Vertex tainting done

Samo Penic

2013-11-05 200815edf1548d444aa3b5db908a1628adeb2a05

 src/timestep.c

@@ -5,28 +5,63 @@
#include "general.h"
#include "timestep.h"
#include "vertexmove.h"
#include "bondflip.h"
#include "frame.h"
#include "vertex.h"
#include "io.h"
ts_bool run_simulation(ts_vesicle *vesicle, ts_uint mcsweeps, ts_uint inititer, ts_uint iterations){
   ts_uint i, j;

   centermass(vesicle);
   cell_occupation(vesicle);
   ts_fprintf(stdout, "Starting simulation (first %d x %d MC sweeps will not be recorded on disk)\n", inititer, mcsweeps);
   for(i=0;i<inititer+iterations;i++){
      for(j=0;j<mcsweeps;j++){
         single_timestep(vesicle);
      }
      centermass(vesicle);
      cell_occupation(vesicle);
      if(i>inititer){
         write_vertex_xml_file(vesicle,i-inititer);
      }
   }
   return TS_SUCCESS;
}

ts_bool single_timestep(ts_vesicle *vesicle){
    ts_bool retval;
    ts_double rnvec[3];
    ts_uint i;
    ts_uint i, b;
    for(i=0;i<vesicle->vlist->n;i++){
        rnvec[0]=drand48();
        rnvec[1]=drand48();
        rnvec[2]=drand48();
   vertex_taint(vesicle->vlist->vtx[i],1);
//      ts_fprintf(stdout, "Vertex %d should be tainted, level=%d.\n", i, vesicle->vlist->vtx[i]->locked);
   if(vertex_tainted(vesicle->vlist->vtx[i],1,1)){
      ts_fprintf(stdout, "Vertex %d tainted, level=%d. Waiting....\n", i, vesicle->vlist->vtx[i]->locked);
      while(vertex_tainted(vesicle->vlist->vtx[i],1,1));
   }
        retval=single_verticle_timestep(vesicle,vesicle->vlist->vtx[i],rnvec);
   vertex_untaint(vesicle->vlist->vtx[i],1);
//      ts_fprintf(stdout, "Vertex %d should be untainted, level=%d.\n", i, vesicle->vlist->vtx[i]->locked);
    }

    for(i=0;i<vesicle->blist->n;i++){
        rnvec[0]=drand48();
//   ts_int cnt=0;
    for(i=0;i<vesicle->vlist->n;i++){
//why is rnvec needed in bondflip?
/*        rnvec[0]=drand48();
        rnvec[1]=drand48();
        rnvec[2]=drand48();
*/ 
   b=rand() % vesicle->blist->n;
        //find a bond and return a pointer to a bond...
        //call single_bondflip_timestep...
//        retval=single_bondflip_timestep(vesicle,&vesicle->blist.bond[i],rnvec);
        
        retval=single_bondflip_timestep(vesicle,vesicle->blist->bond[b],rnvec);
//   if(retval==TS_SUCCESS) cnt++;        
    } 

//   printf("Bondflip success rate in one sweep: %d/%d=%e\n", cnt,vesicle->blist->n,(double)cnt/(double)vesicle->blist->n);
   if(retval);
    return TS_SUCCESS;
}