Trisurf Monte Carlo simulator
Samo Penic
2016-05-15 08d2f85fef9e58d9f4fd3e787e7a950f9007fdb4
src/tape
@@ -1,6 +1,6 @@
####### Vesicle definitions ###########
# nshell is a number of divisions of dipyramid
nshell=17
nshell=5
# dmax is the max. bond length (in units l_min)
dmax=1.7
# dmin_interspecies in the min. dist. between different vertex species (in units l_min)
@@ -16,9 +16,16 @@
# pressure difference: p_inside - p_outside (in units kT/l_min^3):
pressure=0.0
#Constant volume constraint (0 disable constant volume, 1 enable wiht additional vertex move, 2 enable with epsvol)
constvolswitch=2
constvolprecision=1e-14
#Constant area constraint (0 disable constant area, 2 enable constant area with epsarea)
constareaswitch=2
####### Polymer (brush) definitions ###########
# npoly is a number of polymers attached to npoly distinct vertices on vesicle
npoly=0
npoly=2
# nmono is a number of monomers in each polymer
nmono=10
# Spring constant between monomers of the polymer
@@ -44,15 +51,19 @@
####### Program Control ############
#how many MC sweeps between subsequent records of states to disk
mcsweeps=250
#200000
mcsweeps=20
#how many initial mcsweeps*inititer MC sweeps before recording to disk?
#2
inititer=0
#how many records do you want on the disk iteration are there in a run?
iterations=15000
#10000
iterations=100
###### Spherical harmonics ###########
spherical_harmonics_coefficients=15
# If 0 then spherical harmonics are not calculated at all.
spherical_harmonics_coefficients=21
#shut up if we are using cluster!!!
quiet=false