Fixed most problems, some still persists.

Samo Penic

2019-10-19 201659654a328f84c229d16fe85d8709a4183957

 src/poly.c

@@ -126,7 +126,6 @@
                     m++;
                     if(m>1000) {
                        k=9999; //break also ot of the outer loop
                        printf("was here\n");
                        break;
                     }
                  }
@@ -159,6 +158,7 @@
   ts_uint gvtxi;
   ts_bool retval;
   ts_double dphi,dh;

   cell_occupation(vesicle); //needed for evading the membrane
   // Grafting polymers:
   int tries=0;
@@ -242,9 +242,9 @@

ts_bool poly_free(ts_poly *poly){

   if (poly->grafted_vtx!=NULL){
      poly->grafted_vtx->grafted_poly=NULL;
   }
//   if (poly->grafted_vtx!=NULL){
//      poly->grafted_vtx->grafted_poly=NULL;
//   }
   vtx_list_free(poly->vlist);
   bond_list_free(poly->blist);
   free(poly);
@@ -254,8 +254,9 @@

ts_bool poly_list_free(ts_poly_list *poly_list){
   ts_uint i;

   //fprintf(stderr,"no. of polys=%d\n", poly_list->n);
   for(i=0;i<poly_list->n;i++){
   //   fprintf(stderr,"%d poly address in mem=%ld\n",i+1,(long)&(poly_list->poly[i]));
      poly_free(poly_list->poly[i]);
   }
   free(poly_list->poly);
@@ -302,3 +303,15 @@
   return TS_SUCCESS;
}



ts_poly_list *init_empty_poly_list(ts_uint n_poly, ts_uint n_mono){
   ts_poly_list *poly_list=(ts_poly_list *)calloc(1,sizeof(ts_poly_list));
   poly_list->poly=(ts_poly **)calloc(n_poly,sizeof(ts_poly *));
   ts_uint i;
   for (i=0; i<n_poly;i++){
      poly_list->poly[i]=init_poly(n_mono, NULL);
   }
   poly_list->n = n_poly;
   return poly_list;
}