Confinement planes, not debugged

Samo Penic

2018-09-23 267cf14b1ced6fce480e4292131a987a1802e28a

 src/general.h

@@ -156,7 +156,8 @@
        ts_double projArea;
        ts_double relR;
        ts_double solAngle;
   struct ts_poly *grafted_poly;
      struct ts_poly *grafted_poly;
      struct ts_cluster *cluster;
};
typedef struct ts_vertex ts_vertex;

@@ -284,8 +285,19 @@
   long int mcsweeps;
   long int quiet;
   long int shc;
   long int number_of_vertices_with_c0;
   ts_double c0;
   ts_double w;
   ts_double F;
   long int plane_confinement_switch;
   ts_double plane_d;
   ts_double plane_F;
} ts_tape;

typedef struct{
   ts_float z_max;
   ts_float z_min;
} ts_confinement_plane;



@@ -315,8 +327,25 @@
   ts_double R_nucleusY;
   ts_double R_nucleusZ;
   ts_double nucleus_center[3];
    ts_double area;
   ts_double area;
   ts_confinement_plane confinement_plane;
} ts_vesicle;



struct ts_cluster{
   ts_uint nvtx;
   ts_uint idx;
   ts_vertex **vtx;
};

typedef struct ts_cluster ts_cluster;

typedef struct{
   ts_uint n;
   ts_cluster **cluster;
} ts_cluster_list;




@@ -354,4 +383,5 @@
int createPidFile(const char *progName, const char *pidFile, int flags);

int lockRegion(int fd, int type, int whence, int start, int len);
char *libVersion();
#endif