126b1a96e6bf697c2b7f657df7

 src/initial_distribution.h

@@ -1,6 +1,9 @@
/** @brief initial bond length */
#define A0 1.2 
/* vim: set ts=4 sts=4 sw=4 noet : */
#include "io.h"


/** @brief initial bond length */
#define DEF_A0 1.2 

/** @brief Creates initial distribution of vertices
  *
@@ -10,12 +13,17 @@
*/
ts_vesicle *initial_distribution_dipyramid(ts_uint nshell, ts_uint ncmax1, ts_uint ncmax2, ts_uint ncmax3, ts_double stepsize);

ts_vesicle *create_vesicle_from_tape(ts_tape *tape);
ts_bool set_vesicle_values_from_tape(ts_vesicle *vesicle);

ts_bool initial_population_with_c0(ts_vesicle *vesicle, ts_tape *tape);
/** Sets the initial position of the vertexes to dipyramid
 *
 *      @param *vlist is a pointer to list of vertices
 *      @returns TS_SUCCESS on success, TS_FAIL otherwise
 */
ts_bool add_vertices_with_c0(ts_vesicle *vesicle, ts_int n, ts_double c0, ts_double w);

ts_bool pentagonal_dipyramid_vertex_distribution(ts_vertex_list *vlist);

/** Finds the neighbouring vertices and add them to a list of each vertex
@@ -27,7 +35,7 @@
//ts_bool init_vertex_neighbours(ts_vertex_list *vlist);

/** interior sites and their neighbours in circ. order + the triangles they are holding together */
ts_bool init_sort_neighbours(ts_vertex_list *vlist);
ts_vertex_list *init_sort_neighbours(ts_bond_list *blist,ts_vertex_list *vlist);
ts_bool init_vesicle_bonds(ts_vesicle *vesicle);
ts_bool init_triangles(ts_vesicle *vesicle);
ts_bool init_triangle_neighbours(ts_vesicle *vesicle);